Подписаться
Оглавление
Биомолекула

SciNat за июль 2026 #1: оптический «аудит» старения, секретное оружие древних симбионтов и новые мишени против малярии

SciNat за июль 2026 #1: оптический «аудит» старения, секретное оружие древних симбионтов и новые мишени против малярии

  • 8
  • 0,0
  • 0
  • 0
Добавить в избранное print
Дайджест

На обложке последнего выпуска Science изображена Koompassia excelsa, одно из самых высоких растений в мире (уступает только хвойным породам). Существует мнение, что большая высота мешает воде и питательным веществам полноценно доходить до кроны дерева. Исследования таких деревьев, распространенных в странах Юго-Восточной Азии, показывают, что они регулируют свою гидравлическую систему по мере роста, что свидетельствует об их устойчивости к засухе. — Height does not impair the hydraulic system of the tallest tropical Dipterocarp trees.

В новом выпуске дайджеста «Биомолекулы» мы заглянем на передний край науки. Вы узнаете, как иммунопептидомика помогает создавать универсальные вакцины от малярии, а ИИ рушит прежние теории о старении полушарий мозга. Мы разберем, как мирные бактерии тлей используют молекулярное оружие предков-паразитов, и почему опухоли удается «ослепить» иммунную систему в лимфоузлах. Кроме того, расскажем о методах изучения старения in vivo и о том, как заставить рецепторы работать без побочных эффектов.

Дайджест вышел при поддержке Министерства науки и высшего образования Российской Федерации в рамках инициативы «Десятилетие науки и технологий».
Минобрнауки России

Министерство образования России активно содействует популяризации науки, поддерживает молодых исследователей и формирует передовую инфраструктуру для отечественных институтов и университетов.


Десятилетие науки и технологий

«Десятилетие науки и технологий» — это масштабная государственная инициатива в России, проводимая с 2022 по 2031 год. Проект включает в себя комплекс инициатив, проектов и мероприятий. Все они направлены на усиление роли науки и технологий в решении важнейших задач развития общества и страны.

Иммунология

Развитие и тканевая специализация В-клеток памяти: ключ к вакцинам нового поколения

В основе работы любой вакцины лежит способность иммунной системы формировать долгосрочную память, однако молекулярные механизмы этого процесса до сих пор полностью не изучены. Именно В-клетки памяти обеспечивают устойчивый защитный иммунитет, запуская быстрый вторичный ответ антител при повторной встрече с патогеном.

На этой неделе в журнале Science Immunology вышел подробный обзор, который систематизирует последние данные о клеточном происхождении, регуляторных путях и тканевой специализации этих критически важных клеток. Авторы обзора детально разбирают, как В-клетки памяти зарождаются из самых разных предшественников и проходят сложный путь развития.

Формирование идентичности этих клеток зависит от тонкого баланса внешних сигналов и внутренних молекулярных программ. Ученые обобщили данные о транскрипционных факторах и эпигенетических изменениях, которые заставляют обычный лимфоцит превратиться в долгоживущую клетку иммунологической памяти. Понимание этих регуляторных путей позволяет исследователям не только наблюдать за иммунным ответом, но и учиться управлять им, «подталкивая» лимфоциты к нужному вектору развития.

Особое внимание в работе уделено резидентным в тканях В-клеткам памяти (tissue-resident memory B cells), локализованным непосредственно в дыхательных путях. Скопления клеток в слизистых оболочках играют ключевую роль в защите от респираторных угроз. Эти тканеспецифичные популяции первыми встречают вирусы и бактерии, передающиеся воздушно-капельным путем, и блокируют их еще на дальних подступах к организму.

Обобщение знаний о тонкой работе нашего иммунитета открывает новые горизонты для клинического применения и создания вакцин следующего поколения. Главный практический вывод обзора можно сформулировать так: понимая, как устроена биология и локальная регуляция резидентных В-клеток в дыхательных путях, ученые смогут разрабатывать препараты, которые формируют мощный местный иммунитет прямо в «воротах» инфекции. — Molecular and tissue regulation of memory B cells, «Биомолекула»: «ЗОЖ — Защита От Жалоб на здоровье», «Иммунитет: борьба с чужими и… своими», «SciNat за март 2026 #3».

