биомолекула.ру. Взгляд изнутри.
 

Логин:
Пароль:


Геном Нобелевского лауреата Джеймса Уотсона скоро будет расшифрован

[4 апреля, 2007 г.]

Ученые, работающие над расшифровкой «Знаменитого генома», столкнулись с проблемой приватности получаемой информации.

Одна компания в США начала сообщать кое-какую информацию об исследовании, известном как «Проект Джим», и представляющем собой напряженную попытку полной расшифровки генома отдельно взятого человеческого индивидуума. Результаты исследования, вероятно, станут достоянием общественности этим летом. Об анонимности исследуемого материала не может быть и речи — давно было объявлено, что геном принадлежит Джеймсу  Д. Уотсону, Нобелевскому лауреату и одному из первооткрывателей структуры ДНК.

Уотсон не не единственный человек, чей геном будет расшифрован. Медицинский факультет Гарварда утвердил план Джорджа Чёрча (George Church), специалиста по вычислительной генетике. План заключается в определении последовательности ДНК геномов хорошо осведомленных добровольцев, включая самого ученого. Более того, Крэйг Вентер (J. Craig Ventеr) сообщил, что и его некоммерческий институт скоро выпустит полную версию его собственного генома. (Вентер предоставил бόльшую долю ДНК, использовавшейся его компанией Celera Genomics для расшифровки генома человека в 2000 году, в остальном взятую из анонимных источников.) Все эти проекты добавили остроты в старый спор: что составляет информацию «деликатного свойства» в конкретном геноме, и как эта информация должна охраняться? По мере того, как цена расшифровки ДНК отвесно падает, все больше и больше людей будет сталкиваться с подобными вопросами.

Уотсон, которому сейчас 79 лет, дал согласие на расшифровку своего генома два года назад, когда он предоставил образец своей крови компании 454 Life Sciences в Брэдфорде, штат Коннектикут. Его причина проста: «мне любопытна моя жизнь». Уотсон считает, что в целом выиграет, если люди прочтут его геном.

Компания 454 Life Sciences имеет в своем распоряжении технологию «повторной расшифровки», которая использует уже известные последовательности генома человека в качестве лекала. Опираясь на массированную репликацию ДНК и компьютеризованную сортировку прочитанных фрагментов, технология позволяет значительно снизить стоимость всего процесса. Компания не прочь похвалиться свой удалью. Майкл Эгхольм (Michael Egholm), вице-президент 454 Life Sciences по исследованиям и разработкам, в телефонном интервью сообщил, что «основная мечта компании — сделать рутинную расшифровку человеческих геномов доступной». 454 — одна из нескольких фирм, наперегонки осваивающих эту территорию. Со слов Эгхольма, штат компании активно обсуждал, кто должен стать первым человеком, геном которого будет расшифрован. После ужина со своими советниками по науке, включая ученого с большим опытом в расшифровке ДНК Ричарда Гиббса (Richard Gibbs), работники компании решили, что первым должен быть Уотсон, который не только принял предложение, но и рассказал об этом журналистам.

Когда проект только начался, оборудование в 454 еще не соответствовало его задачам. Но улучшение технологии сделало возможным в начале этого года прочтение 10 миллиардов оснований многократно перекрывающихся фрагментов ДНК Уотсона «в пределах нескольких недель». Эгхольм и его партнеры из академической среды уже обсудили предварительные результаты в феврале на специальной конференции на острове Марко во Флориде. Согласно Эгхольму, сравнение полученных последовательностей со «справочным» человеческим геномом, размещенном в общедоступных базах данных, позволяет предположить, что «справочный геном» завершен примерно на 97%. Геном Уотсона, в свою очередь, на настоящий момент прочтен три раза. Руководство компании и Ричард Гиббс, возглавляющий центр расшифровки ДНК в медицинском колледже Бэйлора в Хьюстоне, предполагают, что потребуется еще несколько недель работы, прежде чем будет достигнуто шестикратное прочтение, достаточное для «диплоидного генома очень хорошего качества». Стоимость проекта «около 1 миллиона долларов».

Между тем, до сих пор не ясно, что конкретно выдаст данный проект. Уотсон согласился, чтобы последовательность его ДНК была добавлена в общедоступные базы данных. Однако он с самого начала потребовал, чтобы статус гена ApoE — по которому можно судить о риске заболевания болезнью Альцгеймера — был сокрыт. Эгхольм сообщил, что работники в 454 позже осознали, что может понадобиться засекретить гораздо больше, возможно, все генетические локусы, как-то связанные на сегодня с риском различных заболеваний. Если же блокировать только варианты последовательности ДНК, связанные с высоким риском того или иного заболевания, то это будет сигнал, что Уотсон имеет эти варианты. Другая проблема: то, что сегодня считается безвредным, завтра может оказаться связанным с болезнью — есть о чем беспокоиться сыновьям Уотсона.

