https://biomolecula.ru/notices/kraudfanding-na-kalendar
Подписаться
Оглавление

SciNat за сентябрь 2015 #1: плюсы деревенской жизни, белок для хранения меди и самый древний черепаший череп

  • 325
  • 0,8
  • 0
  • 0
Добавить в избранное
Дайджест
Спецвыпуск Science посвящен науке в Иране — государстве, страдающем от последствий экономической и политической изоляции. На обложке номера изображено озеро Урмиа, уменьшившееся до одной десятой своей площади из-за неразумного использования воды. Граждане страны надеются, что ученые придумают программу восстановления озера.
Из свежего Nature можно почерпнуть, что пластичность не всегда полезна, что экспансия некодирующих повторов ДНК может повлиять на строение ядерных пор и что для хранения меди отлично подойдет белок определенной структуры. В новом Science приводят научные аргументы в пользу деревенского образа жизни, рассказывают о конструировании искусственных микротрубочек и о недавно открытых закономерностях устройства пищевых пирамид.

Nature #525(7567) + онлайны: вредная пластичность, белок для хранения меди и самый древний черепаший череп

  • Генетика, молекулярка. Увеличение количества повторов GGGGCC в некодирующих областях генома вызывает нейродегенеративные заболевания. Теперь мы знаем, как именно повторы влияют на нервные клетки: размножение повторов изменяет активность генов, отвечающих за образование пор в ядерной мембраны, из-за чего нарушается транспорт между цитоплазмой и ядром. — Neurodegeneration: Problems at the nuclear pore, The C9orf72 repeat expansion disrupts nucleocytoplasmic transport, GGGGCC repeat expansion in C9orf72 compromises nucleocytoplasmic transport.
  • Экология. Люди часто переселяют других живых существ в новые места обитания. В свежем Nature опубликован первый глобальный анализ последствий переселения растений людьми. Там много интересных цифр, например — 3,9% видов сосудистых растений человек уже распространил там, где эти виды изначально не встречались. — Ecology: Global trends in plant naturalization, Global exchange and accumulation of non-native plants.
  • Генетика, иммунология. Вопреки ожиданиям, правильные гены антител при переключении их классов в B-клетках собираются не с 50% вероятностью (или собираются, или не собираются), а значительно чаще. Как же мудра природа. — Molecular biology: Unequal opportunity during class switching, Orientation-specific joining of AID-initiated DNA breaks promotes antibody class switching.
  • Структурка. Взаимодействие белков synaptotagmin-1 и SNARE необходимо для синхронного выделения медиатора из везикул, открывающихся в синаптическую щель. Благодаря структурам комплексов этих белков мы теперь лучше понимаем, как работает синаптическая передача сигналов между нервными клетками. — Architecture of the synaptotagmin—SNARE machinery for neuronal exocytosis.
  • Структурка. Структурка огромного ферментного комплекса E. coli, расщепляющего связи между углеродом и фосфором. — Structural insights into the bacterial carbon—phosphorus lyase machinery.
  • Биоинженерия. Если долго смотреть, как складывается ДНК-оригами, можно понять, как ее лучше проектировать, чтобы по ходу сборки возникало меньше ошибок. — Guiding the folding pathway of DNA origami.
  • Генетика. Пролапс митрального клапана — болезнь с сильным наследственным компонентом, который обуславливается, как оказалось, мутацией гена DCHS1. Из-за таких мутаций нарушается миграция клеток в эмбриональном развитии, и еще тогда закладываются основы заболевания. — Mutations in DCHS1 cause mitral valve prolapse.
  • Молекулярка. Метаноокисляющим бактериям в больших количествах нужна медь. Оказалось, у них есть специальный белок, чтобы ее аккуратно хранить. — A four-helix bundle stores copper for methane oxidation.
  • Эволюция. Фенотипическая пластичность — это способность одного генотипа проявляться по-разному в различных условиях. Эксперименты на гуппи, приспосабливающихся к жизни с хищными цихлидами, показали, что адаптивная пластичность ослабляет отбор и замедляет эволюцию. — Evolutionary biology: Perplexing effects of phenotypic plasticity, Non-adaptive plasticity potentiates rapid adaptive evolution of gene expression in nature.
  • Молекулярка, рак. Ген белка p53 чаще всего мутирует при раке. Его мутации, способствующие раку, как оказалось, влияют на структуру хроматина, увеличивая количества и метильных, и ацетильных меток на гистонах. — Cancer: Mutant p53 and chromatin regulation, Gain-of-function p53 mutants co-opt chromatin pathways to drive cancer growth.
  • Молекулярка, рак. Ингибиторы киназ неплохо помогают подавлять развитие хронической миелоидной лейкемии, но влияют далеко не на все раковые стволовые клетки. Оказалось, что от оставшихся из таких клеток можно эффективно избавляться с помощью глитазонов — антидиабетических препаратов. — Cancer: Repositioned to kill stem cells, Erosion of the chronic myeloid leukaemia stem cell pool by PPARγ agonists.
  • Молекулярка, рак. При раке часто нарабатываются избыточные количества транскрипционного фактора MYC. Из-за этого начинают активнее работать многие гены. А спалайсосомы перестают справляться с потоком предшественников РНК, которые им нужно обрабатывать. — The spliceosome is a therapeutic vulnerability in MYC-driven cancer.
  • Экология. Появилась первая подробная глобальная карта плотности деревьев. Теперь мы можем более аккуартно оценить, сколько их на Земле (3,04 триллиона). — Mapping tree density at a global scale.
  • Палеонтология. У черепах странный не только панцирь, но и череп. Интересно, что у ископаемых возрастом 260 миллионов лет обнаружились не только зачатки оригинального плана черепашьего тела, но и черепа. — Evolutionary origin of the turtle skull.
  • Молекулярка, рак. Активно расселяющиеся по организму опухолевые клетки используют похожие каскады на те, что характерны для стволовых клеток. Хотя детали этих каскадов не полностью совпадают. — Distinct EMT programs control normal mammary stem cells and tumour-initiating cells.
  • Молекулярка. С помощью оптического пинцета ученые прощупали все стадии инициации транскрипции РНК-полимеразой II. И кое-в чем прощупанное отличалось от принятых ранее представлений о начале транскрипции. — Real-time observation of the initiation of RNA polymerase II transcription.
  • Биоинженерия. Раньше уже были сконструированы самособрирающиеся структуры из ДНК или из белков, а теперь вот — и из того, и из другого вместе. — Computational design of co-assembling protein—DNA nanowires.

