Nature #527 (7579) + онлайны: факторы отбора древних людей, генетически модифицированный лосось и обращение развития расстройства аутического спектра

• Наука и общество. Правительство США наконец-то одобрило для употребления в пищу генетически модифицированное животное — быстро растущего лосося. Благодаря усиленной выработке гормона роста такие лососи вырастают до подходящих на продажу размеров не за 3 года, а за 1,5. — Salmon approval heralds rethink of transgenic animals.
• Наука и общество. Вслед за Биомолекулой публикует научные комиксы и Nature. Их графическая история рассказывает о глобальном изменении климата и призывает нации объединить усилия, чтобы спасти мир. — The fragile framework. См. также комиксы «биомолекулы»: Кем быть? Как гемопоэтическая стволовая клетка выбирает профессию, Как происходит выделение нейромедиатора, Сказка-комикс о великой битве между радикалами и антиоксидантами, Azimuth, pitch & rock’n’roll.
• Методика. Новый метод ультразвуковой микроскопии позволяет наблюдать за движением крови в крошечных сосудах, располагающихся в сантиметре под поверхностью тела животного. Таких удивительных для прижизненной микроскопии результатов удается достичь, анализируя рассеяние удьтразвуковых волн на микроскопических пузырьках газа в крови животного. — Imaging techniques: Super-resolution ultrasound, Ultrafast ultrasound localization microscopy for deep super-resolution vascular imaging.
• Генетика, палеонтология. Международная команда ученых, в составе которой работало 5 россиян, проанализировала беспецедентно большую выборку геномов древних евразийцев, живших от 6500 до 350 годов до нашей эры. Сравнение геномов позволило найти несколько локусов, по которым шел отбор. Эти генетические участки были связаны с диетой, пигментацией и иммунитетом. Также ученые нашли свидетельства двух независимых эпизодов отбора древних людей по росту. — Genome-wide patterns of selection in 230 ancient Eurasians.
• Клеточная биология. Для роста костей необходимы не только процессы синтеза, но и разрушения. Оказывается, при подавлении аутофагии — процесса клеточного самоуничтожения — в костях мышей неправильно формируется коллагеновая сеть. — FGF signalling regulates bone growth through autophagy.
• Структурка. Исследование комплекса ТОМ, через который в митохондрии попадают синтезированные в цитоплазме белки. — Cell biology: Architecture of a protein entry gate.
• Структурка. Сразу несколько структур РНК-полимеразы III, которой по роду службы приходится синтезировать множество коротких РНК. Теперь ясно, какие особенности этих молекул позволяют им быстро заканчивать транскрипцию и приспупать к синтезу следующей РНК. — Structural biology: A transcriptional specialist resolved, Molecular structures of unbound and transcribing RNA polymerase III.
• Иммунология. Новая статья лаборатории Александра Руденского, который, по ожидания многих, мог бы получить в этом году нобелевскую премию. Исследователям удалось увидеть кластеры Т-клеток, образование которых необходимо, чтобы предотвратить аутоиммунные реакции. — Immunology: In the right place at the right time, Immune homeostasis enforced by co-localized effector and regulatory T cells.
• Иммунология. Больше Руденского в номер! А эта работа еще и сделана в соавторстве с учеными из ИБХ РАН. Исследование посвящено расширению репертуара регуляторных Т-клеток, которые мешают развитию потенциально опасных для организма иммунных клеток. — A mechanism for expansion of regulatory T-cell repertoire and its role in self-tolerance.
• Нейробиология. Дупликация гена белка MeCP2, распознающего эпигенетические метки ДНК, у людей связана с аутизмом отсталостью. На мышиной модели этого заболевания удалось показать, что его симптомы обратимы, достаточно тем или иным способом уменьшить наработку белка MeCP2. — Reversal of phenotypes in MECP2 duplication mice using genetic rescue or antisense oligonucleotides.
• Методика. Если участок ДНК чувствителен к ферменту ДНКазе, значит, он свободен от нуклеосом. А если участок ДНК поддерживается свободным, скорее всего, он важен для связывания регуляторных факторов. Авторам этой статьи удалось найти участки,чувствительные к ДНКазе, по всему геному единичных клеток. — Genome-wide detection of DNase I hypersensitive sites in single cells and FFPE tissue samples.

