-
910Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Все организмы на Земле состоят из клеток, и люди достаточно много знают о них: все они окружены липидной мембраной, делятся, сильно различаются между организмами. Тем более удивительно, что до сих пор существуют проблемы с теорией того, как клетка возникла. Скорее всего, появление длинных нуклеиновых кислот предшествовало появлению первых клеток. Этот этап развития часто называют РНК-миром. Про то, как развивались нуклеиновые кислоты и чего они достигли, можно почитать — и даже посмотреть смешные комиксы. Но остается вопрос, чем-то похожий на то, как человек произошел от обезьяны: как из нуклеиновых кислот произошли клетки, и какие при этом были промежуточные стадии, и что нам это может рассказать про биологию клетки сейчас?
-
1728Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Все мы давно привыкли к структуре ДНК. В этой изящной молекуле при помощи одной цепи можно однозначно восстановить вторую. Это свойство не только обеспечивает стабильность и прочность ДНК, но и делает возможными такие процессы, как репликация и транскрипция. По сути, открытие структуры ДНК положило начало современной молекулярной биологии. Однако, несмотря на всю красоту двойной спирали, нуклеотиды могут взаимодействовать и без ее образования. И нет, речь идет не про образование вторичной структуры РНК или ДНК. В новом исследовании изучалось именно взаимодействие между двумя цепями нуклеотидов как в ДНК, лишь с более короткими молекулами длинной в несколько десятков пар нуклеотидов. Только, в отличие от ДНК, связь между цепочками была не стопроцентной, то есть не все нуклеотиды подходили друг к другу.
-
816Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Всего 20 лет назад ученые открыли «молекулу памяти». Ее обнаружили не только у человека, но и у виноградных улиток, мышей — и даже у мух дрозофил. Найденный белок PKMζ помогает создавать воспоминания, которые сохраняются на десятки лет. Также, помимо запоминания, был изучен процесс стирания памяти. В этой статье вы узнаете, как молекула белковой природы может долгие годы поддерживать свое существование и можем ли мы теперь стирать ненужные воспоминания, как это делали спецагенты в популярном фантастическом фильме из 90-х «Люди в черном».
-
2868Одна из самых насущных задач современной медицины — научиться точно и эффективно доставлять терапевтические агенты в мозг пациентов. Задача эта архисложная, так как мозг специально отгородился барьером, чтобы почти ничего в себя не пропускать. О том, как этот барьер преодолевается и какие трудности встают перед адресной доставкой лекарств, пойдет речь в очередной статье спецпроекта «Нейрофармакология».
-
850Логичным этапом стремительного развития алгоритмов искусственного интеллекта, увеличения вычислительных мощностей и развития методов молекулярного анализа стало появление (мульти)омиксных технологий. Считается, что за ними будет победа в битве со сложными мультифакторными и социально значимыми патологиями, но пока это, как говорится, не точно. Так что давайте лучше разберемся, как и зачем используют (мульти)омиксы в биомедицине прямо сейчас — в заключительной публикации нашего спецпроекта.
-
1376Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Каждая клетка старается содержать внутреннее пространство в чистоте и избавляться от утративших свои функции компонентов. Поддержание внутриклеточного белкового гомеостаза в эукариотических клетках преимущественно осуществляется за счет убиквитин-протеасомной системы, обеспечивающей селективную деградацию субстрата, модифицированного убиквитином — маленьким, но распространенным сигнальным белком. В настоящее время известно, что различные модификации субстрата убиквитином опосредуют и другие клеточные процессы. Как же устроен убиквитиновый код? Что лежит в основе разнообразия сигналов которые формируются на его основе? Как осуществляется убиквитин-зависисмая деградация белка в протеасомах? С ответами на эти вопросы, а также с различными типами протеасом и их главными помощниками мы предлагаем вам познакомиться в этой статье.
-
615Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: «Сенсация! Сенсация! Ученые создали биологические клетки и научили их общаться!». Так мог бы звучать заголовок в желтой прессе, если бы они решили опубликовать данные исследования, которое провели ученые из Оксфорда и университетского колледжа Лондона. Да, звучит действительно потрясающе! Неудивительно, что эта работа опубликована в журнале Nature Chemical Biology и очень активно цитируется. Разберемся же в том, что такого необычного придумали ученые и в чем польза их изобретения.
-
230В этой книге приведены основные сведения о генетике как науке. Много внимания уделено истории, мало — мутациям. Есть информация о некоторых сферах применения, и даже сделана попытка рассказать школьникам младшего школьного возраста о системе CRISPR-Cas9. Согласитесь, амбициозно? Получилось ли у авторов справится с задачей, предлагаем решить самостоятельно.
-
На фоне конкуренции между Microsoft, Google, Meta, Amazon и другими техногигантами за звание обладателя лучшего чат-бота, достижения аналогичных моделей в биохимии и структурной биологии остаются слегка за кадром. А успехи есть, и еще какие! В этой статье спецпроекта «Искусственный интеллект в биологии» «Биомолекула» постарается исправить несправедливость и расскажет, как работают «большие языковые модели» на последовательностях биомолекул и к чему их можно применить в биологии. Мы также обсудим аналогии между биополимерами и привычными нам текстами, которые позволяют применять языковые модели к белкам и ДНК. Не забудем поговорить и про нашумевший AlphaFold — причем будем его не только хвалить! Ну и как всегда, поделимся кейсами, которые уже меняют структурную и другие области биологии.
-
Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Ответ на поставленный вопрос будем искать в светочувствительных системах человека и приматов; мышей и птичек; комаров и бабочек; простейшего многоклеточного животного трихоплакса; растения Арабидопсис; в бактериальных генах, которые повлияли на формирование зрения многоклеточных; и даже у грибов Aspergillus nidulans и Neurospora crassa. В этой статье представлены данные последних исследований спектральной чувствительности грибов, пластинчатых животных и человека, а также рассмотрены реакции ДНК на ультрафиолетовый свет разных диапазонов и участие в этом «цинковых пальцев». Наличие бактерий-симбионтов в синцитиальных сетях грибов и трихоплакса и успехи в «программировании» бактериальных ДНК создают предпосылки для использования этих организмов как модельных, а также создания существ, которых ранее не было в природе.
