биомолекула.ру. Взгляд изнутри.
 

Логин:
Пароль:


Белки в формате MP3

[4 мая, 2007 г.]

Красивыми трехмерными изображениями молекул белков вряд ли уже кого-нибудь сегодня удивишь. А как на счет того, чтобы послушать понравившуюся «аминокислотную тему»? Группе калифорнийских ученых удалось предложить алгоритм, позволяющий конвертировать аминокислотные последовательности в мелодии, вполне приемлемые для восприятия.

Идеи представить последовательность ДНК и белков в виде партитуры возникли еще в 80-х годах прошлого века. Например, последовательность нуклеотидов пытались напрямую представить в виде трех нот: А (ля) — аденин, С (до) — цитозин, G (соль) — гуанин, а для аминокислот использовали целых двадцать (2.5 октавы). В первом случае, мелодия была абсолютно лишена информативности, а во втором получалась жуткая какофония из-за частых скачков между октавами.

Рай Такахаши (Rie Takahashi) и Джефри Миллер (Jeffrey Miller) из Калифорнийского университета пошли по другому пути. Для аминокислот вместо нот они использовали трезвучные диатонические аккорды (всего 13). Причем, для пар близких по свойствам аминокислот (Leu-Ile, Asn-Gln и т.д.) использовался один и тот же аккорд, но с разной тоникой (прямой — основная нота самая низкая по звучанию, обращенный — самая высокая). Чтобы задать ритм в «аминокислотной мелодии», длительность каждого аккорда (целая, половинная, четвертная, восьмая) определялась в соответствии со встречаемостью соответствующего кодона (триплета нуклеотидов, кодирующих аминокислоту) в ДНК-последовательности человека. В итоге для разных белков получаются достаточно «адекватные» и запоминающиеся мелодии.

По мнению авторов, такое музыкальное представление «…сделает кодирующие последовательности генома более доступными для широкой публики, детей и исследователей, лишенных зрения»

Заинтересовавшиеся могут послушать некоторые белковые молекулы в формате MP3, или попробовать себя в качестве «белкового композитора».

Источник: Genome Biology, Science.

Автор: Полянский Антон.

Число просмотров: 125.

Вернуться в раздел «Новости»

Комментарии

(Оставить комментарий) (показывать сначала старые комментарии)

Re: Белки в формате MP3

Мартенова Анастасия — 15 ноября, 2007 г. 12:21. (ссылка)

ДНК действительно издает звуки, познав, истинные ноты … Данная работа просто развлечение.

(ответить)

Re: Белки в формате MP3

Старокадомский Петр — 9 августа, 2007 г. 12:55. (ссылка)

Странно, а почему тимин или урацил нотами обделили?

(ответить)

Оперативно откликнулся

Натальин Павел — 4 мая, 2007 г. 12:18. (ссылка) (свернуть ветвь)

Грустные мелодии такие...

он уже три недели как без работы
сидит дома, в банках выращивает грибы
слушает даб, минимал-техно и белки в формате мп3
почти ничего не ест
ко всем любимым занятиям потерял интерес

(ответить)

5+ — если бы ещё и на музыку положить, то было бы гораздо веселее, чем то, что получилось у авторов с их «электронной» тягомотиной.

(ответить)

Недолго мучиццо осталось нам, друзья: скоро будет новая версия системы комментирования, защищённая от глюков со стиранием!

(ответить)

Ковалевский Анатолий — 18 мая, 2007 г. 09:52. (ссылка)

Если ещё и редактировать то, что ты написал можно будет, то это вообще верх счастья настанет

(ответить)

Полянский Антон — 5 мая, 2007 г. 16:22. (ссылка)

Судьба и правда нелегка,
Пора послушать ДНК! -)

(ответить)

Яндекс.Метрика

© 2007–2015 «биомолекула.ру»
Электропочта: info@biomolecula.ru
О проекте · RSS · Сослаться на нас

Дизайн и программирование —
Batch2k15.

Сопровождение сайта — НТК «Биотекст».

Условия использования сайта
Об ошибках сообщайте вебмастеру.