Формирование и активация тканерезидентных В-клеток памяти

Рисунок 1. Формирование и активация тканерезидентных В-клеток памяти (BRM) в легких. При первичной инфекции лимфоциты из лимфоузлов заселяют ткани дыхательных путей, разделяясь на популяцию вокруг бронхов (iBALT) и популяцию в альвеолах. Повторная встреча с патогеном запускает двухэтапную оборону: альвеолярные BRM быстро секретируют IgG в очаге заражения при поддержке макрофагов и NK-клеток, а бронхиальные iBALT-клетки чуть позже подключают Т-хелперы для масштабной наработки защитных антител IgA и IgG.

Онкология

Секвенирование одиночных клеток помогло найти биомаркер для борьбы с метастазами в лимфоузлы

Метастазы в лимфатические узлы (ЛУ) служат основным предиктором смертности при большинстве сóлидных (плотных) опухолей, однако у ученых до сих пор не было надежных биомаркеров для предсказания течения таких осложнений. Рак щитовидной железы известен своей экстремально высокой склонностью к раннему поражению лимфатических узлов.

Чтобы выяснить, как опухоль перестраивает локальные защитные системы организма в процессе экспансии, международная группа исследователей изолировала инфильтрирующие опухоль лейкоциты из первичных очагов и парных метастатических лимфоузлов пациентов. С помощью высокоточного метода секвенирования РНК отдельных клеток (scRNA-seq) и мультиплексной иммуногистохимии ученые впервые смогли детально сравнить клеточный ландшафт первичной опухоли и ее метастазов. Анализ показал, что при переходе из щитовидной железы в лимфоузел раковые клетки и окружающие их макрофаги радикально меняют свой фенотип. Оказалось, что тироциты (клетки ткани щитовидной железы) и ассоциированные с опухолью макрофаги (TAMs) синхронно снижают экспрессию множества рецепторов к воспалительным цитокинам, среди которых ключевыми оказались TNFRSF12A и CX3CR1. Этот позволяет клеткам метастаз не реагировать на сигналы иммунной системы и закрепиться на новой территории, избегая развития воспалительного процесса, который может быть спровоцирован со стороны макрофагов. Параллельно с этим, опухолевые клетки в лимфоузлах подавляют работу иммунитета. Исследователи зафиксировали в метастатических ЛУ резкое повышение концентрации регуляторных Т-клеток (Tregs). Роль этих клеток в норме — гасить избыточное воспаление, но внутри метастазов они начинают активно подавлять Т-клеточную цитотоксичность, обезоруживая Т-киллеры, которые должны были уничтожить раковые клетки. Однако часть инфильтрирующих опухоль лимфоцитов в лимфоузлах, напротив, переходила в сверхактивное состояние, резко увеличивая экспрессию рецептора интерлейкина-7 (IL7R).

Ученые обнаружили прямую клиническую корреляцию: высокая экспрессия генов, кодирующих IL7R в пораженных лимфоузлах, строго связана с улучшением выживаемости пациентов и хорошими исходами болезни. Рецептор IL7R может служить надежным биомаркером, помогающим онкологам разделять пациентов на группы: тем, у кого этот показатель высок, можно проводить менее агрессивное лечение, тогда как низкий уровень IL7R потребует немедленной интенсификации терапии. Авторы подчеркивают, что обнаруженные механизмы ухода от иммунного ответа и маркеры активации, скорее всего, универсальны для метастазирования любых сóлидных опухолей. — Single-cell transcriptomic analysis reveals tumor-immune determinants of lymph node colonization and progression in thyroid cancer, «Биомолекула»: «Одноклеточное секвенирование: разделяй, изучай и властвуй», «Опухолевые разговоры, или Роль микроокружения в развитии рака».

