Подписаться
Ярослав Кутьков

Ярослав Кутьков 0,0

VK

  • Молекулярная поверхность: что в облике тебе моём? Обзор
    «Сухая» биология Биомембраны Биофизика Структурная биология
    Молекулярная поверхность: что в облике тебе моём?
    3245 1,6
    Компьютерное моделирование биологических молекул зачастую основано не на квантовой механике, описывающей строение вещества максимально корректно, а на наборе приближений, уводящих нас от физических «истоков», но позволяющих решать практически важные задачи с использованием ЭВМ. Одним из таких упрощений является концепция молекулярных поверхностей, представляющая молекулу в виде твердого тела, на поверхности которого распределены какие-либо физические свойства. Несмотря на кажущийся примитивизм, этот подход является довольно плодотворным, внося свою лепту в решение актуальных проблем молекулярной биологии, — например, дизайна новых антибиотиков и изучения молекулярных механизмов заболеваний.
    8 Антон Чугунов 05 января 2015
  • Появление и эволюция клеточной мембраны Новость
    Биомембраны Микробиология Структурная биология Цитология Эволюционная биология
    Появление и эволюция клеточной мембраны
    14448 6,1
    У всех современных организмов клеточная мембрана играет принципиальную роль в энергетическом обмене и других биохимических процессах. Новые исследования эволюции мембран позволяют ответить на многие каверзные вопросы: как мембрана появилась у нашего далекого предка LUCA, почему мембраны бактерий и архей так непохожи и каким образом эукариоты обзавелись мембранными органеллами.
    1 Виктория Коржова 31 декабря 2014
  • «Био/мол/текст»-2014
    Биоинформатика и молекулярная эволюция
    Вирусные геномы в системе эволюции
    Обзор
    Вирусология Генетика МГЭ Эволюционная биология
    Вирусные геномы в системе эволюции
    14021 6,4
    Статья на конкурс «био/мол/текст»: Изучение виромов (популяций вирусов, объединенных общей средой обитания) практикуется в современной вирусологии всё чаще. Подобный подход приносит неожиданные результаты — концентрация вирусов в природе, оказывается, чрезвычайно высока. Например, в морской среде количество вирусных частиц превосходит количество клеток в разы. При этом вирусные частицы способны к передаче генетической информации. Исследования, опубликованные в 2010 году, показали, что агенты переноса генов (АПГ, особая разновидность вирусоподобных частиц, участвующих в горизонтальном переносе генов) привносят в геном бактерий новые фрагменты значительно чаще, чем считалось ранее. А если вирусные частицы настолько распространены в биосфере, и большая часть из них способна к переносу генов, то важно рассмотреть вирусы в рамках общей модели эволюции.
    0 Юрий Лапочкин 28 ноября 2014
  • «Био/мол/текст»-2014
    Биоинформатика и молекулярная эволюция
    Виртуальные тропы реальных лекарств
    Обзор
    «Сухая» биология Биомолекулы Драг-дизайн Медицина Структурная биология
    Виртуальные тропы реальных лекарств
    4020 1,9
    Статья на конкурс «био/мол/текст»: В наше время компьютерные методы используются практически во всех областях науки. Создание новых лекарств не является исключением. Многие вещества, которые легко получить из природы, например, выделив экстракт из листьев какого-нибудь растения, уже давно исследованы на наличие лекарственной активности. Поэтому сейчас лекарства часто «изобретают» на компьютере, а потом уже проверяют экспериментально. В статье обсуждаются различные аспекты метода молекулярного докинга, используемые в решении этой задачи.
    1 Полина Шичкова 28 ноября 2014
  • «Био/мол/текст»-2014
    Биоинформатика и молекулярная эволюция
    Биоинформатика в мире РНК-структур
    Обзор
    «Сухая» биология РНК Структурная биология
    Биоинформатика в мире РНК-структур
    5299 2,5
    Статья на конкурс «био/мол/текст»: Амбициозный проект «Геном человека», завершившийся в 2003 году, был призван расшифровать всю ДНК, содержащуюся в человеческом геноме. Считалось, что проект поможет понять, как функционируют гены, каким образом они определяют состояние клетки и организма человека в целом, а также даст толчок развитию медицины и биологических наук. Однако исследования показали, что вся сложность клетки как целостной системы не сводится к одному лишь геному. Функционирование и роль молекулы РНК в регуляции клеточных процессов во многом зависят от ее пространственной организации, изучение которой — сложная задача, справиться с которой под силу только биоинформатике.
