nzh10@ukr.net | «Биомолекула»

Обзор

Генетика ДНК Секвенирование ДНК
Код жизни: прочесть не значит понять

20742 10,4

Последний год жизни авторы этой статьи посвятили созданию инфраструктуры по получению, хранению и анализу кода жизни — генетической информации, которая записана в молекуле ДНК. Что такое ДНК с точки зрения математика, каковы основные принципы построения компьютерной архитектуры для анализа огромных массивов генетической информации и что ждать в будущем от тотальной прозрачности и доступности теперь уже и нашего индивидуального кода жизни, — обо всём этом расскажет предлагаемая вашему вниманию статья.

2 Егор Прохорчук 02 декабря 2010
Новость

Биология Биомолекулы Биотехнологии
Уникальные силикатные биоматериалы из морских глубин

790 0,4

Результатом совместной работы ученых из Германии, России и Англии стало открытие нового типа коллагена в микроволокнах скелета глубоководной морской губки, структурно отличающегося от коллагена человека или других высших животных. Благодаря этому коллагену, скелет губки приобретает уникальные механические качества.

1 Денис Курек 29 ноября 2010
Обзор

«Сухая» биология Биомембраны Биофизика Структурная биология
Компьютерные игры в молекулярную биофизику биологических мембран

6488 2,0

Двадцатый век стал веком междисциплинарных исследований, когда грань между «классическими» науками практически стёрлась. В XXI столетии тенденция усиливается — слияние «обычной» (хотя тоже междисциплинарной!) молекулярной биофизики и того, что по-английски называют theoretical computer science, породило необыкновенную область — компьютерный, или in silico, эксперимент. В этой статье рассказывается о методической подоплёке подхода in silico и о его конкретном использовании для имитационного изучения «жизни» биологических мембран и населяющих их белковых молекул.

4 Антон Чугунов 23 ноября 2010
Обзор

Биомолекулы Иммунология Процессы Цитология
Неизвестные пептиды: «теневая» система биорегуляции

11562 4,5

Уже давно не вызывает сомнений значимость белков для практически любого аспекта существования жизни. Однако их «младшие братья» — пептиды — привлекают незаслуженно мало внимания, обычно считаясь биологически не такими уж важными. Нет, никто не забывает про исключительную роль пептидов в эндокринной системе и антибактериальной защите. Однако ещё двадцать лет назад нельзя было и заподозрить, что пептидный «фон», присутствующий во всех тканях и традиционно воспринимаемый как «обломки» функциональных белков, также выполняет свою функцию. «Теневые» пептиды формируют глобальную систему биорегуляции и гомеостаза, — возможно, более древнюю, чем эндокринная и нервная системы.

22 Антон Чугунов 11 ноября 2010
Обзор

Биология Биомолекулы Карьера Личность Мнения Наука из первых рук Своя работа
Елена Кравцова: «В детстве я мечтала быть милиционером»

1382 0,7

«Биомолекула» пробует себя в новом жанре: мы представляем интервью с выпускницей львовского биофака Еленой Кравцовой, которая работает пост-доком (научным сотрудником) у Нобелевского лауреата 2004 г. по химии Аарона Чехановера — первооткрывателя убиквитиновой системы деградации белков (его лаборатория находится в израильском институте «Технион», Хайфа, Израиль). Сейчас, когда только отгремели награждения Нобелевскими премиями 2010, мы решили, что будет интересно спросить Елену о том, что это такое — работать с Нобелевским лауреатом?

7 Петр Старокадомский 04 ноября 2010
Новость

Генетика ДНК Персонализированная медицина Секвенирование ДНК
Перевалило за тысячу: третья фаза геномики человека

2846 1,4

Лишь десять лет назад всего двух пальцев было достаточно, чтобы сосчитать отсеквенированные человеческие геномы. В прошлом году для этого нужны были уже пальцы двух рук. Однако сейчас уже непонятно, найдётся ли нужное количество пальцев в роте солдат, чтобы продолжать вести такой подсчёт. Исследовательский консорциум «1000 геномов» сообщает о завершении «пилотной» фазы проекта, в которой получено 179 полных генетических последовательностей, ещё для почти 700 индивидуумов «прочли» только кодирующие участки ДНК, а для двух групп родители–ребёнок (получается, ещё шесть геномов) секвенирование выполнили с особенной тщательностью, чтобы изучить скорость возникновения мутаций. Персональная генетическая медицина всё продолжает приближаться.

