Nature #575 (7782) + онлайны: лекарственная устойчивость опухолей, микробиота, приводящая к печеночной недостаточности, и участие протеобактерий в круговороте органического углерода

• Палеонтология. Все больше данных появляется о древних приматах — исследование протеома зубной эмали самого крупного гоминида Gigantopithecus blacki, населявшего леса Юго-Восточной Азии в эпоху плейстоцена, продемонстрировало, что он является родственником орангутангов (род Pongo). К тому же, возраст изученных последовательностей в пять раз превышает возраст ранее опубликованных протеомов и геномов древних млекопитающих. — Enamel proteome shows that Gigantopithecus was an early diverging pongine.
• Молекулярка. Каспаза-8 — протеаза, которая опосредует апоптоз, индуцированный рецепторами клеточной гибели TNFR1, а также подавляет некроптоз, опосредованный киназой RIPK3 и псевдокиназой MLKL. Оказалось, что пластичность путей клеточной гибели зависит от того, ингибирован ли каспаза-8 зависимый апоптоз или MLKL-зависимый некроптоз. — Activity of caspase-8 determines plasticity between cell death pathways.
• Экология. В океане одним из наиболее распространенных источников органического углерода являются производные гликолевой кислоты — гликоляты. Давно известно, что они окисляются морскими бактериями, но дальнейшая судьба соединения долгое время оставалась неизвестной. Ученые выяснили, что морские протеобактерии могут перерабатывать эти соединения, вовлекая в процесс β-гидроксиаспартатный цикл (ВНАС). Авторы изучили биохимию ВНАС и описали структуру его ключевых ферментов, а также проанализировали метагеномы морских протеобактерий и выяснили, что ВНАС примерно в 20 раз более распространен, чем другой, ранее известный путь утилизации соединения. — Marine Proteobacteria metabolize glycolate via the β-hydroxyaspartate cycle.
• Молекулярка. Защита концевых фрагментов теломер комплексами шелтерина предотвращает передачу сигналов о повреждении ДНК и беспорядочную репарацию концевых фрагментов хромосом. Авторы определили сайт фосфорилирования CDK в субъединице шелтерина Ser365 TRF2, дефосфорилирование которого обеспечивает короткий временной промежуток, во время которого геликаза RTEL1 может способствовать облегчению репликации теломер. Следовательно, TRF2 опосредованно защищает теломеры от избыточной реакции на сигналы о повреждении ДНК. — CDK phosphorylation of TRF2 controls t-loop dynamics during the cell cycle.
• Онкология. В одной из статей, опубликованных в свежем выпуске журнала, приводится подробный обзор лекарственной устойчивости злокачественных новообразований. Авторы не только освещают проблему, но и предлагают несколько путей ее решения. — A view on drug resistance in cancer.
• Микробиология. Печеночная недостаточность, вызванная употреблением алкоголя, широко распространена по всему миру. Оказалось, что в развитии этого заболевания у мышей участвует кишечная микробиота. Авторы идентифицировали цитолизин — секретируемый Enterococcus faecalis двухсубъединичный экзотоксин, который может приводить к цитолизу гепатоцитов и, как следствие, к печеночной недостаточности. Также они идентифицировали специфический бактериофаг, воздействующий на цитолитические штаммы Enterococcus faecalis. — Bacteriophage targeting of gut bacterium attenuates alcoholic liver disease.

Science #366 (6467) + онлайны: «контроль качества» внутри клетки, микробиота, вызывающая миокардит, и выращивание эмбрионов ex vivo

• Цитология. Спецвыпуск журнала посвящен «контролю качества» внутри клетки — процессам, отвечающим за саморегуляцию синтеза белка, нуклеиновых кислот и др. Кроме того, вы сможете узнать о том, как нарушение «контроля качества» приводит к развитию онкологических, нейродегенеративных и других заболеваний, а также играет свою роль в процессе старения. — Quality control in cell biology; Cellular quality control by the ubiquitin-proteasome system and autophagy; Cellular RNA surveillance in health and disease; Mitocellular communication: Shaping health and disease.
• Молекулярка. Синдром Дауна — хромосомная патология, вызываемая утроением 21 хромосомы. Помимо других проблем со здоровьем у таких пациентов формируются и интеллектуальные нарушения, однако о механизмах их развития известно немного. Ученые обнаружили, что у мышей и у людей с трисомией 21 хромосомы происходила активация интегрированного стрессового ответа (ISR), что приводило к перепрограммированию трансляции. Генетическое и фармакологическое подавление ISR повышало пластичность синаптической системы и сокращало частоту дефицита памяти у мышей. — Activation of the ISR mediates the behavioral and neurophysiological abnormalities in Down syndrome; Translating translation in Down syndrome.
• Эмбриология. Как известно, наблюдение за ростом и развитием эмбрионов млекопитающих затруднено, поскольку после имплантации они укрыты от глаз наблюдателей. Для визуализации процесса развития необходима технология, которая будет поддерживать жизнеспособность и развитие эмбрионов ex vivo. Сразу три статьи журнала посвящены методикам культивирования эмбрионов обезьян in vitro. В течение 20 дней авторы наблюдали за ростом эмбрионов макака-крабоеда, а также занимались изучением процессов, лежащих в основе постимплантационного развития эмбрионов. — Modeling the early development of a primate embryo; In vitro culture of cynomolgus monkey embryos beyond early gastrulation; Dissecting primate early post-implantation development using long-term in vitro embryo culture.
• Структурка. Комплекс RSC ремоделирует структуру хроматина и участвует в регуляции транскрипции генов. При помощи криоэлектронной микроскопии авторы изучили структуру связанного с нуклеосомой комплекса RSC дрожжей, что позволило изучить его архитектуру, характер взаимодействия с нуклеосомой и объяснить влияние на направленность транслокации ДНК. — Structure of the RSC complex bound to the nucleosome.
• Экология. Глобальные изменения окружающей среды происходят по причине антропогенных и природных воздействий. В лабораторном эксперименте авторы протестировали 10 факторов, влияющих на изменение окружающей среды, как в отдельности, так и в комбинациях от 2 до 10, и обнаружили что свойства почвы, микробных сообществ и другие изменения не могут быть предсказаны в исследованиях, изучающих один фактор. — Piling on the pressures to ecosystems; The role of multiple global change factors in driving soil functions and microbial biodiversity.
• Микробиология. Миокардит — тяжелое воспалительное заболевание, поражающее мышечную ткань сердца и часто приводящее к развитию сердечной недостаточности. Считается, что центральную роль в его патогенезе играют активированные Т-хелперы, распознающие пептиды-производные шестой тяжелой цепи миозина. Авторы использовали мышиную модель миокардита и выяснили, что первоначально Т-хелперы сенсибилизируются пептидами-имитаторами, происходящими от обитающих в кишечнике представителей вида Bacteroides. Лечение антибиотиками сокращало продолжительность воспалительного процесса и снижало вероятность развития тяжелой сердечной недостаточности. — Microbiota-derived peptide mimics drive lethal inflammatory cardiomyopathy; Microbes and genes in heart failure.