-
Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Создание новых белков с заранее выбранной функцией? Что? Да!!! Нужна вакцина? Дизайним белок! Нужно вылечить рак? Дизайним белок! Звучит очень заманчиво, но реально ли это? Rosetta — программа, разработанная в Институте белкового дизайна под руководством Дэвида Бейкера, дает утвердительный ответ на этот вопрос. С ее помощью ученым удалось справиться с целиакией, создать лекарство широкого спектра от вируса гриппа и научить иммунные клетки находить и убивать раковые. Несколько компаний сейчас занимаются выводом этих разработок на рынок. В этой статье мы разберемся, как работает Rosetta и какие проблемы белковый дизайн позволяет решать уже сегодня.
-
359На этой неделе в Nature и Science очень много интересных статей по нейробиологии. Из них можно узнать, как рецепторы к дофамину влияют на принятие рискованных решений у крыс, что даёт электрический контроль над гипоталамусом и какая часть обонятельной коры реагирует на появление хищника. Кроме того, бесспорный хит этой недели сообщение о супер-маленьком геноме, слепленном командой известного биолога Крейга Вентера.
-
Работа клетки подобна работе оркестра, только вместо музыки она производит белки и РНК. Для правильного функционирования всей системы каждый ген должен «вступать» в нужный момент, скоординировано с другими генами, и давать столько продукта, сколько потребуется. Это значит, что транскрипция каждого гена должна происходить в определенное время и с определенной интенсивностью. Дирижерами процесса выступают специальные белки — факторы транскрипции. Партитура при этом записана в самой ДНК: партию определяют регуляторные последовательности, с которыми транскрипционный фактор связывается и в результате усиливает или ослабляет транскрипцию соответствующих генов. Замены в таких последовательностях могут приводить к изменению силы связывания и, как следствие, фальши в транскрипции: неверной или не вовремя сыгранной партии конкретного гена. Современные биологи активно пытаются решить вопрос о том, как устроены эти последовательности для каждого транскрипционного фактора и какие мутации в них будут влиять на связывание с белком. Одним из подходов к расшифровке клеточной партитуры является изучение аллель-специфичного связывания: когда варианты регуляторной последовательности, унаследованные от матери и от отца, различаются, можно изучать, с каким из них транскрипционный фактор связывается лучше. Несмотря на прозрачную постановку задачи, на пути к ее решению возникает ряд проблем. Мы придумали, как их преодолеть, и обнаружили сотни тысяч событий аллель-специфичного связывания, попутно показав их вклад в предрасположенность ко многим заболеваниям. Работа недавно опубликована в журнале Nature Communications.
-
Самый конец 19 века, Техас, маленькая девочка интересуется природой, но ее окружение этого увлечения не понимает. То и понятно — конец 19 века. Графический роман про девочку Кэлпурнию расскажет о ее первых шагах в изучении природы, понимании того, как проводить хоть и простые, но научные эксперименты, о ее восхищении наукой. И все это в контексте того времени и того окружения. Этот момент особенно ценен, потому как ничто нельзя рассматривать исключительно взятым отдельно, а только с пониманием, как, когда и в каких обстоятельствах происходило. Но этот же момент усложняет чтение и размывает основную тему повествования.
-
Видео на конкурс «Био/Мол/Текст»: 25 лет жизни — именно столько каждый из нас, в среднем, тратит на сон. Безвозвратно потерянное время, которое мы могли бы потратить на массу полезных занятий. Как же эволюция могла допустить такую глупость? Или сон гораздо важнее, чем мы думаем? Зачем же мы спим? К каким последствиям ведет недостаток сна? Что делать, чтобы лучше высыпаться? И как сон регулярно спасает нас от смерти? Ответы — в видеоролике Александра Тышковского.
-
Полвека назад человек вплотную приблизился к возможности примерить на себя роль творца, творца самого настоящего, способного целенаправленно наделять создаваемые им организмы нужными чертами. Научившись напрямую манипулировать генами, из селекционера он превратился в инженера. Что же подвело его к этой черте и как изменился мир после? Предлагаем заглянуть в историю генной инженерии: вспомнить важнейшие открытия, сформировавшие ее теоретическую основу и методический арсенал, поразмышлять над этическими вопросами и оценить вес генно-инженерных разработок в денежном эквиваленте.
-
313Свежие выпуски авторитетных научных журналов заинтересуют любителей палеонтологии (расскажем о древних гоминидах Индонезии и о первых людях, заселивших Арктику), нейробиологии (можно узнать о причинах повреждения миелина при ишемии и о нейробиологических основах обучения пению), а также микробиологии (пишут о наследуемых свойствах микробиома, а также о том, как микробы разных групп помогают организму противостоять патогенным вирусам). Как всегда, найдется много интересного и для тех, кто любит структурки и молекулярку. Enjoy!
-
Последний год жизни авторы этой статьи посвятили созданию инфраструктуры по получению, хранению и анализу кода жизни — генетической информации, которая записана в молекуле ДНК. Что такое ДНК с точки зрения математика, каковы основные принципы построения компьютерной архитектуры для анализа огромных массивов генетической информации и что ждать в будущем от тотальной прозрачности и доступности теперь уже и нашего индивидуального кода жизни, — обо всём этом расскажет предлагаемая вашему вниманию статья.