    0 Александр 25 ноября 2014
  • «Био/мол/текст»-2014
    Своя работа
    Морская звезда <em>Patiria pectinifera</em> поможет в борьбе с аллергией и раком
    Обзор
    Аллергия Биомолекулы Здравоохранение Онкология Процессы Своя работа Фармакология
    Морская звезда Patiria pectinifera поможет в борьбе с аллергией и раком
    893 -0,6
    Статья на конкурс «био/мол/текст»: Онкологические и аллергические заболевания — одни из самых распространённых человеческих патологий. Большие надежды в их лечении возлагаются на каротиноиды — природные соединения, обладающие широким спектром фармакологической активности. Одним из самых известных и изученных на сегодняшний день каротиноидов является астаксантин (АК). Мы обнаружили доступный источник получения АК — смесь каротиноидов из морской звезды Patiria pectinifera. Наши исследования посвящены тому, чтобы найти применение этой смеси в лечении аллергических кожных заболеваний и в противоопухолевой терапии.
    2 Анна Климович 19 ноября 2014
  • «Био/мол/текст»-2014
    Лучший обзор
    Одураченные макрофаги, или Несколько слов о том, как злокачественные опухоли обманывают иммунитет
    Обзор
    Иммунология Онкология
    Одураченные макрофаги, или Несколько слов о том, как злокачественные опухоли обманывают иммунитет
    18695 7,1
    Статья на конкурс «био/мол/текст»: Иммунная система — это мощная многослойная защита нашего организма, которая потрясающе эффективна против вирусов, бактерий, грибов и других патогенов извне. Кроме того, иммунитет способен эффективно распознавать и уничтожать трансформированные собственные клетки, которые могут перерождаться в злокачественные опухоли. Однако сбои в работе иммунной системы (по генетическим либо другим причинам) приводят к тому, что однажды злокачественные клетки берут верх. Разросшаяся опухоль становится нечувствительной к атакам организма и не только успешно избегает уничтожения, но и активно «перепрограммирует» защитные клетки для обеспечения собственных нужд. Поняв механизмы, которые опухоль использует для подавления иммунного ответа, мы сможем разработать контрмеры и попытаться сдвинуть баланс в сторону активации собственных защитных сил организма для борьбы с болезнью.
    6 Мария Кондратова 17 ноября 2014
  • «Био/мол/текст»-2014
    Биоинформатика и молекулярная эволюция
    Под «генную гармошку»
    Обзор
    Генетика ДНК Микробиология Эволюционная биология
    Под «генную гармошку»
    1882 0,4
    Статья на конкурс «био/мол/текст»: Генетическая информация в геномах живых организмов постоянно пребывает в состоянии динамического равновесия. Ее количество может возрастать за счет «самоцитирования» (копирование своей собственной ДНК) или «плагиата» (приобретения чужеродной ДНК), а может сокращаться за счет счет удаления балластной, с точки зрения клетки, информации. И если смысл обогащения генома за счет чужой ДНК интуитивно понятен, то назначение множественного копирования своих собственных генов далеко не очевидно. Однако этот процесс, получивший название «амплификации генов», чрезвычайно широко распространен в природе, а стало быть, для чего-то клеткам нужен.
    1 Лариса Беляева 11 ноября 2014
  • «Био/мол/текст»-2014
    Лучший обзор
    Светлая голова
    Обзор
    Генетика Генная инженерия Нейробиология Оптогенетика
    Светлая голова
    3094 1,4
    Статья на конкурс «био/мол/текст»: В XXI веке наука о человеке — это прежде всего наука о мозге и его функциях. Современные методы фМРТ и микроэлектродной стимуляции предоставили нам возможность понять устройство этого, пожалуй, самого загадочного из органов и использовать в своем изучении его же язык. Но совсем недавно миру был представлен совершенно иной метод, предлагающий нейронам свой собственный язык — свет. Поговорим об оптогенетике.
    2 Валентин Попов 10 ноября 2014
  • «Био/мол/текст»-2014
    Биоинформатика и молекулярная эволюция
    Древняя ДНК: привет из прошлого
    Новость
    Антропология Биомолекулы Генетика Эволюционная биология
    Древняя ДНК: привет из прошлого
    2520 1,2
    Статья на конкурс «био/мол/текст»: Генетический материал, выделенный из доисторических артефактов — костей, зубов, волосяных фолликулов и других сохранившихся тканей, — как правило, не настолько прост, как это кажется многим, однако уже сегодня функционируют несколько десятков лабораторий, которые не боятся трудностей и пытаются заглянуть в далекое (насколько это возможно) прошлое нашей планеты.
    0 Артем Недолужко 10 ноября 2014