-
Не успев пережить триумф нейросетей (в лице AlphaFold) в предсказании строения белков, структурная биоинформатика взялась за обратную задачу: подбор последовательности для заданной трехмерной укладки. Но решение этой проблемы пока сдерживается фундаментальными ограничениями, присущими и самой программе AlphaFold. В этой колонке я постараюсь объяснить, почему нейросети в структурной биоинформатике не стоит считать панацеей.
-
Проанализировав ядерный геном стеллеровой коровы — морского млекопитающего, некогда обитавшего в северной Пацифике, — ученые пришли к выводу, что процесс вымирания этого вида начался задолго до прибытия человека современного типа в Берингию. Показано также, что последняя популяция этого животного, обнаруженная российскими моряками на побережье Командорских островов, была обречена на вымирание вследствие низкого генетического разнообразия.
-
В серии «Зверотерапия» пополнение — вышла новая книга про Ленивца! Если вы хоть раз задумывались, как классно быть ленивцем, то она вам придется по душе — скорее читайте! История, как обычно для этой книжной серии, в первую очередь — для детей. И она про ленивца, его друзей по лесу и про разворачивающийся там... пожар! Но история также полна смыслов, фраз, открытых вопросов — и подойдет для взрослых. А еще мы взяли интервью у авторов и позадавали им разнообразные вопросы!
-
368На этой неделе мы узнаем, как сигнальный путь JAK-STAT связан с развитием атеросклероза, как можно «вытравить» латентный ВИЧ из клеток и почему средство от проказы может быть новым словом в терапии COVID-19. Также мы разберемся в последних новостях из мира иммунологии, узнаем, как можно выращивать зародыши вне матки, и выясним, почему клеточные сенсоры ДНК не реагируют на хроматин, хотя охотно липнут к нему.
-
В последние годы в европейских странах, США и СНГ началась активная кампания по запрету так называемых «легальных» курительных смесей. Первой в список запрещённых препаратов попала сальвия; в России также были запрещены составы на основе голубого лотоса. На очереди оказались смеси под общим названием «Spice», в которых государственные контролирующие органы заподозрили наличие синтетических аналогов алкалоидов конопли (марихуаны). Немецкие исследователи провели независимое изыскание, подтвердившее эти опасения.
-
На фоне конкуренции между Microsoft, Google, Meta, Amazon и другими техногигантами за звание обладателя лучшего чат-бота, достижения аналогичных моделей в биохимии и структурной биологии остаются слегка за кадром. А успехи есть, и еще какие! В этой статье спецпроекта «Искусственный интеллект в биологии» «Биомолекула» постарается исправить несправедливость и расскажет, как работают «большие языковые модели» на последовательностях биомолекул и к чему их можно применить в биологии. Мы также обсудим аналогии между биополимерами и привычными нам текстами, которые позволяют применять языковые модели к белкам и ДНК. Не забудем поговорить и про нашумевший AlphaFold — причем будем его не только хвалить! Ну и как всегда, поделимся кейсами, которые уже меняют структурную и другие области биологии.
-
В 2020 году издательство «Кит» выпустило детский альманах «Звездная пыль под подушкой». Что будет, если посмотреть на мир с непривычной стороны? Отдалиться, чтобы увидеть большое, или же, наоборот, приблизиться, чтобы увидеть малое? Как тогда изменится наш мир? Можно ли разглядеть невидимое, и кого мы найдем под собственной подушкой, если внимательно присмотримся? На многие загадочные вопросы читатели смогут найти ответы в этом замечательном альманахе.
-
417Новые выпуски Nature и Science припасли интересные и удивительные научные новости о жизни Земли и других планет Солнечной системы! Любознательный читатель сможет узнать о том, как иммунная система влияет на выбор еды, Helicobacter pylori вызывает рак желудка, о генетическом секрете бессимптомности COVID-19 и даже о болезнях суставов вымерших кошек и волков. Приятного чтения!
-
914Случай 66-летней жительницы Великобритании широко разошелся по новостным лентам и удивил многих. У пациентки, которая в течение жизни почти не жаловалась на боль и редко использовала обезболивающие, обнаружили мутации, нарушающие работу фермента, который разрушает эндоканнабиноиды. В результате у нее в крови циркулирует естественный анальгетик. Возможно, ученые открыли перспективное направление для разработки новых лекарств, избавляющих от боли.
-
Что скрывают от нас растения, а точнее — тайно выставляют напоказ? Насколько различны способы опыления и какими именами их величают ученые? Какими потрясающими свойствами обладают хорошо знакомые нам растения? Кто обманывает растения, а кого, наоборот, обманывают они? Обо всем этом — и о многом другом — читайте в книге Майкла Аллаби «Скандальная правда о сексуальной жизни растений», изданной в маленьком, но перспективном издательстве «Портал».
-
Самое замечательное открытие этой недели — CRISPR-подобная иммунная система мимивирусов, помогающая им защищаться от вирофагов. Еще из интересного: в Nature — подборка статей о когнитивном здоровье, исследование регенерации конечностей у аксолотля, а также описание нейронов, которые помогают спящему животному помнить, где оно находится. В Science расскажут о том, как взаимодействия частей мозга связаны с мотивами альтруистических действий, о том, как в геноме возникают новые регуляторные участки и о том, какие механизмы побуждают клетку превращаться в нейрон.