Nature от 25 марта 2015 г.: порочная омика, прокрустово ложе B-клеток и много разных РНК

• Нейробиология. Без белка, обеспечивающего связь между нейронами, развивается болезнь, нарушающая связь между людьми: одна из причин аутизма — неработающий дельта-катенин. — Loss of δ-catenin function in severe autism.
• Молекулярная биология. Как паук в центре паутины метаболических каскадов, комплекс mTORC1 собирает информацию об уровне питательных веществ, энергии и редокс-потенциале в клетке. Если все хорошо, он запускает активацию трансляции. А вот открыли белок SLC38A9 в одном из узелков паутины. Он сообщает mTORC1, как в клетке дела с уровнем аминокислот. — SLC38A9 is a component of the lysosomal amino acid sensing machinery that controls mTORC1.
• Генетика. Порочная омика. На гигантской выборке мышей показано, что порок сердца часто связан с нарушением работы ресничек. — Global genetic analysis in mice unveils central role for cilia in congenital heart disease.
• Рак. Лечение рака вызывает рак. Под действием некоторых видов химиотерапии раковые клетки выделяют вещества, помогающие другим раковым клеткам выжить и размножиться. Впрочем, комбинированную терапию они так не обманут. — Therapy-induced tumour secretomes promote resistance and tumour progression.
• Эпигенетика. Новые игроки на эпигенетической сцене: если ломается белок Paf1, начинается производство коротких интерферирующих РНК из мРНК транскриптов. Это как если б пули для охоты на птиц делали из птиц. — RNA interference hangs by a thread, The Paf1 complex represses small-RNA-mediated epigenetic gene silencing.
• Биология растений. Все давно свыклись с мыслью существования некодирующих РНК, таких, как, например, микроРНК, регулирующих активность генов. Но не тут-то было: оказывается, предшественники микроРНК, так называемые при-микроРНК, кодируют-таки пептиды, которые тоже регулируют активность генов, включая свои собственные. Эй, ну вы разберитесь уже там! — Coding in non-coding RNAs, Primary transcripts of microRNAs encode regulatory peptides. См. также: Обо всех РНК на свете, больших и малых, Неизвестные пептиды: «теневая» система биорегуляции.
• Молекулярная биология. Белок с сумасшедшим названием MAD2L2 (известный также как REV7) заставляет порванную хромосому восстановиться негомологичным соединением концов. Думаю, не надо объяснять, какое это имеет значение для рака и его терапии. — MAD2L2 controls DNA repair at telomeres and DNA breaks by inhibiting 5′ end resection, REV7 counteracts DNA double-strand break resection and affects PARP inhibition.
• Иммунология, рак. Тяжела судьба В-клетки. Слишком слабо реагируешь на антиген? Плохо работаешь, бесполезна, под отстрел. Слишком сильно реагируешь на антиген? Аутоиммунна, опасна, под отстрел. А что, если использовать это прокрустово ложе для борьбы с «неправильными», онкогенными В-клетками? Заставить их так сильно реагировать на антиген, чтобы их отстреливала сама иммунная система? На мышиных клетках работает. — Signalling thresholds and negative B-cell selection in acute lymphoblastic leukaemia.

Science #347(6229): ДНК-оригами, вылечить Стивена Хокинга и вакцина от эболы

• Материаловедение. Новые ДНК-оригами меняют конформацию в зависимости от солености раствора и температуры, а также связываются друг с другом не только за счет комплементарности оснований, но и за счет формы. Всегда приятно, когда что-то такое придумывают. А вот попробуйте пособирать нанороботов из ДНК в игрушке навроде фолдита. — Exploiting weak interactions in DNA self-assembly, Dynamic DNA devices and assemblies formed by shape-complementary, non-base pairing 3D components.
  биомолекула: «Беспроводная магнитотермическая глубокая стимуляция мозга»»
• Генетика. Боковой амиотрофический склероз — заболевание со сложновыговариваемым названием — проще всего представить себе, вспомнив самого знаменитого пацента с этой болезнью: Стивена Хокинга, почти всю жизнь прикованного к инвалидному креслу. Эффективного лечения этой болезни не существует, и тем яростнее исследователи набрасываются на секвенирование экзомов таких больных. Тут особенно важна большая выборка. Сравнив генетические данные по 2869 больным и около 6000 здоровым пациентам, ученые выявили несколько уже известных генов, связанных с болезнью, и один новый. Им оказалась киназа TBK1, принимающая участие во врожденном иммунитете и аутофагии. Надо попробовать использовать ее как мишень для лекарств. — For complex disease genetics, collaboration drives progress, Exome sequencing in amyotrophic lateral sclerosis identifies risk genes and pathways.
• Паразитология. Дьявольски хитрая трипаносома защищается от иммунного ответа, тасуя гликопротеины на своей поверхности. Оказывается, она выставляет разные гликопротеины одновременно, чем окончательно запутывает иммунитет хозяина. — The in vivo dynamics of antigenic variation in Trypanosoma brucei.
• Молекулярная биология. В слияние мембран при внутриклеточном транспорте вовлечен комплекс SNARE-белков. Когда их дело сделано, комплекс разваливается. Оказывается, он разваливается не уныыыло и мееедленно, а пружинисто, взрывально, с помощью белков NSF и α-SNAP. — Spring-loaded unraveling of a single SNARE complex by NSF in one round of ATP turnover.
• Инфекции, вакцины. Недавняя эпидемия эболы в Африке породила опасения, что это вирус нового поколения, который мутирует с невиданной скоростью и обладает чрезвычайным разнообразием. В то же время, секвенирование образцов вируса из Мали показывает, что паника напрасна — эти показатели абсолютно в норме. Видимо, проблема в чем-то другом — например, несоблюдении здравоохранительных норм. Одновременно с этим сообщается, что готова новая прививка от эболы, основанная на нереплицирующемся вирусе EBOVΔVP30, до кучи обработанном перекисью. — Mutation rate and genotype variation of Ebola virus from Mali case sequences, An Ebola whole-virus vaccine is protective in nonhuman primates. См. также: Вирус Эбола и макак-резус: получено новое эффективное лекарство.
• Инфекции. С малых лет советские дети знают, что при вирусных заболеваниях людям капают в нос интерферон. Кто его знает, на сколько это эффективно, но в данной работе показано, что при нарушении одного из путей синтеза интерферона в организме грипп начинает представлять серьезную угрозу жизни. — Life-threatening influenza and impaired interferon amplification in human IRF7 deficiency.