Подписаться
Александр Иосипенко

Александр Иосипенко 0,0

Журналист - биолог

  • «Био/мол/текст»-2025/2026
    Искусственный интеллект в биологии
    Аптамеры: назад в будущее. Старая концепция в новой технологической реальности
    Обзор
    «Сухая» биология Биомолекулы ДНК
    Аптамеры: назад в будущее. Старая концепция в новой технологической реальности
    89 0,0
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: В 1990-х казалось, что аптамеры вот-вот вытеснят антитела. Спустя десятилетия — всего несколько препаратов, а в обзорах все чаще звучит: «высокий потенциал, но мало реализован». В этой статье мы разбираемся, что дело может быть не в самих аптамерах, а в способе их поиска — методе SELEX, который на практике напоминает лотерею. На фоне успехов AlphaFold мы объясняем, почему прямой перенос этого подхода на аптамеры не работает, и как вместо случайного отбора перейти к рациональному дизайну. Наконец, мы рассказываем, как платформа Xelari заменяет месяцы лабораторного перебора полным компьютерным проектированием аптамеров и почему у этих почти забытых молекул снова появился шанс.
    0 Владислава Долгушева 11 декабря 2025
  • «Био/мол/текст»-2025/2026
    Искусственный интеллект в биологии
    От структуры к функции: революция ИИ в белковом дизайне
    Обзор
    «Сухая» биология Биомолекулы Биотехнологии Медицина
    От структуры к функции: революция ИИ в белковом дизайне
    93 0,0
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Белки — это молекулярные машины, отточенные эволюцией на протяжении сотен миллионов и даже миллиардов лет. Мы пока не способны воспроизвести этот длинный путь естественной эволюции, но уже активно учимся направлено конструировать белки под конкретные задачи. И помогают нам в этом большие массивы данных и искусственный интеллект (ИИ). Сначала он научился предсказывать трехмерную структуру природных белков, а теперь на очереди — дизайн: создание новых функций и уверенная оптимизация уже существующих. В статье разбираем, как генеративные модели придумывают форму будущего белка, подбирают к ней аминокислотную последовательность и как вместе с лабораторными экспериментами проверяется, что такой белок действительно работает.
    0 Андрей Кузнецов 08 декабря 2025
  • «Био/мол/текст»-2025/2026
    Своя работа
    «Голодные игры» микробов: как заморить врага голодом, используя геномные данные для поиска скрытых защитников в кишечнике
    Обзор
    «Сухая» биология Медицина Метаболизм Микробиология
    «Голодные игры» микробов: как заморить врага голодом, используя геномные данные для поиска скрытых защитников в кишечнике
    95 0,0
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Пока одни микробы защищают наш организм, другие (в частности, Clostridioides difficile) ждут удобного момента, чтобы завладеть территорией. Стоит неблагоприятным факторам нарушить баланс микробного мира (например, вы приняли антибиотик) — и враг пробуждается. Но что, если бактерии-защитники могут подавлять рост нарушителей спокойствия просто уничтожая их продовольственные запасы? Представьте себе невидимую войну в глубинах кишечника, где победа определяется не мощностью оружия, а — внезапно — скоростью поедания, и отнюдь не друг друга, а обычных продуктов питания самих бактерий! Мы построили биоинформатический конвейер, который по геномам предсказывает, какие микробы способны лишать C. difficile жизненно важных аминокислот и тем самым не позволять ей эффективно колонизировать кишечник. Этот подход открывает путь к выявлению наиболее перспективных микробных защитников — потенциальных пробиотических микроорганизмов.
    0 Анастасия Холодная 17 ноября 2025
  • «Био/мол/текст»-2025/2026
    Своя работа
    Охотники за микробами: дело SM254
    Обзор
    «Сухая» биология Биотехнологии Микробиология
    Охотники за микробами: дело SM254
    145 0,0
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Вы когда-нибудь гадали, глядя на бактерию, что там у нее в геноме? Что, если среди множества генов где-то уже записана подсказка к спасению целого вида — и даже экосистемы? Дело SM254 начинается не в лаборатории, а в глубинах шахты, где медь и тьма закалили микроб, способный выживать в экстремальных условиях и, возможно, противостоять возбудителю синдрома белого носа у летучих мышей — грибку, вызвавшему массовую гибель рукокрылых и серьезные экологические последствия. Это рассказ о расследовании, которое пока не дает однозначных ответов, но открывает направление — туда, где микробы могут стать союзниками в восстановлении хрупкого баланса жизни.
    0 Илья Попов 10 ноября 2025
  • Победитель «Био/мол/текст»-2024/2025
    Школьная
    Виртуальные битвы с бактериями: использование вычислительной биологии для поломки белка RpfB и борьбы с <em>Stenotrophomonas maltophilia</em>
    Обзор
    «Сухая» биология Биомолекулы Микробиология
    Виртуальные битвы с бактериями: использование вычислительной биологии для поломки белка RpfB и борьбы с Stenotrophomonas maltophilia
    243 0,0
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Если я скажу, что бактерии между собой разговаривают, возможно, вы мне не поверите. Но на самом деле у них есть целый процесс «переговоров», называемый кворум-сенсингом или чувством кворума. Этот процесс позволяет им работать вместе и таким образом еще сильнее атаковать организм. В этом исследовании представлен стратегический план действий по прерыванию переговоров между бактериями Stenotrophomonas maltophilia, используя биоинформатику. Эти бактерии общаются с помощью особой молекулы — диффузионного сигнального фактора (DSF), регулируемого белком RpfB. Вот этот белок мы и попробуем вывести из строя, собрав свою команду молекул, которые могут тормозить его действие.
