Подписаться
  • «Био/мол/текст»-2023/2024
    Синтетическая биология
    Рассказ о том, как ученые бактериальные и синтетические клетки подружили
    Новость
    Биомолекулы Генная инженерия Синтетическая биология Цитология
    Рассказ о том, как ученые бактериальные и синтетические клетки подружили
    482 0,1
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: «Сенсация! Сенсация! Ученые создали биологические клетки и научили их общаться!». Так мог бы звучать заголовок в желтой прессе, если бы они решили опубликовать данные исследования, которое провели ученые из Оксфорда и университетского колледжа Лондона. Да, звучит действительно потрясающе! Неудивительно, что эта работа опубликована в журнале Nature Chemical Biology и очень активно цитируется. Разберемся же в том, что такого необычного придумали ученые и в чем польза их изобретения.
    0 Светлана Бозрова 12 марта 2024
  • Одна последовательность — одна структура: был ли Анфинсен неправ? Новость
    Биомолекулы Структурная биология
    Одна последовательность — одна структура: был ли Анфинсен неправ?
    1814 0,9
    С 1970-х годов в биохимии господствует представление, что аминокислотная последовательность белка уникальным образом определяет его трёхмерную структуру. Но вот теперь в новом исследовании обнаружено, что лимфотактин — небольшой белок семейства хемокинов — не только «балансирует» в физиологических условиях между двумя различными конформационными состояниями, но и выполняет две разные биохимические функции! Так был ли Анфинсен — один из основоположников теории фолдинга белка — неправ?
    6 Антон Чугунов 31 марта 2008
  • Непохожие «гомологичные» белки Новость
    Биомолекулы Биофизика Структурная биология
    Непохожие «гомологичные» белки
    1243 0,6
    Вопрос, каким образом аминокислотная последовательность кодирует строение белков, остаётся одним из наиболее актуальных в биофизике. Чтобы проникнуть в самую суть механизмов, отвечающих за самосборку белков, учёные сконструировали два белкá, практически идентичные по последовательности (88%), которые сохранили при этом структуру и даже функции «исходных» негомологичных белков, из которых они были получены путём введения множества мутаций. Более того, удалось установить, что за различия в вариантах упаковки — 3-α и α/β мотивы — отвечают всего лишь... три аминокислотных остатка.
    3 Антон Чугунов 05 октября 2008
  • ИИ в биологии
    Как языковые модели покорили мир белков
    Обзор
    «Сухая» биология Биомолекулы Биотехнологии ДНК Синтетическая биология
    Как языковые модели покорили мир белков
    1955 0,6
    На фоне конкуренции между Microsoft, Google, Meta, Amazon и другими техногигантами за звание обладателя лучшего чат-бота, достижения аналогичных моделей в биохимии и структурной биологии остаются слегка за кадром. А успехи есть, и еще какие! В этой статье спецпроекта «Искусственный интеллект в биологии» «Биомолекула» постарается исправить несправедливость и расскажет, как работают «большие языковые модели» на последовательностях биомолекул и к чему их можно применить в биологии. Мы также обсудим аналогии между биополимерами и привычными нам текстами, которые позволяют применять языковые модели к белкам и ДНК. Не забудем поговорить и про нашумевший AlphaFold — причем будем его не только хвалить! Ну и как всегда, поделимся кейсами, которые уже меняют структурную и другие области биологии.
    1 Мария Кадукова 07 марта 2024
  • Нейрофармакология
    Ликбез по ЦНС
    Обзор
    Медицина Нейробиология Нейродегенерация Нейромедиаторы Процессы
    Ликбез по ЦНС
    4996 1,5
    Мозг — это орган, который сильнее всего отличает человека от остальных животных. Можно сказать, что человек как вид занимает «когнитивную нишу»: мы достигли впечатляющих (для млекопитающих таких размеров) численности и ареала обитания благодаря своему интеллекту — продукту работы развитого и сложно устроенного мозга. Важная роль мозга для человека означает высокую «цену поломки», и болезни мозга — нарушения развития, психические расстройства, нейродегенеративные и инфекционные заболевания, инсульты и опухоли — становятся огромной проблемой для медицины. Центральная нервная система — важнейший интерфейс для взаимодействия организма с окружающим миром, и даже небольшие изменения в ее работе могут существенно повлиять на приспособленность организма. В рамках нового спецпроекта «Нейрофармакология», прежде чем углубляться в сложности разработки методов терапии для заболеваний мозга, мы предлагаем читателям кратко познакомиться с анатомией и физиологией центральной нервной системы.
    4 Елена Белова 16 февраля 2024
  • «Био/мол/текст»-2023/2024
    Свободная тема
    Microvenus — арт-объект, созданный с помощью генной инженерии, или как заставить символ «жить»?