Science #349(6252) + онлайны: плюсы деревенской жизни, структура пищевых пирамид и искусственные микротрубочки

  • Наука и общество. Спецвыпуск Science посвящен науке в Иране — государстве, страдающем от последствий экономической и политической изоляции. — Iran, science, and collaboration, Unsanctioned science.
  • Микробиология, иммунология. Найдено объяснение интересному наблюдению о том, что у детей, выросших на молочных фермах, реже развивается астма. Оказывается, бактерии, обитающие на фермах, вызывают воспалительный ответ в легких. А работа фермента, участвующего в таком защитном ответе, как раз нарушена у больных с астмой. — How farm life prevents asthma, Farm dust and endotoxin protect against allergy through A20 induction in lung epithelial cells.
  • Экология. Тринитротолуол — не только опасное взрывчатое вещество, но и химикат, плохо влияющий на состояние растений. Оказалось, что его токсичность обуславливается работой определенного фермента, который делает из тринитротолуола свободные радикалы. Чем менее активен этот фермент, чем выше устойчивость растений к загрязнению среды. — Lighting the fuse on toxic TNT, Monodehydroascorbate reductase mediates TNT toxicity in plants.
  • Экология. Трофическая структура сообщества — то есть, сколько в нем хищников, а сколько жертв — определяет его продуктивность и влияние на окружающую среду. Поэтому исследовать законы, определяющие число видов на разных уровнях пищевой пирамиды очень важно. На примере двух тысяч сообществ обнаружилась закономерность — чем больше общая биомасса организмов сообщества, тем выше отношение основания пищевой пирамиды к ее верхушке. — Energy flows in ecosystems, The predator-prey power law: Biomass scaling across terrestrial and aquatic biomes.
  • Иммунология. Клетки иммунной системы — компанейские ребята: направляясь куда-то, они выделяют сигналы, привлекающие товарищей. Вот и при гриппе, направляясь в зараженную трахею, нейтрофилы выделяют цитокины, привлекающие другие иммунные клетки — цитотоксические Т-клетки. — Fragmented communication between immune cells, Neutrophil trails guide influenza-specific CD8+ T cells in the airways.
  • Молекулярка, химия. Комплексы молекул в живых клетках не просто самостоятельно собираются, их структура еще и отвечает на самые разные сигналы. Например, тубулин собирается в микротрубочки, если есть достаточное количество молекул ГТФ, а если этих молекул недостаточно, микротрубочки, наоборот, начинают разбираться. Подобную саморегулирующуюся систему из синтетических молекул удалось сконструировать химикам. — Fueling connections between chemistry and biology, Transient assembly of active materials fueled by a chemical reaction.
  • Экология. Обзор, посвященный связи структуры сообщества организмов и его устойчивости к инфекциям. — Why infectious disease research needs community ecology.
  • Структурка. Структурка белка Vps33 в комплексе с двумя рецепторами SNARE. Вся эта сложная конструкция должна собираться, когда необходило слить мембраны двух внутриклеточных пузырьков, в мембраны которых встроены SNARE. — A direct role for the Sec1/Munc18-family protein Vps33 as a template for SNARE assembly.
  • Микробиология, эволюция. Исследование системы разделения ДНК после деления архей, показало, что у некоторых ее компонентов есть сходство с бактериальными, а у некоторых — с эукариотическими аналогами. — Structures of archaeal DNA segregation machinery reveal bacterial and eukaryotic linkages.
  • Молекулярка, рак. Маленькая ГТФаза RAB35 может сать очень опасной, если в ее гене произойдут определенные мутации. Тогда на начинает работать не переставая, нарушая трафик клеточных мембран и подавляя апоптоз, что способствует переходу клетки на путь злокачественности. — Identification of an oncogenic RAB protein.

Комментарии