Подписаться
filipchenko-90@mail.ru

filipchenko-90@mail.ru 0,0

VK

  • ИИ в биологии
    Как языковые модели покорили мир белков
    Обзор
    «Сухая» биология Биомолекулы Биотехнологии ДНК Синтетическая биология
    Как языковые модели покорили мир белков
    3055 0,6
    На фоне конкуренции между Microsoft, Google, Meta, Amazon и другими техногигантами за звание обладателя лучшего чат-бота, достижения аналогичных моделей в биохимии и структурной биологии остаются слегка за кадром. А успехи есть, и еще какие! В этой статье спецпроекта «Искусственный интеллект в биологии» «Биомолекула» постарается исправить несправедливость и расскажет, как работают «большие языковые модели» на последовательностях биомолекул и к чему их можно применить в биологии. Мы также обсудим аналогии между биополимерами и привычными нам текстами, которые позволяют применять языковые модели к белкам и ДНК. Не забудем поговорить и про нашумевший AlphaFold — причем будем его не только хвалить! Ну и как всегда, поделимся кейсами, которые уже меняют структурную и другие области биологии.
    1 Мария Кадукова 07 марта 2024
  • «Био/мол/текст»-2023/2024
    Свободная тема
    <em>Sonic Hedgehog</em> и его удивительная молекулярная семья Ёжиков (<em>Hedgehog</em>)
    Обзор
    Биомолекулы Биотехнологии ДНК Процессы Цитология
    Sonic Hedgehog и его удивительная молекулярная семья Ёжиков (Hedgehog)
    1356 0,1
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Что может быть увлекательнее, чем когда ученые называют открытые молекулы в честь любимых персонажей игры! В «Биомолекуле» уже обсуждались молекулы-«стрелочники» Wnt, но они не единственные в многоклеточных организмах, которые лучше других разбираются, как жить эту жизнь (в какие клетки делиться и какие ткани создавать). В этой статье пойдет речь еще об одном «умнике» — еже, который также командует и говорит клеткам, что им делать.
    1 Диана Трач 29 февраля 2024
  • «Био/мол/текст»-2023/2024
    Свободная тема
    МикроРНК в канцерогенезе: тонкая грань между спасением и разрушением
    Обзор
    Биомолекулы Онкология РНК Цитология
    МикроРНК в канцерогенезе: тонкая грань между спасением и разрушением
    2021 0,3
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: В последнее время исследования микроРНК (miRNA) стали важным направлением в изучении канцерогенеза, расширяя наше понимание этого опасного процесса. Они продемонстрировали большую роль этих небольших регуляторов, выполняющих функции как ценных инструментов, повышающих эффективность лечения, так и инициаторов процессов опухолеобразования. Хотя микроРНК и закодированы в небольшой части генома, в нормальных физиологических условиях они выполняют ряд ключевых функций в развитии, дифференцировке клеток, регуляции экспрессии генов, клеточном цикле и апоптозе.
    0 Павел Леонов 01 февраля 2024
  • Победитель «Био/мол/текст»-2023/2024
    Академия & бизнес
    Стартап-завтрак, который мы заслужили: фрикадельки из мамонта, кофе без кофеина, яйца не от куриц и многое другое
    Обзор
    CRISPR/CAS Биология Биотехнологии ГМО Генная инженерия Питание
    Стартап-завтрак, который мы заслужили: фрикадельки из мамонта, кофе без кофеина, яйца не от куриц и многое другое
    788 0,2
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: В последние годы биотехнологическая отрасль переживает своеобразный «бум», в особенности в сфере питания. Наблюдается значительный прогресс в производстве и разработке инновационных продуктов. Позвольте мне пригласить вас в будущее — в мир стартапов, которые революционизировали пищевые технологии. В рамках этого путешествия длиной в восемь глав мы будем собирать идеальный завтрак будущего. Начнем с кофе без кофеина, погрузившись в мир инноваций. Затем познакомимся с веганской кулинарией, где яичный белок производится с помощью грибной культуры. Откроем для себя острые томаты и вкуснейшие неострые листья горчицы. Также мы изучим процесс получения пищи из воздуха, сможем распечатать лосося на 3D-принтере и, наконец, обнаружим мамонта в кулинарном мире. Приготовьтесь к путешествию!
    0 Елизавета Пономарчук 25 января 2024
  • Бет Шапиро: «Жизнь, которую мы создали». Рецензия Рецензии
    Биотехнологии ДНК
    Бет Шапиро: «Жизнь, которую мы создали». Рецензия
    349 0,1
    «Жизнь, которую мы создали» — книга специалиста по древней ДНК Бет Шапиро. В ней автор повествует и обсуждает долгое и непрерывное взаимодействие человека и природы. Всегда ли оно во вред? Может ли человек полностью изменить окружающий мир под себя? Имеет ли наука на это право? На все эти вопросы вы получите аргументы ученых, способных заглядывать не только в прошлое, но и отчасти в будущее.
    0 Екатерина Грачева 04 ноября 2023
  • Победитель «Био/мол/текст»-2023/2024
    Свободная тема
    Настоящее и будущее генетических тестов
    Обзор
    Генетика Персонализированная медицина Секвенирование ДНК
    Настоящее и будущее генетических тестов
    1607 0,5