    Обзор
    Биотехнологии Микробиология Мнения
    Microvenus — арт-объект, созданный с помощью генной инженерии, или как заставить символ «жить»?
    325 0,1
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Если вам тесно в рутине будней лаборатории или не хватает холста и масла для выражения себя, то добро пожаловать в Art&Science;, сферу пересечения науки и искусства! Это молодая область, на которую, кстати говоря, уже можно выучиться за рубежом и в России, представляет постиндустриальный тип художественного высказывания с использованием научных методик. Меняющаяся реальность ХХI века требует осмысления, постмодернизм цветет и пахнет, междисциплинарность захватывает позиции. Био-арт — раздолье для молекулярного биолога и художника, которым стало скучно и захотелось сотворить нечто большее. Например, живое произведение искусства с помощью инструментов и методов молекулярной биологии, как это впервые сделал американский художник Джо Дэвис. В этой статье познакомимся с арт-объектом Microvenus и разберемся с тем, как он был создан и «что хотел сказать автор».
    1 Анна Валина 06 февраля 2024
  • ИИ в биологии
    История развития искусственного интеллекта и его пришествия в биологию
    Обзор
    «Сухая» биология Биотехнологии Наука из первых рук Синтетическая биология
    История развития искусственного интеллекта и его пришествия в биологию
    3225 1,2
    Искусственный интеллект занимает в современной биологии важное место — с его помощью можно предсказать строение белка, изучить структуру гена или даже написать научную статью. (Кстати — и прочитать тоже можно, чтобы попросить алгоритм извлечь из нее нужные факты.) В первой статье спецпроекта «Искусственный интеллект в биологии» мы попытаемся проследить, с чего всё начиналось и как искусственный интеллект пришел в биологию — или, наоборот, вышел из нее. Мы изучим основные вехи истории машинного обучения и обсудим их с российскими и зарубежными экспертами.
    2 Георгий Куракин 15 декабря 2023
  • Эволюция между молотом и наковальней, или Как микробиология спасла эволюцию от поглощения молекулярной биологией Обзор
    Биомолекулы Генетика Микробиология Мнения Процессы Эволюционная биология
    Эволюция между молотом и наковальней, или Как микробиология спасла эволюцию от поглощения молекулярной биологией
    7880 3,7
    Заявить в ХХI веке, что молекулярная биология зашла в тупик, — для этого надо иметь не только смелость, но и недюжинный ум. Чтобы опубликовать статью на эту тему в одном из ведущих молекулярных журналов, требуется быть исключительно эрудированным и авторитетным учёным. Мы представляем адаптированный перевод одной из наиболее ярких научных статей прошлого года, написанной двумя выдающимися учёными — Карлом Вёзе и Нигелем Голденфельдом. В работе говорится об опасностях и неудачах современной молекулярной биологии.
    3 Петр Старокадомский 19 января 2010
  • Политика — это у нас в крови! Обзор
    Генетика Мнения Этология
    Политика — это у нас в крови!
    1095 0,5
    Аристотель писал, что человек — существо более общественное, чем муравьи или пчелы, за счет восприятия таких этических категорий как добро-зло, справедливость-несправедливость и т.д. В общем-то, за исключением уж совсем тяжелых патологических случаев, мы все хотим, чтобы всем хорошим людям было хорошо. Различаемся мы только в том, каких людей считаем «хорошими», что понимаем под словом «хорошо» и что готовы сделать для того, чтобы «было». Когда мы хотим, чтобы наши взгляды на все это имели значение в масштабе общества — мы уже заходим на территорию политики. От чего же зависит то, как мы будем двигаться по этой территории? Связано ли это с окружающей средой, нашей генетикой или устройством мозга? Полный и окончательный ответ еще не найден, но ученые мчатся к нему на всех парах и уже успели узнать много интересного!
    0 Александр Ташкеев 11 марта 2016
  • «Био/мол/текст»-2020/2021
    Вирусы и микроорганизмы
    Персистенция бактерий — угроза, которую мы не замечаем в страхе перед антибиотикорезистентностью
    Обзор
    Антибиотики Биология Микробиология
    Персистенция бактерий — угроза, которую мы не замечаем в страхе перед антибиотикорезистентностью
    4290 2,1
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Антибиотик для бактерий — весьма весомая проблема. Но если не можешь решить её сразу, как это делает резистентная клетка, то имеет смысл отложить проблему на потом. «Утро вечера мудренее», — говорят персисторные клетки бактерий и впадают в состояние замедления метаболических процессов. А после есть шанс, что проблема пропадёт сама собой, когда курс антибиотика подойдет к концу.
    0 Роман Сидоров 27 января 2021