sergeyashin0909@gmail.com 0,0

Проблема стремительного распространения устойчивости к антибиотикам среди патогенных бактерий — одна из самых острых проблем современной медицины, поэтому разработка новых антибиотиков сейчас является очень важной задачей. Недавно на страницах журнала Cell американские исследователи сообщили, что сумели найти новый потенциальный антибиотик широкого спектра в базе данных соединений Drug Repurposing Hub с помощью машинного обучения. Обнаруженное вещество получило название галицин. Авторы работы экспериментально показали, что галицин обладает бактерицидной активностью против бактерий разных филогенетических групп, включая такие патогены человека, как возбудитель туберкулеза Mycobacterium tuberculosis и возбудитель колита Clostridioides difficile. Наша статья посвящена новой стратегии поиска потенциальных антибиотиков с помощью машинного обучения.

В новых выпусках Science и Nature много статей, посвященных обнаружению новых белков-супрессоров опухолей, а также статей о структурах различных белков — важнейшего комплекса ремоделирования хроматина SWI/SNF, V-АТФазы, необходимой для закачки молекул нейромедиатора в синаптические везикулы, прионоподобного белка дрозофилы, играющего ключевую роль в механизмах долговременной памяти. Вы узнаете о новых метаболических путях, которые используют микроорганизмы, обитающие в толще океанского дна, а также о механизмах поддержания состояния покоя T-клеток. Ну а гвоздь программы — череп крохотного динозавра, найденный в янтаре.

В первом весеннем дайджесте будет много новостей о молекулярных перестройках и биомедицинских открытиях. Мы познакомимся с одним из виновников сахарного диабета II типа, увидим микроокружение опухолей в красном свете, заглянем внутрь тканевого механизма аллергической реакции и узнаем о защитных секретах плазматической мембраны. Напоследок погрузимся в мозг, который переживает состояние стресса, и поймем, как можно восстановить память.

Сейчас сложно найти молекулярного биолога, который бы не знал про систему CRISPR/Cas, обеспечивающую адаптивный иммунитет бактерий и архей против вирусов и мобильных генетических элементов. Впрочем, накапливается масса свидетельств и о других функциях CRISPR/Cas. Так, недавно группа исследователей, в числе которых были и специалисты из Центра наук о жизни Сколковского института науки и технологий, показала, что системы CRISPR/Cas могут использовать вирусы гипертермофильных архей в конкурентной борьбе друг с другом. Такие вирусные системы не имеют генов cas, зато содержат локусы CRISPR с несколькими спейсерами, соответствующими фрагментам генома вируса-конкурента. Как же работают вирусные «мини-CRISPR»?

В новых номерах авторитетных научных журналов вышло сразу несколько статей, посвященных микробиоте. Кроме того, на этой неделе вы узнаете о применении технологии CRISPR в разработке терапии онкологических заболеваний, об эпигенетических механизмах здорового старения и об особенностях дифференцировки остеогенных клеток-предшественниц.

Проанализировав полные последовательности митохондриальных геномов лжелопатоносов — загадочного рода осетровых, представители которого обитают в бассейнах рек, впадающих в Аральское море, — ученые пришли к выводу, что два симпатрических вида этих хрящевых рыб, населяющих мутные воды Амударьи, образуют единый генетический кластер. Показано также, что сырдарьинский лжелопатонос, экземпляры которого можно увидеть лишь в музейных коллекциях, «отделился» от своих сородичей относительно давно.

В новых номерах авторитетных научных журналов много статей о структурах белков. Из них вы сможете узнать об устройстве гликопротеиновых шипиков нового коронавируса, а также о невероятно эффективных системах улавливания света, собранных из сотен белков. Кроме того, вы прочтете, как рыбы могут тормозить свое развитие при неблагоприятных условиях, о том, как эволюционировала аллостерическая регуляция киназы Aurora A, и о том, как trade-off между подвижностью и скоростью роста может благоприятствовать небольшим популяциям бактерий.

Четыре года назад в научном журнале Nature Immunology вышла наша статья с описанием молекулярного механизма не исследованного ранее синдрома XLPDR (X-linked pigmentary reticulate disorder), и я подробно описал профессиональную кухню этого открытия на «Биомолекуле»: «ДНК-полимераза как регулятор иммунитета. История одного открытия из первых рук». Статья была хорошо воспринята, и сейчас я хочу написать, как развивалась эта тема дальше, — благо, ею занимаюсь в основном я сам, а потому все повороты сюжета происходили на моих глазах. В итоге, по прошествии шести лет мы обнаружили новый симптом синдрома XLPDR, хотя сами исследования по бестолковости напоминали охоту на единорога. Однако в результате единорог был пойман и опубликован.