Биомолекулы

Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Мировой фармацевтический рынок захватили инкретиновые препараты, снижающие уровень сахара в крови, подавляющее аппетит и облегчающие процесс похудения. Сегодня такие лекарства — новая реальность, которая раньше казалась пугающей противоречивой идеей. Как изучение ядов в 1980-х позволило почти 30 лет спустя создать класс препаратов-блокбастеров? Что позволило пройти путь от экзотических животных до работающих инъекций для коррекции веса, и почему эти лекарства сейчас становятся ключевым направлением фармразработки?

Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Как только человечество не демонизирует бактерии! И рога, и клыки, и когти им в мультиках и рекламе жидкого мыла пририсовать норовит, и в черный плащ с капюшоном их переодевает, и «черной смертью» называло. Строго говоря, нет ни абсолютно «хороших», ни истинно «злых» бактерий; они, как и все живые существа, просто стараются выжить и оставить потомство. А вред или польза, которые они при этом могут принести другим видам (например, нам, людям) — лишь побочное следствие их существования. Однако всех бактерий объединяет одно: они готовы вести изнуряющую борьбу за свое выживание, находить лазейку, ускользать, и так далее по кругу. Свойственно это и патогенным бактериям, по вине которых каждый год умирают тысячи и миллионы людей. А что, если роли поменяются, и жертвой станет сама бактерия? Более того, паразит пришел изнутри и фактически поработил бактерию, предъявив ей железный ультиматум: «Сосуществуй или умри». Оказывается, и тут нашелся выход: раз нельзя избавиться, то можно приспособить, сделать внутреннего оккупанта шестеренкой в своем механизме — превратить в симбионта. В этой статье речь пойдет о паразите в не совсем привычном понимании этого слова, поскольку им является не живой организм, а ген. Не простой — эгоистичный, ради себя готовый на все. И в этой готовности, вкупе с навыком бактерий в случае надобности идти на компромисс, оказался заложен огромный потенциал, который сейчас исследуется и используется учеными по всему миру. Все это — про системы токсин-антитоксин, или ТА-модули.

Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Любая научная дисциплина в своем развитии расширяется, подобно миниатюрной Вселенной. Точно так же и биохимия, по мере развития, становится шире и соприкасается со все возрастающим количеством смежных дисциплин, которые, на первый взгляд, вообще с ней не связаны. Казалось бы, какое отношение к биологии имеют производство силиконов, фенолформальдегидных смол или полупроводниковых материалов, свойства взрывчатых веществ, добыча самых дорогих металлов в мире, или гуманитарные дисциплины, познающие внутренний мир и поведение людей и мало соприкасающиеся с естественными науками, например, психология? Оказывается, имеют. Ибо познаваемый наукой мир един, а границы между дисциплинами проведены нами ради удобства.

Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Долгое время ученые рассматривали ренин-ангиотензин-альдостероновую систему (РААС) как дирижера, управляющего лишь двумя аспектами нашего организма: нашим артериальным давлением и водно-солевым балансом. Однако последние исследования выявили ее значительное влияние на центральную нервную систему. РААС модулирует нейронные процессы в глубинных структурах мозга, что сказывается на уровне тревожности, резистентности к депрессии и когнитивных функциях в пожилом возрасте.

Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Современные белковые языковые модели позволяют по-новому взглянуть на эволюцию белков, рассматривая ее как направленное движение в латентном пространстве последовательностей. В статье разбирается подход evo-velocity, который использует вероятностные оценки языковых моделей для реконструкции направлений и относительной динамики эволюционных изменений без построения филогенетических деревьев. Показано, как метод воспроизводит известные эволюционные траектории вирусов и белковых семейств, какие предпосылки лежат в его основе и какие ограничения следует учитывать при интерпретации результатов. Подход evo-velocity иллюстрирует, что статистика белковых последовательностей содержит информацию не только о структуре и функции, но и о динамике эволюции.