Science #350 (6264) + онлайны: новые типые нейронов, гены, необходимые клеткам человека и вредные для вида инновации

• Наука и общество. Американский национальный институт здравоохранения (NIH) прекращает поддержку инвазивных исследований на шимпанзе. Это решение, что интересно, вызвано тем, что в последние годы никто и не запрашивал разрешения на работу с шимпанзе. Так что, каковы бы ни были причины, наука как-то сама становится более этичной. — An end to U.S. chimp research.
• Биотехнологии. В статье обсуждается интерсный подход к борьбе с малярией: раз уж ее распространяют комары, значит, нужно распространить среди комаров гены, которые помогут им бороться с инфекцией и помешают ее передавать. Для этого нужно генетически модифицировать комаров таким хитрым образом, чтобы полезные гены наследовались с более чем 50% вероятностью. Пока метод опробован только в лаборатории. — Gene drive turns mosquitoes into malaria fighters. См. также: Мутагенная цепная реакция: редактирование геномов на грани фантастики.
• Генетика. Два независимых исследования разными методами выявили набор генов, которые абсолютно необходимы для поддержания жизнеспособности и делений клеток человека. Их оказалось совсем не много: примерно 2000. — The indispensable genome, Identification and characterization of essential genes in the human genome, Gene essentiality and synthetic lethality in haploid human cells.
• Экология. Животные, не без участия человека, продолжают вымирать. Чтобы понять, как вымирание травоядных влияет на жизнь экосистемы, ученые из южноафриканских университетов смоделировали распределение биомассы травоядных Африки, какой она была тысячу лет назад. Такие модели позволяют предсказывать, как будет меняться жизнь растительных сообществ в масштабах целого континента. — Learning from Africa’s herbivores, A continent-wide assessment of the form and intensity of large mammal herbivory in Africa.
• Эволюция. Казалось бы, эволюционная инновация, которая открывает виду путь в до сих пор свободную нишу, должна улучшить жизнь вида. Забавно, но это не всегда верно — полное отсутствие конкуренции в новой нише может привести к такой деградации вида, что он даже может вымереть совсем. — How Victoria’s fishes were knocked from their perch, A pharyngeal jaw evolutionary innovation facilitated extinction in Lake Victoria cichlids.
• Методика. Обзор интересных методов, сочетающих микроскопию и спектроскопию, и позволяющих получать картинки благодаря анализу вибраций биологических молекул. — Vibrational spectroscopic imaging of living systems: An emerging platform for biology and medicine.
• Нейробиология, методика. Раньше из-за технических сложностей нейробиологи не могли получать тонкие срезы мозга взрослых мышей, и приходилось исследовать в основном мозги молодых. А теперь ученые из США и Германии разработали метод получения тонких срезов мозга взрослых крыс, благодаря чему описали несколько новых типов нейронов, а также составили беспрецендентно подробные схемы структуры мышиного неокортекса. — Principles of connectivity among morphologically defined cell types in adult neocortex.
• Молекулярка. Чтобы малярия развивалась успешно, спорозоит плазмодия должен внедриться в подходящий гепатоцит. Подходящий — значит, обладающий рецепторами EphA2. Нет репептора — нет наработки важных для спорозоита белков. — Malaria parasites target the hepatocyte receptor EphA2 for successful host infection.
• Молекулярка. Наблюдения за синтезом небольшого белка показали — в процессе его трансляции аминокислотная цепочка сворачивается в структуры, которых нет в готовом варианте домена. И только когда вся последовательность домена выходит из рибосомы, формируется его правильная структура. — Cotranslational protein folding on the ribosome monitored in real time.
• Экология. Масштабна реконструкция численности сообществ планктона в северной части Тихого океана — за последнюю тысячу лет. — Millennial-scale plankton regime shifts in the subtropical North Pacific Ocean.
• Экология. Не всем становится хуже из-за повышения содержания углекислого газа в атмосфере — вот планктонных водорослей кокколитофорид, которым углекислый газ нужен как источник углерода для панцирей, ситуация полностью устраивает. — Multidecadal increase in North Atlantic coccolithophores and the potential role of rising CO_2.