-
Мы поговорили с Марком Ивановым — выпускником Физтеха, кандидатом физико-математических наук, ведущим научным сотрудником Института энергетических проблем химической физики им. В. Л. Тальрозе в составе Федерального научного центра химической физики им. Н.Н. Семенова РАН. Марк — представитель научной школы директора Института Михаила Горшкова, в которой уже много лет на высоком уровне ведутся исследования в области анализа данных биологической масс-спектрометрии. Совсем недавно наш собеседник стал лауреатом Научной премии Сбера в новой номинации «AI в науке. Науки о жизни». Мы узнали у Марка, какими проектами он занимался в последнее время, и почему протеомике понадобился искусственный интеллект.
-
287Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Всю мою научную карьеру объектом моих исследований были лабораторные плодовые мушки Drosophila melanogaster — я изучала, как устроены и работают гигантские хромосомы в слюнных железах их личинок. Однако в этой статье я хочу рассказать о том, что мушка-дрозофила интересна не только в лаборатории, и по-настоящему увлекательные научные открытия можно делать прямо у себя дома. В рамках проведения научного проекта для школьной конференции я вместе с дочкой погрузилась в мир диких дрозофил. Разместив банки c фруктовыми и овощными приманками у себя на балконе и дома, мы смогли привлечь целых семь видов плодовых мушек. Более того, оказалось, что мы привлекли почти все наиболее распространенные в современном мире космополитические виды дрозофил. Это означает, что прямо сейчас в разных уголках планеты вместе с человеком обитают одни и те же виды дрозофил. Интересно, что в наших уловах были Drosophila simulans, которые очень редко попадаются на территории России, а в Сибири этот вид не встречался специалистам ни разу. Далее я расскажу о том, как разные виды дрозофил стали космополитами. Некоторые из них уже около десяти тысяч лет сопровождают человека и распространяются вместе с ним по всему миру. Таким видом является Drosophila melanogaster. Другие виды начали сопровождать человека относительно недавно: например, виды группы repleta еще около сотни лет назад жили только на Американском континенте и питались исключительно кактусами. Сегодня эти же виды успешно адаптируются к новым условиям и завоевывают Сибирь. Этот пример ярко иллюстрирует удивительную способность видов к быстрому распространению и приспособлению к различным средам обитания.
-
182Книга-антология, посвященная нескольким удивительным вымершим животным, жившим на нашей планете многие миллионы лет назад. Это рассказ об эволюции жизни, эволюции позвоночных и о том, как каждый упомянутый в книге вид повлиял на ход эволюционной истории Земли, как менялось строение позвоночных животных и какие уникальные особенности они порой обретали для более эффективного выживания. Это рассказ, сочетающий в себе художественные сцены из жизни древних существ с крепкой научной базой, которую автор подал, мастерски разбавляя сухую науку тонкой сатирой. Всего книга содержит в себе 27 глав, каждая из которых посвящена отдельному виду животного в рамках одного периода геохронологической шкалы. Таким образом, авторский рассказ движется от самого становления позвоночных животных в девонском периоде к временам, близким к нашей современности.
-
151Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Диагностика паразитарных заболеваний в ветеринарии и сельском хозяйстве до сих пор остается сложной и трудоемкой задачей, требующей специализированных лабораторных исследований. В ответ на этот вызов нами представлен пилотный проект по созданию системы автоматизированной идентификации паразитов с использованием технологии искусственного интеллекта. В основе работы лежит обучение нейронной сети на платформе Google Teachable Machine для классификации изображений гельминтов на два основных класса — нематоды и цестоды, которые вызывают различные серьезные заболевания (такие как эхинококкоз, трихинеллез, тениоз, аскаридоз и другие) у людей и животных. Они поражают различные органы и системы, вызывая заболевания; их деятельность в организме может привести к анемии, истощению, аллергическим реакциям и нарушению функций внутренних органов. Их точная идентификация важна для своевременного назначения лечения и профилактики осложнений. На основе собранной базы данных изображений, состоящей из 28 фотографий гельминтов, была обучена модель, продемонстрировавшая в ходе тестирования точность 89%. Разработанное решение обладает значительным практическим потенциалом, позволяя проводить быструю и точную диагностику «в поле», что делает его перспективным инструментом для ветеринаров, работников агрокомплексов и студентов. Проект открывает дорогу для создания коммерческого продукта, способного снизить затраты на лабораторные услуги и ускорить начало лечения.
-
95Постер на конкурс «Био/Мол/Текст»: Каждую миллисекунду за крепко сомкнутыми створками раковины двустворчатого моллюска, как за плотным занавесом — в театре, происходят многообразные молекулярные превращения: разворачивается завораживающее балетное действо. Скорее занимайте места, представление начинается!
-
В издательстве «Ламинария» вышла необычная познавательная книга-путешествие. Да-да, именно путешествие. Ведь вместе с главным героем Сережей читателей ждет настоящее путешествие к Северному полюсу. Компанию юному герою составят его папа (морской биолог), капитан ледокола, подводник и метеоролог. Поэтому приготовьтесь: помимо чудесных иллюстраций-пейзажей, вам предстоит встретиться со многими обитателями Северного Ледовитого океана, узнать историю северного мореплавания, научиться различать китов по фонтанам, побывать на птичьем базаре и многое другое.
-
172Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Нейросети уже давно вышли за рамки обычного языка: сегодня они уверенно справляются с биологическими последовательностями. GENA Language Models — семейство языковых моделей, созданное исследователями Института искусственного интеллекта AIRI для анализа геномных данных и обнаружения в них скрытых закономерностей. Модель учитывает до 36 тысяч нуклеотидов, при этом умея выявлять сложные взаимосвязи, что позволяет предсказывать влияние генетических вариантов, обнаруживать регуляторные элементы и перспективе способствовать развитию медицины. Далее, я расскажу, как нейросети, использующие принципы обработки последовательностей, схожих с теми, что используются в моделях человеческого языка, могут как бы «читать» и интерпретировать ДНК, и почему такой подход меняет способы работы биологов с геномными данными.
-
519Как лечить неизлечимое? И можно ли продлить активную жизнь на несколько десятков лет? Ответы на эти и другие вопросы медицины искали ведущие ученые страны на ежегодном Саммите разработчиков инновационных лекарственных средств в Университете «Сириус». Побывав на третьем Саммите разработчиков лекарственных средств «Сириус.Биотех», постоянный автор «Биомолекулы» Денис Новиков поразился размахом мероприятия и крутостью спикеров.
-
513Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Эра гаражных стартапов, которую когда-то начали IT-предприниматели, получает неожиданное продолжение в мире биотехнологий. Современные биоинженеры, вооружившись технологией редактирования генома CRISPR/Cas9, создают инновационные проекты по модификации пивных дрожжей. В статье мы рассмотрим практическое применение генного редактирования в пищевой промышленности и обсудим, как технология CRISPR меняет наше представление о создании генно-модифицированных продуктов — от пива до ферментированных продуктов.