Дизайн эксперимента и клеточный ландшафт метастазов рака щитовидной железы

Рисунок 2. Дизайн эксперимента и клеточный ландшафт метастазов рака щитовидной железы. Ученые выделили иммунные клетки из парных образцов первичной опухоли и лимфоузлов пациентов для поклеточного РНК-секвенирования (scRNA-seq), подтвердив результаты на валидационной когорте с помощью мультиплексной иммуногистохимии. Биоинформатический анализ более 31 тысячи клеток (б, в) выявил шесть основных типов клеток. Сравнение клеточного состава (г) показало, что при колонизации лимфоузлов опухоль перестраивает микроокружение, снижая долю защитных Т-киллеров в пользу клеток-супрессоров.

Биохимия

Рецептор с двойным дном: аллостерические агонисты GPCR научили управлять клетками избирательно

Рецепторы, сопряженные с G-белками (GPCR), присутствуют на поверхности множества типов клеток и регулируют десятки физиологических процессов. Поиск регуляторов для многих GPCR осложнен большим количеством изоформ этих рецепторов, распространенных в разных тканях, что может приводить к появлению побочных эффектов при их системной регуляции. Рецептор свободных жирных кислот 2 (FFAR2) — как раз один из таких «проблемных» GPCR. В норме он активируется короткоцепочечными жирными кислотами и управляет метаболизмом, иммунитетом и воспалительными процессами.

Фармакологи уже давно изучают возможности регуляции этого рецептора, но для них важно «настроить» его точную работу. Чтобы решить эту проблему, международная команда исследователей под руководством Натальи Барки (Natasja Barki) создала уникальную мышиную модель DREADD (модифицированный дизайнерский рецептор) и протестировала три класса синтетических аллостерических агонистов; результаты были опубликованы в журнале Science Signaling.

Фармакологи обнаружили функциональную селективность у FFAR2. Свойство, характерное для многих GPCR, когда разные молекулы заставляют один и тот же рецептор запускать противоположные биохимические пути (bias-сигналинг). Исследователи выяснили, что синтетические лиганды управляют рецептором через активацию G-белков семейств Gq и Gi, причем этот эффект жестко привязан к конкретному типу ткани. В толстой кишке и поджелудочной железе синтетическое соединение 187 активировало Gq-путь, стимулируя выброс важнейших кишечных гормонов (GLP-1 и PYY) и секрецию инсулина. Любопытно, что этот эффект полностью блокировался другим лигандом (AZ1729), смещающим сигнализацию в сторону Gi-белка. В жировой ткани и костном мозге соединения 187 и AZ1729 действовали совместно через Gi-путь, ускоряя миграцию нейтрофилов и обеспечивая мощный антилиполитический эффект (торможение распада жиров), в то время как третий лиганд — 4-CMTB — здесь оказался абсолютно неэффективен. Также учеными был описан альтернативный механизм: лиганд 4-CMTB связывался со своим обособленным участком рецептора и вызывал изолированные эффекты, зависимые исключительно от Gq-сигнализации в кишечнике и поджелудочной железе.

Эти данные открывают возможность для создания более селективных регуляторов рецептора FFAR2, что позволит получить мощный терапевтических эффект и избежать побочных эффектов, минимизируя риски для пациентов. — Allosteric ligands with distinct properties uncover tissue-specific physiological regulation mediated by free fatty acid receptor 2, «Биомолекула»: «Аллостерические регуляторы GPCR: ключи от всех замков», «Пособие по слежке за GPCR, или как флуоресценция поможет найти новые лекарства».

Метаболомика

Подсветить все, что в тени: оптическая визуализация раскрывает скрытые механизмы старения

Оптическая метаболическая визуализация процессов старения и патологий млекопитающих in vivo

Рисунок 3. Оптическая метаболическая визуализация процессов старения и патологий млекопитающих in vivo.