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: За последние 10–15 лет в мире появились компании, которые на основе анализа ДНК сообщают клиенту информацию о его персональной предрасположенности к большому количеству различных заболеваний, о склонностях к каким-либо видам спорта или об особенностях характера. Эти компании дают оценку вашего персонального риска, в основном используя информацию из опубликованных научных работ. Например, о том какие участки ДНК и как сильно ассоциированы с болезнью или признаком. Однако на сегодняшний день для большинства многофакторных болезней и признаков генетики умеют оценивать риски с достаточно ограниченной точностью. Основная причина в том, что мы еще достаточно мало знаем о том, как работает наша ДНК. Ниже я расскажу, какие точности у этих тестов, чем вы рискуете, проходя их, что думает об этом экспертное сообщество и мое видение того, как эти тесты войдут в нашу жизнь в ближайшие 10 лет.
    3 Максим Стручалин 17 октября 2023
  • мРНК-вакцина на страже коллективного иммунитета: за что вручили Нобелевскую премию в 2023 году Новость
    Вакцины Медицина Нобелевские лауреаты РНК
    мРНК-вакцина на страже коллективного иммунитета: за что вручили Нобелевскую премию в 2023 году
    1905 0,5
    В 2023 году лауреатами Нобелевской премии по физиологии и медицине стали Каталин Карико и Дрю Вайсман. Эти исследователи десятилетиями изучали перспективы использования вакцин на основе мРНК и изобрели способ модификации РНК, благодаря которому создание таких вакцин стало возможно. Их работы легли в основу самых современных прививок против «прославившегося» COVID-19 — знаменитых Comirnaty от Pfizer/BioNTech и Moderna. (В скобках отметим, что, хотя последняя пандемия и принесла нам целый букет действенных вакцин — тот же «Спутник V», — но именно мРНК-вакцины по праву считаются самыми инновационными.)
    0 Алексей Дукат 03 октября 2023
  • Уолтер Айзексон: «Взломавшая код. Дженнифер Даудна, редактирование генома и будущее человечества». Рецензия Рецензии
    CRISPR/CAS Нобелевские лауреаты
    Уолтер Айзексон: «Взломавшая код. Дженнифер Даудна, редактирование генома и будущее человечества». Рецензия
    533 0,2
    Айзексон делает ставку на биотехнологии, поэтому главным героем его новой биографии стала Дженнифер Даудна. Читателя ждет история одной из главных героинь CRISPR-эпопеи, которая разработала эту методику редактирования генома, а также подробное погружение в область, знакомство со множеством известных ученых и их вкладом в развитие науки.
    0 Элина Стоянова 20 мая 2023
  • Галопом по обзорам: зимний марафон 2023 Дайджест
    CAR-T Антибиотики Биология Биомолекулы Генетика ДНК Драг-дизайн Иммунология Медицина Микробиология Нейробиология Цитология
    Галопом по обзорам: зимний марафон 2023
    478 0,2
    В последний месяц каждого сезона мы традиционно (а на самом деле — уже целый год!) публикуем подборки обзоров из журналов серии Nature Reviews. Это — первый в 2023 году и пятый по счету выпуск рубрики, посвященной научным обзорам по биологии, медицине и наукам о Земле (предыдущий осенний выпуск 2022 года читайте по ссылке). Мы собрали и рассказали о статьях на биологические, медицинские, экологические, географические темы. В этой подборке вы вновь встретите разнообразные истории из мира психологии одиночества, секвенирования не менее одиночных клеток, перспектив в терапии рака, исследованиях циркадных ритмов, иммунологических прорывах, влиянии стресса на организм и новостях из мира ксенотрансплантации. Приятного чтения!
    0 Надежда Потапова 28 февраля 2023
  • «Био/мол/текст»-2022/2023
    Наглядно о ненаглядном
    Т9 для транскриптов: что такое редактирование РНК и зачем оно нужно?
    Обзор
    Биомембраны Биомолекулы Генная инженерия ДНК
    Т9 для транскриптов: что такое редактирование РНК и зачем оно нужно?
    551 0,2
    Постер на конкурс «Био/Мол/Текст»: Центральная догма молекулярной биологии гласит, что с гена должна считаться РНК, а с нее 一 белок. Однако не все так просто. Есть альтернативный сплайсинг, когда из одного гена получается несколько вариантов белка. А еще в клетке присутствует целый ряд посттранскрипционных модификаций РНК, которые меняют аминокислотную последовательность будущих пептидов. Например, удаление аминогруппы азотистых оснований в молекуле РНК или включение в нее нуклеотидов, также известное как РНК-редактирование (RNA-editing). Процесс редактирования несколько похож на автозамены T9, потому что результат порой оказывается немного неожиданным. И на клетке это может сказываться неблагоприятно. Например, замена проходит с целью получения нового полезного белка, а в результате получается опасный онкогенный продукт. Феномен редактирования РНК уже давно не дает покоя эволюционным и молекулярным биологам. Его понимание поможет найти ключ к ответу на множество вопросов: от белкового разнообразия позвоночных до механизмов химиорезистентности злокачественных опухолей.
    2 Лоринэ Арзуманян 17 февраля 2023