Подписаться
Анастасия Сычева

Анастасия Сычева 11,5

ИБХ РАН

  • «Био/мол/текст»-2025/2026
    Искусственный интеллект в биологии
    Виртуальная гистология: раскраска для ИИ или новый подход к диагностике?
    Обзор
    «Сухая» биология Медицина Цитология
    Виртуальная гистология: раскраска для ИИ или новый подход к диагностике?
    251 0,1
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Искусственный интеллект (ИИ) все больше входит в самые разные сферы нашей жизни, включая такую сложную и ответственную, как медицина. И пока биоэтики ведут горячие споры о допустимости использования нечеловеческого интеллекта для спасения человеческих жизней, программисты придумали новое применение ИИ в диагностике — виртуальная гистология. Это новая технология, когда ИИ имитирует результат различных гистологических окрашиваний. Нейросеть анализирует фотографию среза ткани, причем образец может быть как неокрашенным, так и уже обработанным каким-либо красителем. Затем нейросеть генерирует картинку, в точности имитирующую результат нужного химического окрашивания. Таким образом, одно стеклышко превращается в бесконечный источник данных, позволяя врачам видеть невидимые структуры без лишних манипуляций.
    0 Наталья Кудряшова 20 января 2026
  • «Био/мол/текст»-2025/2026
    Искусственный интеллект в биологии
    Эволюция как векторное поле: подход <em>evo-velocity</em> в анализе белков
    Обзор
    «Сухая» биология Биомолекулы
    Эволюция как векторное поле: подход evo-velocity в анализе белков
    245 0,1
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Современные белковые языковые модели позволяют по-новому взглянуть на эволюцию белков, рассматривая ее как направленное движение в латентном пространстве последовательностей. В статье разбирается подход evo-velocity, который использует вероятностные оценки языковых моделей для реконструкции направлений и относительной динамики эволюционных изменений без построения филогенетических деревьев. Показано, как метод воспроизводит известные эволюционные траектории вирусов и белковых семейств, какие предпосылки лежат в его основе и какие ограничения следует учитывать при интерпретации результатов. Подход evo-velocity иллюстрирует, что статистика белковых последовательностей содержит информацию не только о структуре и функции, но и о динамике эволюции.
    0 Сергей Двойников 15 января 2026
  • «Био/мол/текст»-2025/2026
    Искусственный интеллект в биологии
    Искусственный интеллект против CUP-синдрома: в поисках невидимого
    Обзор
    «Сухая» биология Медицина Онкология
    Искусственный интеллект против CUP-синдрома: в поисках невидимого
    175 0,1
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: «Рак без начала» — звучит как название научно-фантастической книги, но на самом деле это суровая реальность для многих пациентов. Когда в организме развиваются метастазы, а традиционные методы диагностики не позволяют определить первоисточник, диагноз звучит как приговор — рак неизвестной первичной локализации, или CUP-синдром. Это состояние представляет собой сложную диагностическую задачу, характеризующуюся метастатическими опухолями неустановленного происхождения и неблагоприятным прогнозом. Тем не менее, последние достижения в области искусственного интеллекта открывают новые возможности для диагностики, вселяя надежду на улучшение результатов терапии.
    0 Ибрагимова Милана 14 января 2026
  • «Био/мол/текст»-2025/2026
    Искусственный интеллект в биологии
    Благодетельный круг: искусственный интеллект как ключ к тайнам нашего мозга
    Обзор
    «Сухая» биология Биология Нейробиология
    Благодетельный круг: искусственный интеллект как ключ к тайнам нашего мозга
    165 0,1
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: На протяжении десятилетий нейробиология служила главным источником вдохновения для создания искусственного интеллекта. Однако сегодня ИИ стал мощнейшим инструментом для познания нашего собственного разума. Данная статья рассматривает новую гибридную область исследований — NeuroAI, которая возникла не так давно, но уже завоевала внимание многих ученых мира. NeuroAI можно использовать не только как классический инструмент для обработки данных, но и как платформу для обратного проектирования (reverse engineering) мозга. В этом неклассическом подходе искусственные нейросети используются как «цифровые двойники» для тестирования гипотез о работе кортикальных сетей. В этой статье приводится ряд интересных исследований, демонстрирующих возможности такого подхода: от иерархической организации зрительной и слуховых систем и тонкой специализации нейронных популяций до моделирования и изучения нейробиологических поломок, лежащих в основе психических заболеваний.
    0 Лада Дударева 29 декабря 2025
  • «Био/мол/текст»-2025/2026
    Наглядно о ненаглядном
    Аллергия: победоносное поражение
    Обзор
    Аллергия Иммунология Наглядно о ненаглядном
    Аллергия: победоносное поражение
    258 0,1
    Комикс на конкурс «Био/Мол/Текст»: IgE-опосредованная аллергическая реакция — это иммунная стратегия млекопитающих, направленная на избавление от многоклеточных паразитов и их личинок. Мой комикс раскрывает механизм осуществления сверхбыстрой реакции на небольшие количества паразитарных антигенов и в шуточной форме рассказывает об истоках возникновения IgE-опосредованной аллергии в процессе эволюции.
    0 Ксения Пасынкова 25 декабря 2025
  • Победитель «Био/мол/текст»-2025/2026
    Искусственный интеллект в биологии
    Аптамеры: назад в будущее. Старая концепция в новой технологической реальности