Гиббс и Эми Мак-Гвайр (Ami McGuire), специалист по этике из Бэйлорского центра медицинской этики и политики здравоохранения, подготовили и предоставили на рассмотрение Совета колледжа проект расшифровки индивидуального генома (без упоминания Уотсона). Первым шагом было получение более конкретного разрешения, которое было получено. Совет окончательно утвердил проект 19 марта. Однако, по словам Мак-Гвайр, общественные организации почти не помогали им при решении вопросов, касающихся приватности и разрешения со стороны родственников.

Ученые из Бэйлора и компании 454 Life Sciences выбрали «путь раскрытия полученных данных». Они собираются скинуть законченный геном на DVD и передать его Уотсону, возможно, устроив при этом небольшую церемонию. Уотсон возьмет на себя ответственность за обсуждение в кругу своей семъи риска, связанного с выпуском своего генома. Он и будет решать, что должно быть сокрыто, и определять, как и когда сделать последовательность общедоступной. Уотсон отказался добавить что-нибудь сверх этого, до тех пор, пока компания не опубликует статью; как он полагает, это произойдет не позже июля.

Что же касается Вентера, то он сообщил, что намерен просто выложить весь свой геном без каких-либо ограничений.

Перевод с английского, материал Marshall, E., Science.

Автор: Натальин Павел.

Число просмотров: 434.

Вернуться в раздел «Новости»

Комментарии

(Оставить комментарий) (показывать сначала старые комментарии)

Не прошло и двух месяцев

Чугунов Антон — 9 июня, 2007 г. 15:09. (ссылка)

Что же, очень быстро фирма «454» справилась с расшифровкой генома Уотсона, менее чем через два месяца после начала проекта вручив ему DVD-диск с собственной генетической информацией (дело было 6 июня).
Интересно, что он теперь с этим диском делать будет?..

(ответить)

Чугунов Антон — 21 апреля, 2007 г. 12:18. (ссылка)

Кстати, такая развивающаяся область как геномика личности (см. например «Химию и Жизнь», № 3, 2007 — «Многомерная биология и многомерная медицина»), говорит нам, что «украсть» из нашего генома можно будет не только предрасположенность к тем или иным заболеваниям, но и многие черты нормальной физиологии, например, определяющие характеристики характера.

«Сегодня к генетически детерминированным личностным особенностям относят уровень интеллекта, самостоятельность и зависимость, активность и пассивность, мнительность и тревожность, экстравертность и интровертность, чувствительность или толерантность к стрессам, альтруизм и эгоизм, агрессивность и сексуальность.»


Вообще, многие говорят о наступлении эпохи «Омиков» (“…omics”) в биологии и о расцвете дополняющих друг друга геномики, транскриптомики, РНомики, метаболомики, фармакогеномики, нутриномики и биоинфорномикиматики, массивно-параллельные
результаты каждой из которых составят уникальный «профиль» человека и заболевания…

(ответить)

Не надо обижать миссис Хадсон

Полянский Антон — 20 апреля, 2007 г. 22:55. (ссылка) (свернуть ветвь)

Если даже геном шимпанзе отличается от генома человека не на многие проценты, то что же такого особенного можно найти в геноме престарелого доктора Ватсона?

(ответить)

Ковалевский Анатолий — 20 апреля, 2007 г. 23:01. (ссылка)

Романтики надеются, что удастся найти ген гениальности (в крайнем случае - комплекс генов), а потом подсадить себе... наверное.

(ответить)

Жжот доктор Уотсон

Натальин Павел — 6 апреля, 2007 г. 00:00. (ссылка) (свернуть ветвь)

???????? ?????????? ???? ?????? ??????, ???? ???????.

(ответить)

Чугунов Антон — 6 апреля, 2007 г. 21:32. (ссылка)

Молоде-е-ее-ц! Бравис-си-и-имоо! ;)

(ответить)

Ковалевский Анатолий — 6 апреля, 2007 г. 00:00. (ссылка)

Вряд ли здесь дело в честолюбии. Он-то как раз рискует (конечно меньше, чем молодой человек), но тем не менее. Об этом говорит хотя бы скрытие информации о гене ApoE, а ведь есть ещё куча других генов, которые являются "маркерами" онкологических процессов. Однако в условиях доступа к данным и повсеместного data-майнинга вполне может найтись доброхот, который эту информацию раскопает.

(ответить)

Яндекс.Метрика

© 2007–2015 «биомолекула.ру»
Электропочта: info@biomolecula.ru
О проекте · RSS · Сослаться на нас

Дизайн и программирование —
Batch2k15.

Сопровождение сайта — НТК «Биотекст».

Условия использования сайта
Об ошибках сообщайте вебмастеру.