    0 Александра Хромова 08 апреля 2025
  • ИИ и генетика: как российские нейросети учатся читать ДНК и создают персонализированную медицину Новость
    «Сухая» биология Биология
    ИИ и генетика: как российские нейросети учатся читать ДНК и создают персонализированную медицину
    2030 0,0
    XXI век стал эпохой искусственного интеллекта — технологии, которая меняет не только цифровой ландшафт, но и фундаментальную науку. Особенно ярко это проявляется в биологии и медицине, где ИИ помогает расшифровывать ДНК, создавать персонализированные лекарства, корректировать поведение и даже проектировать новые формы жизни. Российские учёные не отстают, а где-то даже опережают своих коллег из международного сообщества. На состоявшейся недавно конференции «ИИ в науке» младший научный сотрудник Никита Трофимович Лисенко дал развернутый обзор состояния дел в области. Наша редакция обратилась к Никите Трофимовичу с просьбой написать краткую выжимку его доклада.
    0 Пензар Дмитрий 01 апреля 2025
  • «Био/мол/текст»-2024/2025
    Старение и долголетие (2024)
    Как искусственный интеллект спасает интеллект человеческий
    Обзор
    «Сухая» биология Биотехнологии Нейродегенерация
    Как искусственный интеллект спасает интеллект человеческий
    296 0,0
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: В последние несколько лет искусственный интеллект все прочнее входит в наши жизни. Первая способная рассуждать программа была написана в 1956 году, она могла доказывать теоремы символической логики из «Математических принципов» Уайтхеда и Рассела. Сейчас же системы ИИ применяются, кажется, везде, от рутинной автоматизации офисных процессов до цифрового искусства и построения виртуальных миров. По-настоящему потенциал искусственного интеллекта можно раскрыть в одной из самых непростых сфер — в медицине, ведь несмотря на колоссальный прогресс в последние десятилетия диагностика многих заболеваний по-прежнему остается серьезным вызовом для ученых и врачей. Одна из актуальных на сегодняшний день задач — лечение нейродегенеративных заболеваний, в частности, болезни Альцгеймера. Может ли ИИ помочь преодолеть трудности в диагностике этой болезни? Какие технологии изобретены и применяются уже сегодня? Об этом и поговорим.
    2 Екатерина Серова 01 апреля 2025
  • Победитель «Био/мол/текст»-2024/2025
    Школьная
    ДНК-компьютер: код жизни на службе технологий. Как молекулы решают проблемы хранения данных и сложных вычислений
    Обзор
    «Сухая» биология ДНК
    ДНК-компьютер: код жизни на службе технологий. Как молекулы решают проблемы хранения данных и сложных вычислений
    494 0,0
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: В данной статье автор рассмотрел ДНК-компьютер как альтернативу современным компьютерам в решении задач хранения данных и сложным вычислений, принципы практической реализации, преимущества и недостатки этой технологии, а также перспективы ее дальнейшего развития. Представьте мир будущего. Вся библиотека данных человечества помещается в крошечном контейнере. За считанные секунды люди моделируют сложнейшие биологические процессы и прогнозируют климатические изменения. Из этой статьи вы узнаете, как ДНК-компьютер может стать альтернативой традиционным компьютерам для хранения данных и выполнения сложных вычислений. Мы рассмотрим основы работы этой технологии, ее практическую реализацию, основные преимущества и ограничения, а также оценим перспективы ее дальнейшего развития и потенциального применения в будущем.
    0 Вячеслав Фокин 04 марта 2025
  • «Био/мол/текст»-2024/2025
    Школьная
    Биокомпьютеры и понг: искусственные вычислительные системы на основе нервных клеток
    Новость
    «Сухая» биология Нейробиология
    Биокомпьютеры и понг: искусственные вычислительные системы на основе нервных клеток
    243 0,0
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Стремительное распространение нейросетей в наши дни привело к более углубленному изучению альтернативных полностью цифровым компьютерам моделей. На определенном типе задач человеческий мозг обладает на порядок большей вычислительной производительностью, чем кристаллический процессор. Это и послужило вдохновением для создания системы, базированной на живых нейронах и способной к машинному обучению. Названная органоидом, она контактирует с кремниевым чипом для связи с внешней средой. За счет своей структуры разработка может оказаться эффективнее цифровых компьютеров и стать ведущей в области нейросетей.
    0 Мария Псиола 11 февраля 2025
  • Марк Иванов: «Для чего протеомике нужно машинное обучение» Новость
    «Сухая» биология Биомолекулы Биофизика Личность
    Марк Иванов: «Для чего протеомике нужно машинное обучение»
    370 0,0
    Мы поговорили с Марком Ивановым — выпускником Физтеха, кандидатом физико-математических наук, ведущим научным сотрудником Института энергетических проблем химической физики им. В. Л. Тальрозе в составе Федерального научного центра химической физики им. Н.Н. Семенова РАН. Марк — представитель научной школы директора Института Михаила Горшкова, в которой уже много лет на высоком уровне ведутся исследования в области анализа данных биологической масс-спектрометрии. Совсем недавно наш собеседник стал лауреатом Научной премии Сбера в новой номинации «AI в науке. Науки о жизни». Мы узнали у Марка, какими проектами он занимался в последнее время, и почему протеомике понадобился искусственный интеллект.
    0 Сергей Мошковский 21 января 2025