Nature #534 (7608) + онлайны: заразный рак моллюсков, максимально глубокое секвенирование и вирус, ухудшающий память

• Нейробиология. Некоторые вирусные инфекции — например, заражение вирусом Западного Нила — приводят к нарушению памяти. Выяснилось, что этот вирус заставляет микроглию и компоненты системы комплемента разрушать синапсы. Интересно, что похожие процессы, управляемые самим организмом, происходят и в раннем развитии нервной системы человека. — A complement—microglial axis drives synapse loss during virus-induced memory impairment.
• Вирусология. Ученые из Стэнфорда провели масштабный скрининг факторов, которые необходимы вирусу Денге и вирусу гепатита С, чтобы успешно заражать клетки человека. Для первого оказалось критичным присутствие олигосахарилтрансферазного комплекса, который необходим для правильной длительности стадий вирусного размножения. А для вируса гепатита С более ожидаемым образом самыми важными оказались вирусные рецепторы и белки, связывающиеся с РНК. Еще для этого вируса почему-то критичен уровень молекул FAD. — Genetic dissection of Flaviviridae host factors through genome-scale CRISPR screens.
• Вирусология. Похожее исследование флавивирусов, к которым относятся упомянутые вирус Денге и вирус гепатита С, нашло еще один жизненно важный для них белковый комплекс — сигнальной пептидазы. Он необходим для разрезания вирусных белков в правильных местах, а также для секреции готовых вирусных частиц. — A CRISPR screen defines a signal peptide processing pathway required by flaviviruses.
• Структурка. Опубликована полученная методом крио-электронной микроскопии структурка комплекса актина с миозином. — Cryo-EM structure of a human cytoplasmic actomyosin complex at near-atomic resolution.
• Иммунология. Иногда пациентам с ВИЧ необходимо прерывать комбинированную анти-ретровирусную терапию — например, для того, чтобы бороться с побочными эффектами. Вирус при этом быстро начинает отвоевывать свои позиции. В новой статье описываются антитела к ВИЧ, которые помогают отсрочить возвращение болезни, пока пациент прервал комбинированную терапию. — HIV-1 antibody 3BNC117 suppresses viral rebound in humans during treatment interruption.
• Молекулярка. Цереблон — белок, участвующий в образовании убиквитин-лигазного комплекса, и способный отправлять на переработку другие белки. Модуляторы активности этого белка влияют на его специфичность. В Nature пишут об открытии нового модулятора цереблона, обладающего мощным противопухолевым эффектом. — A novel cereblon modulator recruits GSPT1 to the CRL4^CRBN ubiquitin ligase.
• Молекулярка. Иногда, даже если известна причина развития рака, на нее нельзя повлиять напрямую. Например, при аденокарциноме легкого прогноз ухудшается при мутации белка KRAS, но сам этот белок плохо поддается ингибированию. Поэтому разрабатывают методы подавления активности тех белков, на которые действует KRAS, и об одном из таких методов рассказывается в новой статье. — A combinatorial strategy for treating KRAS-mutant lung cancer.
• Рак. Недавно заразный рак, помимо тасманийских дьяволов и собак, нашли еще и у моллюсков. Новое исследование нескольких видов двустворчатых моллюсков обнаружило у них несколько линий заразного рака, в том числе и переданных от одного вида другому. — Widespread transmission of independent cancer lineages within multiple bivalve species.
• Методика. Представлен метод максимально глубоко секвенирования, позволяющий обнаружить очень редкие мутации. Благодаря новому методу можно исследовать такие тонкие вещи, как время жизни мутаций, которые подвергаются репарации. — Rates and mechanisms of bacterial mutagenesis from maximum-depth sequencing.
• Молекулярка. После репликации ДНК в клетке становится в два раза больше хроматина, и его организация должна измениться. До сих пор было неизвестно, какие механизмы позволяют клетке различать участки до- и после-репликативного хроматина на локальном уровне. В новой работе описывается белковый комплекс, который умеет отличать гистоны без определенной метки, которые встраиваются в свежереплицированную ДНК. — H4K20me0 marks post-replicative chromatin and recruits the TONSL—MMS22L DNA repair complex.

