Возможности для всестороннего изучения SARS-CoV-2 от компании GeneTex

Прошло лишь немногим более года с момента объявления ВОЗ пандемии новой коронавирусной инфекции , а компания GeneTex уже разработала внушительную коллекцию с валидированными реагентами для исследования SARS-CoV-2.

На «Биомолекуле» опубликована внушительная коллекция материалов по ковиду: от базовой информации, новой для подавляющего боль-шинства людей еще год назад («2019-nCoV: очередной коронованный убийца?») до разбора вакцин («”Спутник V”, “ЭпиВакКорону”, “Модерну” делать будем? Ликбез по вакцинам против коронавируса») и принципов действия тестов T-клеточного иммунитета («Диагностика Т-клеточного иммунитета: пандемия как драйвер инновации») [1–3]. — Ред.

В наличии имеются:

• антитела (поликлональные и моноклональные, к структурным и неструктурным белкам вируса);
• нейтрализующие антитела;
• пары антител для ИФА и иммунохроматографии;
• рекомбинантные белки (ИФА, вестерн-блот);
• реагенты для экспресс-методов иммуноанализа;
• клеточные блоки (позитивный контроль для иммуногистохимии);
• сверхэкспрессионные клеточные лизаты (вестерн-блот, ИФА);
• набор ИФА для количественного анализа нуклеокапсидного белка;
• реагенты для исследования проникновения вируса в клетки;
• антитела для изучения цитокинового шторма;
• антитела для изучения пироптоза;
• набор реагентов для исследования связывающей активности и нейтрализа-ции/ингибирования взаимодействия RBD и ACE-2.

Наибольший интерес вызывает новая панель реагентов SARS-CoV-2 для анализа активности связывания и нейтрализации взаимодействия между RBD и ACE2. RBD (рецептор-связывающий домен) — это ключевая область спайк-белка вируса, отвечающая за связывание с рецептором клеток человека ACE2 (ангиотензинконвертирующий фермент-2) и таким образом участвующая в проникновении вируса внутрь клеток [4]. Разработка терапевтических препаратов для борьбы с COVID-19 основана на поиске молекул, ответственных за нарушение белок-белковых взаимодействий между RBD и ACE2 (см. также статью «Биомолекулы» «Компьютерные технологии против коронавируса: первые результаты») [5]. Существующие на данный момент на рынке антитела с нейтрализующей способностью к SARS-CoV-2 нацелены также на эпитопы RBD.

За последнее время вирус мутировал; появились новые штаммы коронавируса, три из которых оказались наиболее заразными и летальными. Это так называемые британский, южноафриканский и бразильский штаммы. Все три варианта содержат множество мутаций (от 17 до 23) в различных областях геномов, и от 1 до 3 мутаций в регионе RBD.

1. Британский штамм имеет большую аффинность (липкость) к ACE2 в сравнении с диким типом. Это значит, что данный вариант более вирулентный.
2. Южноафриканский штамм имеет мутацию, уменьшающую распознавание вируса антителами.
3. Бразильский штамм способен ускользать от иммунной системы человека [6].

Были проведены эксперименты на псевдовирусах, имитирующих биологию коронавируса, а также на настоящих клинических вирусных изолятах, позволяющих оценивать потенциальное влияние дополнительных мутаций за пределами спайк-белка на чувствительность к нейтрализующим антителам. Было доказано, что эффективность нейтрализующих антител вакцинированных и переболевших людей снижена при использовании мутантных штаммов [7–9]. Это объясняется тем, что у людей с субоптимальным и снижающимся иммунитетом теряется кросс-реактивность к новым вирусным вариантам, что дает возможность эволюции вируса. Таким образом, новые штаммы потенциально способны подорвать эффективность естественного и индуцированного существующими на данный момент вакцинами иммунитета.

В этой связи, наличие реагентов, позволяющих оценивать эффективность вакцин как против дикого типа, так и против разных штаммов коронавируса, крайне важно в настоящее время.

В панель реагентов от Genetex входят следующие продукты:

• рекомбинантные спайк-белки дикого типа и трех новых вариантов вируса, и бел-ки, содержащие мутации E484K/N501Y в RBD;
• человеческий ACE2 белок;
• положительный контроль (нейтрализующие антитела, способные распознавать RBD регионы дикого типа и новых вариантов вируса).

Эта линейка реагентов позволит исследователям создавать тест-системы для анализов поствакцинального и постинфекционного иммунитета, а также тест-системы по скринингу терапевтических препаратов. Подробный список продукции представлен на сайте компании и на видео.

Полный перечень продукции компании GeneTex:

• первичные антитела;
• вторичные антитела;
• пары антител и тест-системы ИФА;
• изотип-контроли;
• белки, пептиды, лектины;
• лизаты;
• FFPE-блоки;
• сыворотки и плазмы животных;
• наборы реагентов для ELISA, WB, IHC, ICC, IF, FACS, для клеточных культур.

Направления исследований:

• онкомаркеры;
• маркеры клеток и органелл;
• нейробиология;
• клеточная биология;
• метаболизм;
• эпигенетика;
• кардиология и ангиология;
• иммунология;
• клеточный сигналинг;
• инфекционные заболевания;
• биология развития (эмбриология);
• ветеринария.

8 июня 2021 года (вторник) компания проведет вебинар «Воспроизводимая платформа для разработки антител, ассоциированных с боковым амиотрофическим склерозом (БАС)», 18.00–19.30 (мск). Регистрация по ссылке.

Литература

1. 2019-nCoV: очередной коронованный убийца?;
2. «Спутник V», «ЭпиВакКорону», «Модерну» делать будем? Ликбез по вакцинам против коронавируса»
3. Диагностика Т-клеточного иммунитета: пандемия как драйвер инновации»
4. Lan J., Ge J. , Yu J., Zhang L., Wang X. (2020). Structure of the SARS-CoV-2 spike receptor-binding domain bound to the ACE2 receptor. Nature. 582, 215–220
5. Компьютерные технологии против коронавируса: первые результаты».
6. Funk T., Pharris A., Helve O., Gomes-Dias J., Adlhoch C. (2021).Characteristics of SARS-CoV-2 variants of concern B.1.1.7, B.1.351 or P.1: data from seven EU/EEA countries, weeks 38/2020 to 10/2021. Euro Surveill. 26
7. Wang Z., Schmidt F., Weisblum Y., Nussenzweig M.C. (2021). mRNA vaccine-elicited antibodies to SARS-CoV-2 and circulating variants. Nature. 592, 616–622
8. Thomson E.C., Rosen L., Shepherd J., Corti D., Robertson D., Snell G. (2021). Circulating SARS-CoV-2 spike N439K variants maintain fitness while evading antibody-mediated immunity. Cell. 184, 1171–1187
9. Planas D., Bruel T., Schwartz O. (2021). Sensitivity of infectious SARS-CoV-2 B.1.1.7 and B.1.351 variants to neutralizing antibodies. Nature Medicine. 27, 917–924