Американская программа по структурным исследованиям белков (PSI), за десятилетие своей работы давшая миру более 5000 пространственных структур биологических молекул, для следующего этапа своих изысканий меняет курс. Дело в том, что из этих пяти тысяч лишь 128 белков — это белки человека, а большинство же лежит в базах данных мёртвым грузом, практически не вызывая интереса биологов. Следующая пятилетка программы PSI пройдёт под знамёнами человеческих объектов, и в первую очередь — рецепторов, действующих через активацию G-белков.

Список необычных пептидов, которые синтезируют разнообразные живые организмы (особенно бактерии), постоянно пополняется: это и кольцевые пептиды, и пептиды, содержащие D-аминокислоты, и так называемые лассо-пептиды, у которых через N-концевое макролактамное кольцо «продета» линейная C-концевая часть молекулы. За превращение обычного линейного пептида, синтезируемого рибосомами, в лассо-пептид, отвечает синтетаза лассо-пептида, которая состоит из двух белковых субъединиц: B и C (или B1, B2 и C, если в состав субъединицы B входят два отдельных полипептида). Белок B1 отвечает за распознавание лидерной последовательности будущего лассо-пептида, фермент B2 лидерную последовательность отрезает, а белок С формирует макролактамное кольцо на N-конце лассо-пептида. Однако все детали этого трехступенчатого процесса остаются неясными. Исследователи из Центра наук о жизни Сколковского института науки и технологий совместно с японскими коллегами получили кристаллическую структуру белка B1 термофильной актинобактерии Thermobifida fusca в комплексе с соответствующим лидерным пептидом и с помощью мутационного анализа выявили, какие именно остатки фермента B1 и самого пептида играют решающую роль в его созревании. Тонкостям синтеза необычных лассо-пептидов и посвящена наша новость.

Авторы книги «Хватит это терпеть» позиционируют ее как «не только ясный и практический путеводитель по миру разнообразных школ и приемов, но и манифест в защиту этичной доказательной терапии». Скажу сразу, что у них это получилось. Несмотря на то, что местами язык книги суховат, она производит приятное впечатление, полностью соответствует целям, которые были заявлены.

Ранее считалось, что молекулярные таймеры живых организмов работают по такой схеме: активируется ген часов, в результате его работы образуется белок-регулятор, который подавляет работу гена. Ген остается неактивным, пока не деградирует белок-регулятор. Благодаря такой петле обратной связи активность гена часов, а также концентрация белка-регулятора меняются циклически, что дает организму нечто вроде метронома — «внутренних часов». Однако в недавно опубликованной в журнале Science работе было показано, что деградация белка-регулятора не является необходимой для того, чтобы поддерживать циклическую активность гена часов. По мнению исследователей, ключевую роль играют модификации этого белка, которые «отключают» его и без физического разрушения молекулы.

На этой неделе в Nature и Science много интересной нейробиологии. Оказывается, есть клетки, которые дают животному команду спать. А ещё у макак нашли участки мозга, обеспечивающие понимание социальных связей в группе. Кроме того, авторитетные научные журналы рассказывают об успехах биологии развития. Стало понятно, как выключить гены в первичных половых клетках дрозофилы, чтобы они стали сперматозоидами, и что делать, чтобы зародыш не ел слишком много. Хит недели — две статьи от независимых коллективов о получении гемопоэтических стволовых клеток в лаборатории. Как водится, это не всё, об остальном читайте в дайджесте!

Свежий Nature особенно богат важными новостями — в нем пишут и о новом типе нейронов, чувствительных к скорости движения животного, и о генетических маркерах, характерных для больных тяжелой формой депрессии, и о генах, важных для развития рака. А спецвыпуск посвящен развитию исследовательских навыков у детей, школьников, студентов и даже заведующих лабораториями. В новом Science можно прочитать об удивительно неэффективных полярных медведях, предпочитающих страдать от голода, а не впадать в спячку, о новом методе исследования структуры наночастиц и об отборе полезных бактерий растениями. Спецвыпуск Science посвящен искусственному интеллекту.

Кишечные микробы, (анти)оксиданты и немного эволюции — таков основной состав тем Nature и Science на этой неделе. Кроме того, из Nature мы узнаем, как можно избавиться от золотистого стафилококка, как лечить гепатит С и почему злокачественные опухоли мозга так сложно победить. А материалы Science расскажут, как моторная кора регулирует движения, как обонятельные рецепторы становятся сами собой, а также почему так важно регулярно питаться.

Недавно выделены бактериальные ферменты, эффективно удаляющие A и B антигены с поверхности эритроцитов.