Science #352 (6293) + онлайны: различия клеток нервного гребня, уничтожение митохондрий сперматозоидов и микробы для полноценного питания

• Микробиология. Из-за недостаточного питания в раннем возрасте у детей нарушается развитие скелета, иммунной системы и интеллектуальных способностей. Чтобы питание было достаточным, ребенку нужно не только хорошо есть, ему нужно еще иметь здоровый кишечник и правильную микрофлору. Новый обзор посвящен связи недостаточного питания и нарушенной микрофлоры. — Childhood undernutrition, the gut microbiota, and microbiota-directed therapeutics.
• Микробиология. Описан еще один механизм, который регулирует совместную жизнь эпителия кишечника и микрофлоры. В ответ на специфические молекулы, выделяемые бактериями, бокаловидные клетки начинают синтез компонентов слизи. — A sentinel goblet cell guards the colonic crypt by triggering Nlrp6-dependent Muc2 secretion.
• Структурка. Большинству киназ для нормальной работы необходим шаперон Hsp90 и его вспомогательный белок Cdc37. Структурка комплекса этих белков с киназой Cdk4 позволят предположить, как шаперон помогает киназам работать, и почему он нужен не всем киназам. — Atomic structure of Hsp90-Cdc37-Cdk4 reveals that Hsp90 traps and stabilizes an unfolded kinase.
• Молекулярка, биология развития. Нервный гребень — интересная часть эмбриона, клетки которой разбредаются по зародышу и идут по очень непохожим путям развития — одни участвуют в формировании челюстей, другие в формировании нервных окончаний, третьи становятся пигментными клетками. В новом исследовании описываются транскрипционные факторы, которые различают клетки нервного гребня на молекулярном уровне. — Reprogramming of avian neural crest axial identity and cell fate.
• Биология развития. Всего один ген, NKX3.1, необходимо включить в клетках эпителия семенных пузырьков, чтобы они превратились в клетки простаты. — Identification of an NKX3.1-G9a-UTY transcriptional regulatory network that controls prostate differentiation.
• Методика, нейробиология. Разработан метод секвенирования РНК не просто из одной клетки, а только из ее ядра. Оказывается, по ядерной РНК можно различить нейроны, происходящие из разных частей мозга. — Neuronal subtypes and diversity revealed by single-nucleus RNA sequencing of the human brain.
• Молекулярка. С помощью молекулярной эволюции удалось получить обратную транскриптазу с опцией проверки ошибок. Такой способностью обладают только природные ферменты, синтезирующие ДНК на базе другой ДНК, но не на базе РНК. — Synthetic evolutionary origin of a proofreading reverse transcriptase.
• Биология развития, клеточная биология. Митохондрии наследуются только по материнской линии, и митохондрии сперматозоидов после оплодотворения быстро разрушаются. Это критично для нормального развития эмбрионов — если уничтожение отцовских митохондрий откладывается, повышается вероятность гибели зародыша. Новая работа показывает, что для своевременного запуска уничтожения митохондрий сперматозоидов необходима эндонуклеаза CPS-6. После оплодотворения она перемещается из межмембранного пространства митохондрий в матрикс и начинает разрушать ДНК митохондрий. — Mitochondrial endonuclease G mediates breakdown of paternal mitochondria upon fertilization.
• Биология развития, нейробиология. Микроглия — вспомогательные клетки нейронной системы — проходит через три стадии развития. Отключение факторов, специфичных для текущей стадии развития микроглии, нарушает работу иммунной системы. — Microglia development follows a stepwise program to regulate brain homeostasis.
• Структурка. Структурка трансмембранного домена белка оболочки ВИЧ-1 помогает понять, как этот белок образует тримеры, которые важны для успешного заражения клетки. — Structural basis for membrane anchoring of HIV-1 envelope spike.