(а) — возрастные ПЭТ-карты головного мозга демонстрируют прогрессирующее снижение молекулярного транспорта через гематоэнцефалический барьер (ГЭБ) и падение кровотока с увеличением возраста;
(б) — многомодальная безмаркерная микроскопия (SRS/SHG/MPF) фиброза печени у мышей: 12-недельный мониторинг фиксирует отложение коллагена вокруг центральных вен и накопление триглицеридов;
(в) — двухфотонная (2PEF) и SHG-визуализация кожи человека на разной глубине: у пожилых людей (70–75 лет) наблюдается деградация и перестройка эластина (голубой) и коллагена (красный) по сравнению с молодой кожей (18–25 лет).

Старение организма неразрывно связано с глобальной перестройкой метаболических путей. Мы уже знаем очень много о тех изменениях, которые возникают в организме человека с возрастом, однако до сих пор у ученых не было инструмента, способного наглядно показать эти процессы в динамике. Проблема в том, что классические методы биохимии требуют разрушения клеток, а традиционное окрашивание красителями искажает реальную картину метаболизма. Исследователям крайне сложно визуализировать и оценивать производство энергии, биосинтез и молекулярный обмен непосредственно внутри живых тканей, не нарушая их биологических функций.

Цель авторов нового фундаментального обзора — обобщить последние прорывы в области оптической метаболической визуализации и показать, как эти методы меняют современную геронтологию. Ученые сфокусировались на передовых технологиях мультимодальной нелинейной оптической микроскопии. Их главной задачей было продемонстрировать, как технологии, полученные на стыке физики и биологии, позволяют оценить изменения метаболизма на самых разных моделях старения — от отдельных клеток до целых живых организмов.

Главный вывод исследователей заключается в том, что оптическая визуализация позволяет проводить безмаркерный (label-free) аудит стареющих тканей непосредственно in vivo. Метод улавливает флуоресцентные сигналы от естественных метаболитов (таких как НАДН и ФАД), позволяя фиксировать ранние энергетические сдвиги без введения токсичных меток. Ученые доказали, что эта технология дает уникальную детализацию: она способна регистрировать возрастные изменения на разных уровнях организации жизни — от тонких взаимодействий на уровне внутриклеточных органелл (например, митохондрий) до масштабного ремоделирования целых органов. В перспективе эта технология может стать мощным практическим инструментом для клинической прецизионной медицины. Ученые надеются, что оптический мониторинг метаболизма позволит врачам диагностировать заболевания на самых ранних, еще доклинических стадиях. Более того, метод можно будет применять при тестировании новых геропротекторов: он позволит в реальном времени оценивать, насколько эффективно лекарство омолаживает метаболизм тканей, что поможет существенно увеличить продолжительность здоровой жизни людей. — Illuminating aging with multimodal optical metabolic imaging, «Биомолекула»: «Большие гонки, или Открытые инновации для новых молекул».

Экология

Как бактерии-симбионты тлей взламывают клетки хозяина

Жизненный цикл и механизм вертикальной передачи эндосимбионта Buchnera у тлей

Рисунок 4. Жизненный цикл и механизм вертикальной передачи эндосимбионта Buchnera у тлей.
(а)— схема колонизации: бактерии выходят из разрушающихся материнских бактериоцитов и проникают в развивающиеся эмбрионы (стадия 7), формируя новые специализированные клетки — бактериоциты и синцитиальные бактериомы хозяина;
(б) — микрофотография флуоресцентного окрашивания (DAPI — синий, Buchnera — желтый): наглядная визуализация массивных скоплений бактерий внутри материнского организма и их успешная миграция в бактериом развивающегося эмбриона.

Внутриклеточные бактериальные симбиозы возникали в ходе эволюции эукариот бесчисленное количество раз, однако молекулярные механизмы, позволяющие прокариотам проникать в клетки хозяина, долгое время оставались загадкой. На примере бактерии Buchnera — облигатного эндосимбионта тлей — ученые давно расшифровали геном и метаболический вклад бактерий в жизнь насекомого. Тем не менее, исследователи не понимали, каким образом эти некультивируемые микроорганизмы физически проникают в эмбриональные клетки тли и как им удается подавлять локальный клеточный иммунитет хозяина, избегая уничтожения.

