https://biomolecula.ru/notices/kraudfanding-na-kalendar
Подписаться

Белки в формате MP3

  • 145
  • 0,4
  • 7
  • 0
Добавить в избранное
Новость
Аминокислотная последовательность, записанная в виде музыкальных аккордов, позволяет по-новому «взглянуть» на белковую молекулу. © Jupiter Images.
Красивыми трехмерными изображениями молекул белков вряд ли уже кого-нибудь сегодня удивишь. А как на счет того, чтобы послушать понравившуюся «аминокислотную тему»? Группе калифорнийских ученых удалось предложить алгоритм, позволяющий конвертировать аминокислотные последовательности в мелодии, вполне приемлемые для восприятия.

Идеи представить последовательность ДНК и белков в виде партитуры возникли еще в 80-х годах прошлого века. Например, последовательность нуклеотидов пытались напрямую представить в виде трех нот: А (ля) — аденин, С (до) — цитозин, G (соль) — гуанин, а для аминокислот использовали целых двадцать (2.5 октавы). В первом случае, мелодия была абсолютно лишена информативности, а во втором получалась жуткая какофония из-за частых скачков между октавами.

Рай Такахаши (Rie Takahashi) и Джефри Миллер (Jeffrey Miller) из Калифорнийского университета пошли по другому пути. Для аминокислот вместо нот они использовали трезвучные диатонические аккорды (всего 13). Причем, для пар близких по свойствам аминокислот (Leu-Ile, Asn-Gln и т.д.) использовался один и тот же аккорд, но с разной тоникой (прямой — основная нота самая низкая по звучанию, обращенный — самая высокая). Чтобы задать ритм в «аминокислотной мелодии», длительность каждого аккорда (целая, половинная, четвертная, восьмая) определялась в соответствии со встречаемостью соответствующего кодона (триплета нуклеотидов, кодирующих аминокислоту) в ДНК-последовательности человека. В итоге для разных белков получаются достаточно «адекватные» и запоминающиеся мелодии.

По мнению авторов, такое музыкальное представление «…сделает кодирующие последовательности генома более доступными для широкой публики, детей и исследователей, лишенных зрения»

Заинтересовавшиеся могут послушать некоторые белковые молекулы в формате MP3, или попробовать себя в качестве «белкового композитора».

Источник: Genome Biology, Science.

Комментарии