6 Антон Чугунов 29 октября 2010
Новость

Генетика ДНК Медицина Микробиология
«Покороче, пожалуйста»: самый маленький ядерный геном

1801 0,9

Чем сложнее устроен организм, тем больше минимальный размер генома, которым он должен обладать, — хотя, одновременно со сложностью, часто сильно возрастает и избыточность. Самыми маленькими геномами среди эукариот (организмов, имеющих ядро) обладают облигатные внутриклеточные паразиты — они, подобно вирусам, многое «заимствуют» у своих хозяев. До недавнего времени рекордсменом считался возбудитель микроспоридоза Encephalitozoon cuniculi — всего 2,9 млн. пар нуклеотидов, организованных в максимум 2000 плотно упакованных генов. Однако теперь пальма первенства перешла родственному организму — E. intestinalis: рекордно малый геном этого паразитического гриба состоит всего из 2.3 миллионов пар нуклеотидов.

2 Антон Чугунов 26 октября 2010
Новость

«Сухая» биология Биомолекулы
Миллисекундный барьер взят!

1363 0,7

Миллиардер Давид Шоу (David Shaw) в исследовательском центре имени себя с командой сотрудников собрал компьютер Anton, разработанный специально под расчеты молекулярной динамики (МД) биологических молекул, и с его помощью провёл расчет динамики нескольких небольших белков длительностью в миллисекунду. Хотя для «непосвящённых» эта цифра может показаться смехотворной, никогда ещё планка вычислительных экспериментов в молекулярной биологии не была установлена столь высоко.

7 Антон Полянский 17 октября 2010
Новость

Биология Биомолекулы Драг-дизайн Нобелевские лауреаты Фармакология
Палладиевая Нобелевская премия по химии (2010)

2262 1,1

Природа является наиболее талантливым химиком — в естественных источниках обнаруживаются вещества, обладающие фантастическим спектром уникальных активностей, многие из которых человечество не отказалось бы поставить себе на службу. Однако природные соединения и устроены намного сложнее, чем может создать современный органический синтез. Нобелевскую премию по химии в 2010 году дали за разработку методик палладиевого катализа, позволяющих очень точно (с минимумом побочных продуктов) «сшивать» атомы углерода, что необходимо для конструкции веществ, приближающихся по своему строению и свойствам к природным молекулам.

1 Антон Чугунов 06 октября 2010
Новость

GPCR Рецепторы Структурная биология Цитология
Структурная геномика меняет курс

539 0,3

Американская программа по структурным исследованиям белков (PSI), за десятилетие своей работы давшая миру более 5000 пространственных структур биологических молекул, для следующего этапа своих изысканий меняет курс. Дело в том, что из этих пяти тысяч лишь 128 белков — это белки человека, а большинство же лежит в базах данных мёртвым грузом, практически не вызывая интереса биологов. Следующая пятилетка программы PSI пройдёт под знамёнами человеческих объектов, и в первую очередь — рецепторов, действующих через активацию G-белков.

5 Антон Чугунов 01 сентября 2010

Поддержите нас в деле просвещения

Больше Биомолекула рассказывает о биологии и медицине — сейчас у нас на сайте несколько тысяч статей. Если вам нравится наш сайт и вы хотите, чтобы он дальше работал, поддержите нас, пожалуйста, посильной суммой — разово или ежемесячно. Ежемесячные платежи предпочтительнее 😀

nzh10@ukr.net 0,0

Поддержите нас в деле просвещения

Публикация отправлена в дорогую редакцию

Что-то пошло не так. Проверьте ваше интернет-соединение