Александр Иосипенко | «Биомолекула»

Новость

«Сухая» биология Метаболизм Нейробиология Нейромедиаторы Никотин Фармакология Этология
Пристрастие к наркотикам: собирая головоломку

2045 1,0

Пристрастие к наркотикам — одна из серьезнейших проблем современности, обусловленная генетическими и социальными факторами. Учёные из Пекина провели подробнейший генетический и биохимический анализ возможных молекулярных механизмов этого порока. Источником данных послужила биологическая литература за три десятилетия, а результатом стал самый подробный на сегодняшний день молекулярный «атлас», в котором сведены воедино метаболические процессы, потенциально участвующие в формировании привыкания. Что интересно, пять биохимических путей оказались общими для всех четырёх исследованных групп наркотиков.

7 Антон Чугунов 07 января 2008
Обзор

«Сухая» биология Биомолекулы Биофизика Карьера Наглядно о ненаглядном Образование Структурная биология
Изваяние невидимого

2498 0,7

Размер молекул, как правило, несоизмеримо меньше того предела, который можно разглядеть глазом, даже используя самый лучший оптический микроскоп — ведь длина волны видимого света существенно превосходит характерные размеры большинства молекул. Поэтому для изучения фундаментальных основ жизни приходится прибегать к упрощениям — молекулярным моделям, — чтобы биологические молекулы из области, доступной исключительно интеллекту, перенеслись в область чего-то видимого (на дисплее или листе бумаги) или даже осязаемого. Однако молекулы оказались не только желанным объектом для изучения: сама их суть стала для многих учёных и художников объектом вдохновения — и появилась молекулярная скульптура.

4 Антон Чугунов 19 декабря 2007
Новость

«Сухая» биология Биомолекулы Структурная биология
Новые успехи в предсказании пространственной структуры белков

2103 1,1

Теоретическое предсказание пространственной структуры белков — одна из наиболее актуальных задач структурной биологии, поскольку её получение в прямом эксперименте далеко не всегда возможно. В результате распределённого компьютерного эксперимента с участием более 70 000 пользователей персональных компьютеров по всему миру впервые с высокой точностью предсказана структура небольшого глобулярного белка, руководствуясь лишь его аминокислотной последовательностью. Учёные отмечают, что получаемые модели, кроме всего прочего, могут быть использованы для уточнения структур белков, получаемых экспериментально.

11 Антон Чугунов 19 октября 2007
Обзор

«Сухая» биология Биомолекулы Биофизика
Молекулярная динамика биомолекул. Часть I. История полувековой давности

9538 4,8

В 2007 году у всех, кто занимается или просто интересуется компьютерным моделированием биомолекул, есть повод отметить два скромных юбилея — 50 лет первому опубликованному компьютерному расчету молекулярной динамики и 30 лет первому расчету динамики белковой глобулы. В данном обзоре кратко представлена история развития методов молекулярной механики, а также их последующее применение в компьютерной биологии.

2 Антон Полянский 02 августа 2007
Новость

«Сухая» биология Биофизика Метаболизм
Построена полная модель метаболизма человека, основанная на геномных и биохимических данных

1015 0,5

Метаболизм — совокупность клеточных биохимических процессов — чрезвычайно сложная сеть реакций, связи между различными «узлами» которой (генами и их продуктами) многообразны, часто неочевидны и слабо изучены. Недавно построена полная модель метаболизма человека, основанная на последней редакции последовательности генома и исчерпывающем учёте биохимической информации, скомпилированной из научной литературы более чем за полвека. Компьютерный анализ этой модели позволил установить функции многих белков с ранее неизвестной ролью, а также указал «темные места» в биохимии и молекулярной генетике человека.

3 Антон Чугунов 18 апреля 2007
Обзор

«Сухая» биология Биофизика Драг-дизайн Наглядно о ненаглядном Нобелевские лауреаты Образование Структурная биология
На заре молекулярной графики

8313 4,2

Развитие биологии в XX веке неразрывно соединилось с изучением молекулярных основ жизни. Бурный прогресс биохимии, биофизики и молекулярной биологии привел к тому, что для многих важнейших процессов были установлены определяющие их молекулярные механизмы. В связи с этим появилась насущная потребность в визуализации молекул, способной дать представление об их пространственной организации, и, следовательно, дать ключ к объяснению их функций. В данном обзоре рассмотрены основные этапы развития визуальных способов представления структуры биомакромолекул — от «физических» моделей до первых компьютерных алгоритмов молекулярной графики.

2 Антон Чугунов 15 марта 2007
Обзор

«Сухая» биология
In vivo — in vitro — in silico

12943 6,5

Статья является введением к теме «Сухая биология» — в ней раскрывается смысл понятия in silico, а так же обсуждается его взаимосвязь с такими устоявшимися терминами как in vivo и in vitro.

0 Антон Полянский 14 октября 2004
Обзор

«Сухая» биология Биофизика Драг-дизайн Рецепторы Структурная биология Фармакология
Драг-дизайн: как в современном мире создаются новые лекарства

30981 14,7

Статья дает базовое представление о том, как в современном мире создаются лекарства. Рассмотрены история драг-дизайна, основные понятия, термины и технологии, применяющиеся в этой сфере. Особое внимание уделено роли вычислительной техники в этом наукоемком процессе. Описаны методы поиска и валидации биологических мишеней для лекарственных препаратов, высокопроизводительный скрининг, процессы клинических и доклинических испытаний лекарств а также применение компьютерных алгоритмов.

20 Антон Чугунов 07 июня 2004

Поддержите нас в деле просвещения

Больше Биомолекула рассказывает о биологии и медицине — сейчас у нас на сайте несколько тысяч статей. Если вам нравится наш сайт и вы хотите, чтобы он дальше работал, поддержите нас, пожалуйста, посильной суммой — разово или ежемесячно. Ежемесячные платежи предпочтительнее 😀

Александр Иосипенко 0,0

Поддержите нас в деле просвещения

Публикация отправлена в дорогую редакцию

Что-то пошло не так. Проверьте ваше интернет-соединение