Первая Летняя школа по биоинформатике: отчет

Отличительной чертой школы стала ее междисциплинарность — организаторы объединили на одной образовательной площадке биологов и технических специалистов. Каждый из участников смог получить знания, которые требовались именно ему — программа была рассчитана на разные уровни подготовки. Совместные лекции позволили изучить наиболее актуальные вопросы биоинформатики, а работа в параллельных потоках помогла освоить базовые знания из непрофильных дисциплин. Например, программисты ознакомились с введением в молекулярную биологию, биологи — начали программировать.

В первый день школа открылась выступлением ключевых спикеров:

• «Биоинформатические подходы к изучению микроэволюции» — Алексей Кондрашов (University of Michigan, МГУ);
• «Генетическое репрограммирование соматических клеток: что нам дает биоинформатика» — Сергей Киселев (ИОГен РАН);
• «Sequencing the Human genome as a tool for refinement of some anthropological and historical hypotheses» — Егор Прохорчук (Центр «Биоинженерия» РАН);
• «Molecular features of human brain evolution» — Филипп Хайтович (Shanghai Institutes for Biological Sciences).

За остальные дни программа школы смогла охватить широкий спектр вопросов: от анализа данных секвенирования геномов и транскриптомов до особенностей репрограммирования соматических клеток, от обзора биотехнологий до этапов развития мозга, а также от основ программирования и молекулярной биологии до анализа регуляции генов. C более подробным расписанием школы и информацией о спикерах можно ознакомиться здесь. Кроме того, на сайте школы уже сейчас доступно большинство презентаций, а к концу сентября к материалам добавятся видеозаписи лекций.

В результате основные задачи, которые ставили перед собой организаторы, были выполнены. Школа поспособствовала популяризации наиболее перспективных областей биоинформатики и дала ее участникам возможность получить знания соразмерно с их текущей компетентностью. Кроме того, сообщество биоинформатиков пополнили новые умы из различных уголков России. В следующем году организаторы планируют продолжить похожие образовательные инициативы, совместив их с петербургскими белыми ночами.

Организаторы выражают благодарность всем участникам и спикерам, а также партнерам школы: Фонду некоммерческих программ «Династия», Российской Венчурной компании, Российскому фонду фундаментальных исследований, компании JetBrains, компании BIOCAD, компании «Диаэм» и компании Life Technologies.

Отдельно организаторы хотели бы поблагодарить тех, кто поддержал проект школы на платформе Boomstarter. Летняя школа по биоинформатике стала одним из первых успешных российских экспериментов по сбору средств на научно-образовательные проекты в формате краудфандинга.

Программный комитет

• Николай Вяххи (СПбАУ РАН)
• Михаил Гельфанд (ИППИ РАН, МГУ)
• Александр Куликов (ПОМИ РАН)
• Алла Лапидус (Центр геномной биоинформатики СПбГУ, СПбАУ РАН)
• Павел Певзнер (University of California San Diego, СПбАУ РАН)
• Андрей Пржибельский (Лаборатория алгоритмической биологии СПбАУ РАН)

Организационный комитет

• Екатерина Чайкина — общая координация школы, вопросы сотрудничества
• Николай Вяххи — научная программа школы
• Анна Черныш — проживание, логистика, взаимодействие с контрагентами
• Михаил Райко — координатор мини-конференции
• Андрей Пржибельский — координатор NGS секции
• Ярослав Баранов
• Кирилл Григорьев

Организаторы школы:

Институт биоинформатики, Санкт-Петербургский Академический университет РАН, Институт проблем передачи информации РАН, Факультет биоинженерии и биоинформатики МГУ, программа GameChangers.