биомолекула.ру. Взгляд изнутри.
 

Логин:
Пароль:


Геном, собранный вручную

[26 января, 2008 г.]

В институте Крейга Вентера сделали работу, которая непременно войдет в историю молекулярной биологии. Коллектив ученых под руководством Гамильтона Смита собрал из химически синтезированных фрагментов целый функциональный геном живого организма.

Организм, генетический материал которого исследователям удалось получить методами биохимии и генной инженерии, конечно, невелик и не очень сложно организован. Это бактерия, да еще и болезнетворная — Mycoplasma genitalium. Однако метод, предложенный коллективом под руководством Гамильтона Смита (Hamilton Smith), очевидно позволит в будущем эффективнее создавать микроорганизмы с заданными свойствами.

Даная работа проходила в несколько этапов. Сначала были синтезированы отдельные «кассеты», состоящие из нуклеотидов ДНК. Длиной эти фрагменты были от 5 до 7 тысяч нуклеотидных пар и частично перекрывали друг друга по последовательности. Затем из полученных кусков путем рекомбинации создавали более протяженные фрагменты, которые уже составляли от 1/8 до 1/4 всего генома бактерии.

Крупные последовательности были клонированы и секвенированы для того, чтобы проверить точность соединения более мелких кусков. Финальный этап работы был проделан с использованием дрожжей Saccharomyces cerevisiae, которые были необходимы для того, чтобы поместить в них полученные фрагменты, где они могли опять же в результате рекомбинации сформировать целый геном. После такой манипуляции, которую исследователи называют рекомбинацией, сопряженной с трансформацией (transformation-associated recombination или TAR), были выделены и идентифицированы клоны, содержащие корректную последовательность генома микоплазмы, состоящего из 582970 нуклеотидных пар.

Любопытно, что исследователи сделали геном бактерии несколько модифицированным. Они заблокировали ген MG408, который необходим микроорганизму для заражения клеток млекопитающих, а также внедрили в межгенные участки некоторое количество специальных маркеров, отличающих полученный геном от «естественного».

Mycoplasma genitalium является своего рода «минимальным организмом», поскольку обладает самым маленьким геномом из всех не вирусных живых систем. Геном этого организма содержит информацию о структуре всего 485 белков, которых, оказывается, достаточно для нормального функционирования клеток.

По материалам новостей Nature.

Оригинальная публикация: Daniel G. Gibson, Gwynedd  A. Benders, Cynthia Andrews-Pfannkoch, Evgeniya  A. Denisova, Holly Baden-Tillson, Jayshree Zaveri, Timothy  B. Stockwell, Anushka Brownley, David  W. Thomas, Mikkel  A. Algire, Chuck Merryman, Lei Young, Vladimir  N. Noskov, John  I. Glass, J. Craig Venter, Clyde  A. Hutchison III, Hamilton  O. Smith. (2007). “Complete Chemical Synthesis, Assembly, and Cloning of a Mycoplasma genitalium Genome”. Science Express, 24 January 2008.

См. также: биомолекула: «Смыслы „жизни“».

Автор: Стефанов Юрий.

Число просмотров: 342.

Вернуться в раздел «Новости»

Комментарии

(Оставить комментарий) (показывать сначала старые комментарии)

Re: Геном, собранный вручную

Людмила Белик — 30 июля, 2010 г. 09:57. (ссылка)

Разочарую - любя вас всех и ВСЕЯ . Пока не поздно - потребуйте все вместе ПРОВЕРИТ качество вот этих "бяк" - сурово ядерных насквозь да так , что вымрут и все и всея . Там самая варварская АНТИСТАТИКА - деформирующая единство .
Если хоть кто-то благоразумный ? Вот эта гадость , скомпонованная из самой смерти и есть СМЕРТЬ всея - уже не только всей бионики , а духо-вида .
Сжимание в ком с почти мгновенным разжиманием в тысячу раз объёмнее пусть проверят ультрафизики (НЕ кругляковцы) приборами астрофизиков .
Смешно же РЕКЛАМИРОВАТЬ - НЕ ПРОВЕРЯЯ .

(ответить)

Re: Геном, собранный вручную

Ишкин Александр — 31 января, 2008 г. 17:30. (ссылка) (свернуть ветвь)

Да, "водяные знаки" в геноме Mycoplasma уже выявили: http://blog.wired.com/wiredscience/2008/01/venter-institut.html

(ответить)

Re: Re: Геном, собранный вручную

Чугунов Антон — 31 января, 2008 г. 20:57. (ссылка) (свернуть ветвь)

У тех, кто работает с разным «нано», это уже стало хорошим тоном: ай-би-эм или интел, когда отрабатывают новые литографические процессы или испытывают новые атомно-силовые микроскопы, обязательно оставляют наноскопические автографы на кремниевых пластинах.

(ответить)

Re: Re: Re: Геном, собранный вручную

Ишкин Александр — 31 января, 2008 г. 21:04. (ссылка)

У материаловедов вообще больше возможностей для самовыражения на наноуровне. Наномашинки там, наноунитаз я недавно видел. А биологам остаются текстовые послания на настоящий момент)

(ответить)

Re: Геном, собранный вручную

Степанов Артем — 26 января, 2008 г. 23:54. (ссылка) (свернуть ветвь)

а вот тут http://www.timesonline.co.uk/tol/comment/columnists/guest_contributors/article3254111.ece
говорится, что это не такой большое открытие - although the synthesis of the DNA of M. genitalium represents a technical tour de force it represents no fundamental breakthrough, biologically. (хотя синтезирование ДНК M. genitalium является проявлением технологической искусности, оно не является фундаментальным прорывом с биологической точки зрения)

(ответить)

Re: Re: Геном, собранный вручную

Натальин Павел — 27 января, 2008 г. 00:05. (ссылка)

Нет, совсем не так. (Но все к этому идет.) Были нуклеотиды, из них по кускам собрали геном бактерии. До этого тоже синтезировали геном(ы), но мелкие, вирусные. То была революция. Просто раньше самый крупный кусок был 32 Кб, а сейчас - 582.

(ответить)

Re: Re: Геном, собранный вручную

Дмитрий Равчеев — 27 января, 2008 г. 00:02. (ссылка)

Пока получился не организм, а только его геном. Еще не революция, но уже активные революционные выступления.

(ответить)

Яндекс.Метрика

© 2007–2015 «биомолекула.ру»
Электропочта: info@biomolecula.ru
О проекте · RSS · Сослаться на нас

Дизайн и программирование —
Batch2k15.

Сопровождение сайта — НТК «Биотекст».

Условия использования сайта
Об ошибках сообщайте вебмастеру.