Цель авторов новой работы — раскрыть конкретные белковые факторы, с помощью которых мирная бактерия проникает в ткани насекомого. Исследователи стремились выяснить, используют ли древние мутуалистические (полезные для обеих сторон) эндосимбионты те же самые инструменты, что и опасные бактериальные патогены, или же за миллионы лет совместной эволюции они выработали принципиально новые, уникальные механизмы колонизации.

В ходе эксперимента ученые сфокусировались на ранее неизученном бактериальном белке, который они назвали SyeA. С помощью иммунофлуоресцентной микроскопии исследователи проследили за процессом передачи Buchnera, которая в природе происходит путем выхода бактерий из специализированных материнских клеток и их последующего поглощения клетками эмбриона. Чтобы доказать критическую важность этого фактора, авторы искусственно снизили экспрессию гена syeA у бактерий и зафиксировали, как это повлияет на эмбриональное развитие хозяина.

Результаты показали, что белок SyeA оказался ключевым фактором «пропуска» бактерии внутрь эмбриональных клеток тли. Микроскопия выявила резкое повышение уровня SyeA в месте контакта, что сопровождалось мгновенным накоплением актина клеток хозяина для поглощения бактерии. Белок локализовался вне мембраны, прямо в цитоплазме тли. При искусственном подавлении экспрессии syeA колонизация эмбрионов полностью нарушалась. Более того, у таких эмбрионов резко возрастала активность лизосом, которые начинали воспринимать бактерий как врагов и массово разрушали Buchnera, приводя к гибели симбионтов и сбою в развитии самого насекомого.

Авторы сделали вывод, что критически важный для симбиоза белок SyeA представляет собой эволюционный «рудимент» патогенного происхождения. Анализ аминокислотной последовательности белка подтвердил, что SyeA гомологичен секретируемым эффекторам опасных бактериальных патогенов. Это доказывает, что в далеком прошлом предки Buchnera были агрессивными паразитами и проникали в клетки силой. Однако в процессе эволюции хозяин перехватил контроль над этим процессом, первоначальный сложный механизм патогенности разрушился, а старое бактериальное оружие превратилось в мирный инструмент, необходимый для выживания обоих организмов. — A secreted endosymbiont protein essential for colonizing host cells, «Биомолекула»: От сложного к простому: трудности симбиогенеза, Как появились митохондрии (рассказ, похожий на сказку).

Физиология

Старение мозга: ИИ опроверг классическую теорию увядания полушарий

Латерализация (неравномерность) функций полушарий считается особенностью человеческого мозга, однако анатомические основы его старения до сих пор оставались одной из главных нерешенных проблем системной нейробиологии. На протяжении последних сорока лет в науке доминировала модель «старения правого полушария». Она утверждала, что правая половина мозга «изнашивается» первой, поскольку у пожилых людей быстрее ухудшаются пространственное мышление и координация, в то время как вербальные навыки левого полушария долго остаются сохранными. Проблема заключалась в том, что все эти выводы строились лишь на поведенческих тестах, а реальная динамика структурных изменений ткани мозга в масштабах популяции оставалась скрытой.

Цель авторов новой работы — применить многомерное машинное обучение для анализа колоссальных массивов МРТ-данных и выявить истинные закономерности глобальной асимметрии мозга при старении. Исследователи стремились сопоставить реальные анатомические изменения коры и белого вещества с когнитивными способностями людей, а также выяснить, как эта асимметрия трансформируется при развитии нейродегенеративных заболеваний и у носителей опасных генетических мутаций.

