Подписаться
  • Торжество компьютерных методов: предсказание строения белков Обзор
    «Сухая» биология Биомолекулы Биотехнологии Структурная биология
    Торжество компьютерных методов: предсказание строения белков
    14581 6,0
    Знание пространственной организации белковых молекул является ключом не только к пониманию их функций и механизма работы, но и основой для разработки эффективных и безопасных лекарственных средств. В то же время, определять структуру белков в прямом эксперименте не всегда возможно или целесообразно — из-за сложности, дороговизны и ограниченности возможностей экспериментальных методик. Однако иногда удаётся преодолеть эти сложности, подойдя к проблеме «с другого конца»: структуру биомакромолекул можно «предсказать», используя теоретические подходы — основанные на физических или эмпирических приближениях. В этой статье даётся теоретическое обоснование возможности «предсказывать» структуру белков и коротко рассматриваются основные подходы к этой задаче.
    13 Антон Чугунов 26 марта 2008
  • Дизайнерские ферменты на службе общества Новость
    «Сухая» биология Биомолекулы Драг-дизайн Структурная биология
    Дизайнерские ферменты на службе общества
    1643 0,8
    Ферменты — лучшие катализаторы биохимических реакций, протекающих в живых организмах, — могут функционировать и вне клетки, работая на пользу человечества. Однако не для каждой реакции существуют природные белки, способные ускорить её ход. Если раньше создание новых ферментов осуществляли, оптимизируя уже существующие белки по механизму, аналогичному естественной эволюции, то теперь учёным удалось сконструировать несколько белков полностью на компьютере, проектируя их функцию «с нуля».
    0 Антон Чугунов 21 марта 2008
  • Объяснена различная вирулентность вирусов гриппа — возбудителей «испанки» Обзор
    Биомолекулы Биотехнологии Вирусология Грипп Структурная биология
    Объяснена различная вирулентность вирусов гриппа — возбудителей «испанки»
    18763 9,4
    В 1918–1919 годах пандемия гриппа — «испанки» — унесла, по меньшей мере, 20–50 миллионов жизней. Болезнь была вызвана особым штаммом вируса H1N1, предположительно произошедшим от вируса, распространённого среди диких птиц. Недавно выяснено, что такая «пересадка» вируса с животных на человека была обусловлена мутацией всего двух остатков в гемагглютинине — белке оболочки вируса, участвующего в заражении. Изучив структурные особенности «взлома» гликорецепторов эпителия дыхательных путей человека гемагглютининами различных штаммов вируса, учёные объясняют биохимию этого трагического «нашествия».
    18 Антон Чугунов 28 февраля 2008
  • Фолдинг «воочию» Новость
    Биофизика Процессы РНК Структурная биология
    Фолдинг «воочию»
    2284 1,1
    Фолдинг — физический процесс пространственной укладки биополимеров — одна из наиболее актуальных проблем современной физико-химической биологии. До сих пор никому ещё не удавалось проследить за сворачиванием одной-единственной молекулы в реальном времени. И вот, исследователи из Стэнфорда сконструировали оригинальный молекулярный манипулятор, позволивший им «растянуть» молекулу мРНК, содержащую аденин-чувствительный рибоселектор (riboswitch), и дать ей свернуться вновь. Анализ «профилей сил», возникающих при таком растягивании, позволил впервые «увидеть» последовательные стадии фолдинга молекулы и даже отследить событие связывания аденина этой мРНК.
    6 Антон Чугунов 18 февраля 2008
  • Что влияет на интенсивность генетической рекомбинации? Новость
    Генетика ДНК ДНК-микрочипы Процессы Секвенирование ДНК Хроматин Цитология Эволюционная биология
    Что влияет на интенсивность генетической рекомбинации?
    677 0,3
    Недавние исследования продемонстрировали, что скорость и частота процессов генетической рекомбинации различается у разных индивидов.
    0 Юрий Стефанов 02 февраля 2008
  • Союз голубоглазых Новость
    Антропология Генетика ДНК Эволюционная биология
    Союз голубоглазых
    4504 2,1
    Цвет глаз считается классическим признаком, наследование которого подчиняется законам Менделя. Однако тонкая регуляция функции гена OCA2, отвечающего за пигментацию кожи, глаз и волос, до недавнего времени была плохо изучена. Учёные из Дании установили механизм, отвечающий за разнообразие окраски «зеркала души», и сделали предположение, что мутация, обуславливающая голубоглазость, возникла всего лишь 6–10 тыс. лет назад — а до того момента все люди на Земле были кареглазыми.
    0 Антон Чугунов 01 февраля 2008
  • Геном, собранный вручную Новость
    Биотехнологии Генетика ДНК Микробиология Синтетическая биология Хроматин
    Геном, собранный вручную
    616 0,3
    В институте Крейга Вентера сделали работу, которая непременно войдет в историю молекулярной биологии. Коллектив ученых под руководством Гамильтона Смита собрал из химически синтезированных фрагментов целый функциональный геном живого организма.
    7 Юрий Стефанов 26 января 2008
  • Сверим часы Обзор
    «Сухая» биология Генетика ДНК Секвенирование ДНК Эволюционная биология
    Сверим часы
    2949 1,4
    Как научиться определять время, сравнивая молекулы? В настоящее время развитие молекулярной биологии, биоинформатики и геномики позволяет находить новые подходы к изучению центрального вопроса всей биологической науки — проблемы эволюции живых систем. Одним из весомых вкладов этих относительно молодых дисциплин в развитие данной области является метод оценки времени эволюционного расхождения таксонов — так называемый метод «молекулярных часов».
    2 Юрий Стефанов 20 января 2008
  • Изваяние невидимого Обзор
    «Сухая» биология Биомолекулы Биофизика Карьера Наглядно о ненаглядном Образование Структурная биология
    Изваяние невидимого
    2561 0,7
    Размер молекул, как правило, несоизмеримо меньше того предела, который можно разглядеть глазом, даже используя самый лучший оптический микроскоп — ведь длина волны видимого света существенно превосходит характерные размеры большинства молекул. Поэтому для изучения фундаментальных основ жизни приходится прибегать к упрощениям — молекулярным моделям, — чтобы биологические молекулы из области, доступной исключительно интеллекту, перенеслись в область чего-то видимого (на дисплее или листе бумаги) или даже осязаемого. Однако молекулы оказались не только желанным объектом для изучения: сама их суть стала для многих учёных и художников объектом вдохновения — и появилась молекулярная скульптура.
    4 Антон Чугунов 19 декабря 2007
  • Новый рубеж: получена пространственная структура β2-адренорецептора Обзор
    GPCR Биофизика Рецепторы Структурная биология
    Новый рубеж: получена пространственная структура β2-адренорецептора
    1957 1,0
    С 2000 года фоторецептор родопсин оставался единственным представителем семейства G-белоксопряжённых рецепторов (GPCR), для которого определена пространственная структура. Многочисленные попытки структурного описания этих важнейших мембранных рецепторов (являющихся мишенью действия бóльшей части производимых лекарств) заканчивались неудачей из-за низкой концентрации в клетке, а также сложности изучения с помощью экспериментальных методов. Сейчас, в конце 2007 года, двум группам американских исследователей удалось независимо получить трёхмерные структуры нового члена GPCR-семейства — β2-адренорецептора.
    0 Антон Чугунов 11 декабря 2007