    Обзор
    «Сухая» биология Биомолекулы ДНК
    Аптамеры: назад в будущее. Старая концепция в новой технологической реальности
    471 0,2
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: В 1990-х казалось, что аптамеры вот-вот вытеснят антитела. Спустя десятилетия — всего несколько препаратов, а в обзорах все чаще звучит: «высокий потенциал, но мало реализован». В этой статье мы разбираемся, что дело может быть не в самих аптамерах, а в способе их поиска — методе SELEX, который на практике напоминает лотерею. На фоне успехов AlphaFold мы объясняем, почему прямой перенос этого подхода на аптамеры не работает, и как вместо случайного отбора перейти к рациональному дизайну. Наконец, мы рассказываем, как платформа Xelari заменяет месяцы лабораторного перебора полным компьютерным проектированием аптамеров и почему у этих почти забытых молекул снова появился шанс.
    0 Владислава Долгушева 11 декабря 2025
  • ИИ в биологии
    Победитель «Био/мол/текст»-2025/2026
    Искусственный интеллект в биологии
    От структуры к функции: революция ИИ в белковом дизайне
    Обзор
    «Сухая» биология Биомолекулы Биотехнологии Медицина
    От структуры к функции: революция ИИ в белковом дизайне
    724 0,3
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Белки — это молекулярные машины, отточенные эволюцией на протяжении сотен миллионов и даже миллиардов лет. Мы пока не способны воспроизвести этот длинный путь естественной эволюции, но уже активно учимся направлено конструировать белки под конкретные задачи. И помогают нам в этом большие массивы данных и искусственный интеллект (ИИ). Сначала он научился предсказывать трехмерную структуру природных белков, а теперь на очереди — дизайн: создание новых функций и уверенная оптимизация уже существующих. В статье разбираем, как генеративные модели придумывают форму будущего белка, подбирают к ней аминокислотную последовательность и как вместе с лабораторными экспериментами проверяется, что такой белок действительно работает.
    2 Андрей Кузнецов 08 декабря 2025
  • «Био/мол/текст»-2025/2026
    Своя работа
    «Голодные игры» микробов: как заморить врага голодом, используя геномные данные для поиска скрытых защитников в кишечнике
    Обзор
    «Сухая» биология Медицина Метаболизм Микробиология
    «Голодные игры» микробов: как заморить врага голодом, используя геномные данные для поиска скрытых защитников в кишечнике
    200 0,1
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Пока одни микробы защищают наш организм, другие (в частности, Clostridioides difficile) ждут удобного момента, чтобы завладеть территорией. Стоит неблагоприятным факторам нарушить баланс микробного мира (например, вы приняли антибиотик) — и враг пробуждается. Но что, если бактерии-защитники могут подавлять рост нарушителей спокойствия просто уничтожая их продовольственные запасы? Представьте себе невидимую войну в глубинах кишечника, где победа определяется не мощностью оружия, а — внезапно — скоростью поедания, и отнюдь не друг друга, а обычных продуктов питания самих бактерий! Мы построили биоинформатический конвейер, который по геномам предсказывает, какие микробы способны лишать C. difficile жизненно важных аминокислот и тем самым не позволять ей эффективно колонизировать кишечник. Этот подход открывает путь к выявлению наиболее перспективных микробных защитников — потенциальных пробиотических микроорганизмов.
    0 Анастасия Холодная 17 ноября 2025
  • «Био/мол/текст»-2025/2026
    Своя работа
    Охотники за микробами: дело SM254
    Обзор
    «Сухая» биология Биотехнологии Микробиология
    Охотники за микробами: дело SM254
    222 0,1
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Вы когда-нибудь гадали, глядя на бактерию, что там у нее в геноме? Что, если среди множества генов где-то уже записана подсказка к спасению целого вида — и даже экосистемы? Дело SM254 начинается не в лаборатории, а в глубинах шахты, где медь и тьма закалили микроб, способный выживать в экстремальных условиях и, возможно, противостоять возбудителю синдрома белого носа у летучих мышей — грибку, вызвавшему массовую гибель рукокрылых и серьезные экологические последствия. Это рассказ о расследовании, которое пока не дает однозначных ответов, но открывает направление — туда, где микробы могут стать союзниками в восстановлении хрупкого баланса жизни.
    0 Илья Попов 10 ноября 2025
  • Победитель «Био/мол/текст»-2024/2025
    Школьная
    Виртуальные битвы с бактериями: использование вычислительной биологии для поломки белка RpfB и борьбы с <em>Stenotrophomonas maltophilia</em>
    Обзор
    «Сухая» биология Биомолекулы Микробиология
    Виртуальные битвы с бактериями: использование вычислительной биологии для поломки белка RpfB и борьбы с Stenotrophomonas maltophilia
    289 0,1
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Если я скажу, что бактерии между собой разговаривают, возможно, вы мне не поверите. Но на самом деле у них есть целый процесс «переговоров», называемый кворум-сенсингом или чувством кворума. Этот процесс позволяет им работать вместе и таким образом еще сильнее атаковать организм. В этом исследовании представлен стратегический план действий по прерыванию переговоров между бактериями Stenotrophomonas maltophilia, используя биоинформатику. Эти бактерии общаются с помощью особой молекулы — диффузионного сигнального фактора (DSF), регулируемого белком RpfB. Вот этот белок мы и попробуем вывести из строя, собрав свою команду молекул, которые могут тормозить его действие.
    0 Александра Хромова 08 апреля 2025