izibek90@yandex.ru 0,0

Повсеместно распространенная устойчивость бактерий к большинству антибиотиков, применяемых в современной медицине, грозит скорым ренессансом смертоносных бактериальных инфекций и потому вызывает большое беспокойство в кругах медиков и биологов. Поэтому одно из направлений, привлекающее внимание многих исследователей, — антимикробные пептиды, которые сами же бактерии и продуцируют для борьбы с конкурентами — другими бактериальными клетками. Зачастую эти пептиды содержат причудливые химические модификации, придающие им токсические свойства. Какие бактериальные ферменты осуществляют реакции, приводящие к таким замысловатым модификациям? Группа исследователей Центра наук о жизни Сколковского института науки и технологий совместно с исследователями из Центра Джона Иннса в Великобритании изучили ферментный комплекс, который синтезирует микроцин B17 — антибактериальный пептид, продуцируемый кишечной палочкой (Escherichia coli), и выявили химический механизм реакций, которые придают ему свойства токсина. Первый автор работы, Дмитрий Гиляров, любезно согласился прокомментировать исследование и рассказал, каковы перспективы применения бактериальных пептидов в клинической практике.

Вот и новые январские выпуски научных журналов, а вместе с ними много интересного! Например, из Nature мы узнаем о том, как отцовская линия наследования соревнуется с материнской, зачем ученые обучают кровеносные сосуды самосборке, а также что все-таки важнее для научных журналов: качество или деньги. А новые выпуски Science помогут нам разобраться в особенностях лечения мышей от ожирения (и зачем этим занимаются ученые), особенностях трансплантации костного мозга и стратегии избегания боли.

Год недавно начался, а ведущие научные журналы уже бодро печатают исследования, которые претендуют на звание «прорыв года». Так, британское издание Nature расскажет о том, как исследователи de novo создали улучшенную версию IL-2 для борьбы с раком. Кроме того, вы узнаете подробности механизма заражения ВИЧ. Их американский коллега Science же, среди прочего, осветит использование трехмерной модели ассемблоидов для изучения мозга и последние исследования по иммунометаболизму. Помимо этого, вы прочтете, что может заставить самку волнистого попугайчика выбрать в пару самца, ранее ею отвергнутого. Также оба журнала затрагивают проблему китобойного промысла в современном мире, связывая ее с недавними заявлениями со стороны Японии. 

В первых выпусках Science и Nature за этот год вы найдете много статей о структурах белковых комплексов — например, рецепторов ГАМК а также фотосинтетической системы I цианобактерий. Также вы сможете прочесть о том, как иммунная система может десятками лет бороться с раком, подавляя деление и распространение опухолевых клеток, о том, как в здоровой ткани постепенно накапливаются клетки с опасными мутациями и о триасских синапсидах размером со слона, которые ходили на прямых ногах, прямо как их дальние родственники — млекопитающие.

Многие издания подводят в конце декабря итоги печатного года — и «Биомолекула» не исключение. Знакомьтесь с нашим хит-парадом статей, которые в 2018 году читали чаще всего! Если вы видели прошлогодний «парад открыток», то что-то может вам показаться знакомым — некоторые обзорные статьи не теряют актуальности и продолжают регулярно просматриваться. Но появились и новички, которые привлекли к себе много читателей.

Технология редактирования генома, основанная на CRISPR/Cas, стремительно набирает популярность в качестве инструмента для решения самых разных биологических задач. Чаще всего в качестве редактора используют белок-эффектор Cas9, который с помощью направляющей (гидовой) РНК узнает ДНК-мишень, а затем разрезает ее. Впрочем, несмотря на свою популярность, Cas9 не лишен недостатков, в частности, он нередко разрушает не те мишени, которые были запрограммированы в гидовой РНК. Возможная альтернатива Cas9 — белки Cas12, в частности Cas12b, которые несколько лет назад предсказал сотрудник, а тогда аспирант, Сколтеха Сергей Шмаков. Любопытно, что, несмотря на то что для распознавания мишени Cas12b нужно спаривание всего лишь пяти нуклеотидов гидовой РНК с мишенью, этот фермент довольно специфичен. Как же Cas12b это удается? В работе, опубликованной журналом RNA biology, аспирантка Ишита Джайн из Центра наук о жизни Сколтеха и ее соавторы решили разобраться с этим. Попробуем разобраться и мы.

В конце декабря все подводят итоги — личные и не только. На этой неделе редакторы Nature и Science решили проштудировать все выпуски уходящего 2018 года и еще раз вспомнить самые броские статьи. Мы познакомимся с научными героями, которых нужно знать в лицо, а также расскажем о самых ярких моментах, анонсированных на страницах ведущих научных журналов.

Арсенал защитных инструментов бактерий, с помощью которых они дают отпор фагам, не исчерпывается хорошо изученными системами рестрикции-модификации и CRISPR/Cas: существует множество других защитных систем, изученных значительно хуже. Исследователи из Центра наук о жизни Сколтеха и других организаций вплотную занялись одной из таких систем, которая известна как BREX (от англ. bacteriophage exclusion). Хотя механизм ее работы всё еще неизвестен, ученые смогли понять, как эта система распознает, какую ДНК нужно разрушить, а какую — нет. В этой статье мы не только разберемся в известных деталях функционирования системы BREX, но и побеседуем с первым автором публикации в Nucleic Acid Research — Юлией Гордеевой, которая, кстати, на момент выполнения работы была только студенткой-магистрантом Сколтеха.