С помощью ИИ ученые обнаружили паттерн «старения левого полушария», который полностью опровергает классическую догму. Нейросети проанализировали томограммы тысяч пациентов и показали, что на физическом и анатомическом уровне именно левое полушарие усыхает и теряет объем быстрее правого. Сохранение речевых функций при этом — не признак «молодости» левой стороны, а результат жесткой функциональной компенсации, когда увядающее левое полушарие мобилизует все скрытые резервы. Более того, исследователи выявили специфические, ранее неизвестные искажения этой асимметрии у пациентов с болезнями Альцгеймера и Паркинсона, а также у здоровых носителей аллеля APOE ε4, имеющих высокий генетический риск слабоумия.

В перспективе глобальная асимметрия мозга может стать важнейшим динамическим биомаркером в прецизионной геронтологии. Внедрение этих ИИ-моделей в клиническую практику позволит неврологам по обычному снимку МРТ фиксировать аномальные сдвиги асимметрии еще до того, как у пациента проявятся первые клинические симптомы нейродегенерации. Это откроет возможность начинать превентивную терапию болезни Альцгеймера на годы раньше, сохраняя когнитивное здоровье человека. — Variations of global brain asymmetry are associated with aging and related diseases, «Биомолекула»: «На руинах памяти: настоящее и будущее болезни Альцгеймера».

Эпидемиология

Один удар по двум плазмодиям: найдены белки для межвидовой вакцины против малярии

Малярия остается одной из главных угроз глобальному здравоохранению: в 2024 году было зарегистрировано 282 миллиона случаев заражения, унесших жизни 610 тысяч человек, преимущественно детей. Несмотря на то, что ВОЗ уже одобрила первые вакцины (RTS,S и R21), они нацелены исключительно на преэритроцитарную стадию самого опасного патогена — Plasmodium falciparum. «Биомолекула» уже много лет следит за развитием исследований в этой области. Создание универсальной вакцины до сих пор остается проблемой из-за дефицита надежных Т-клеточных мишеней и биологических различий между видами плазмодиев, включая широко распространенный в Азии и Америке Plasmodium vivax. Ключ к решению этой проблемы авторы нового исследования решили искать в особенностях биологии P. vivax. Этот паразит заражает исключительно ретикулоциты (предшественники эритроцитов), которые, в отличие от зрелых эритроцитов, еще сохраняют способность синтезировать белки.

Ранее эта же команда ученых доказала, что инфицированные ретикулоциты экспрессируют молекулы человеческого лейкоцитарного антигена класса I (HLA-I). Целью новой работы стало проведение масштабного поиска (иммунопептидомики) этих молекул, чтобы выяснить, какие именно фрагменты белков плазмодия они презентируют («показывают») Т-киллерам (CD8+), и найти среди них универсальные мишени для будущей вакцины.

В ходе исследования ученые идентифицировали 453 уникальных пептида, соответствующих 166 белкам малярийного плазмодия. Настоящим прорывом стало обнаружение 75 высококонсервативных белков «домашнего хозяйства» (housekeeping proteins). Эти белки постоянно экспрессируются на разных стадиях жизненного цикла паразита и практически идентичны у разных видов плазмодиев. Иммуногенность найденных эпитопов подтвердилась как на образцах крови людей, инфицированных P. vivax и P. falciparum, так и в опытах на приматах. Более того, два отобранных антигена успешно индуцировали защитный CD8+ Т-клеточный иммунитет у грызунов in vivo.

Полученные результаты открывают прямую дорогу к созданию первой универсальной межвидовой и межстадийной вакцины против малярии. Обнаружение стабильных белков «домашнего хозяйства», которые одинаково эффективно распознаются иммунной системой при заражении разными видами плазмодия, позволяет преодолеть главную проблему противомалярийных препаратов — высокую мутагенность паразита. В ближайшей перспективе эти антигены могут быть использованы для разработки мРНК-вакцин нового поколения, способных обучить Т-киллеры уничтожать зараженные клетки крови и полностью искоренить ключевые виды малярии. — Identification of cross-stage, cross-species malaria CD8+ T cell antigens, «Биомолекула»: «Вакцина против малярии будет создана в ближайшем будущем».

Комментарии

0
Ссылка скопирована в буфер обмена