-
825Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Белки — это молекулярные машины, отточенные эволюцией на протяжении сотен миллионов и даже миллиардов лет. Мы пока не способны воспроизвести этот длинный путь естественной эволюции, но уже активно учимся направлено конструировать белки под конкретные задачи. И помогают нам в этом большие массивы данных и искусственный интеллект (ИИ). Сначала он научился предсказывать трехмерную структуру природных белков, а теперь на очереди — дизайн: создание новых функций и уверенная оптимизация уже существующих. В статье разбираем, как генеративные модели придумывают форму будущего белка, подбирают к ней аминокислотную последовательность и как вместе с лабораторными экспериментами проверяется, что такой белок действительно работает.
-
Статья на конкурс «био/мол/текст»: Кристально чистая вода, свежий воздух, зеленые луга и леса — превосходное место для проживания человека. Нефтяные разливы, ядерный реактор ЧАЭС, кислотные озера — отличное место для обитания микроорганизмов. Причем они не просто терпеливо переносят столь суровые условия, они прекрасно живут в них и, главное, размножаются. И даже такие опасные для человека загрязнители окружающей среды, как полициклические ароматические углеводороды, служат для бактерий вполне обычным ростовым субстратом. Разгадка таких способностей кроется в генах. И об одном таком наборе генов — генов деградации нафталина — пойдет речь в этой статье.
-
787Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Бактерии используют самые разные стратегии борьбы с конкурентами. Не так давно было найдено новое оружие, которое они могут использовать в войне друг против друга, а именно — умеренные вирусы. О том, как зараженная популяция не погибает сама и каков механизм этого процесса, и пойдет речь в статье.
-
Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Бактерии — удивительные и по-настоящему уникальные организмы. Их можно найти практически везде: в воде, воздухе, в почве и других местах. А некоторые представители могут выживать в таких условиях, которые бы привели к неминуемой гибели других живых организмов. Так, существуют виды, обитающие при экстремальных температурах, например, в вечной мерзлоте и горячих источниках. Некоторые бактерии способны выдерживать пониженное или повышенное давление. А другие — противостоять действию высокотоксичных веществ, например, тяжелых металлов. В этой статье мы разберемся, как бактерии могут противостоять действию токсичных веществ, смертельных для других организмов. Но для начала нужно понять, что такое тяжелые металлы и какую опасность они представляют.
-
787Самое замечательное открытие этой недели — CRISPR-подобная иммунная система мимивирусов, помогающая им защищаться от вирофагов. Еще из интересного: в Nature — подборка статей о когнитивном здоровье, исследование регенерации конечностей у аксолотля, а также описание нейронов, которые помогают спящему животному помнить, где оно находится. В Science расскажут о том, как взаимодействия частей мозга связаны с мотивами альтруистических действий, о том, как в геноме возникают новые регуляторные участки и о том, какие механизмы побуждают клетку превращаться в нейрон.
-
Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Судьба клетки во многом определяется тем, как ее гены, закодированные в ДНК, считываются и работают. Мы узнаём всё больше о том, как в этом процессе важна пространственная организация хроматина (иными словами — его архитектура). Структурная биология хроматина — большая и кипучая область, и именно здесь можно придумать и поставить такой эксперимент, который прояснит фундаментальные принципы жизни клетки. Мне удалось стать не только свидетелем, но и участником такого события. С помощью непростого эксперимента фиксации конформации хромосом одиночных клеток мы предположили два возможных механизма формирования структуры хроматина мухи, тесно связанных с активностью генов. Более того, мы выяснили ряд особенностей хроматина этого организма. На пути к открытию пришлось преодолеть всевозможные трудности. И теперь, когда работа опубликована в Nature Communications, я делюсь рассказом о том, почему это было не только трудно, но и интересно.
-
783Прошедшую неделю журналы Nature и Science, будто сговорившись, отметили публикацией будоражащих воображение исследований. Среди самых спорных статей — сообщение об окаменелостях животных, которые древнее известных нам останков на 350 млн лет — это перевело многолетнюю дискуссию палеонтологов в публичное поле. На полочке полезных разработок сегодня представлен универсальный переключатель, с помощью которого можно управлять генной терапией. Еще мы больше узнали о двух длинных войнах. Одну ведут бактерии со своими вирусами, и она влияет на здоровье людей. А другую ведут вирусы насекомых с паразитоидами своих жертв, и она далека от медицины, но страшно интересна. Даже ковид-положительная публикация вызывает эмоции, так как объясняет, почему большая часть препаратов, перепрофилированных для лечения COVID-19, не способна помочь заболевшим. Целых две статьи подсказывают способ продлить здоровую молодость. А чего стоит открытие о том, как заставить организм избавляться от лишнего жира через кожу!
-
1052Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: В процессе жизнедеятельности клетки находящиеся в ней макромолекулы и органеллы постоянно повреждаются и выходят из строя. Их необходимо утилизировать и заменять новыми, чтобы их функции всегда выполнялись с достаточной эффективностью. Утилизация отслуживших свой срок компонентов клетки осуществляется двумя путями: с помощью протеасомной системы и с помощью аутофагии. С возрастом эффективность работы обеих систем уменьшается, из-за чего в клетке постепенно накапливаются повреждения. Это является причиной многих болезней пожилого возраста и старения вообще. Поэтому изучение протеасомной системы и аутофагии имеет большое значение для повышения продолжительности и качества жизни. Особый интерес вызывают пути взаимодействия этих двух систем. Появляется всё больше данных о том, что они тесно связаны между собой и не могут нормально работать друг без друга. Это совершенно логично, ведь они выполняют общую задачу — поддержание чистоты в клетках. О том, как связаны между собой аутофагия и протеасомная система, и пойдет речь в данной статье.
