Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Нейросети уже давно вышли за рамки обычного языка: сегодня они уверенно справляются с биологическими последовательностями. GENA Language Models — семейство языковых моделей, созданное исследователями Института искусственного интеллекта AIRI для анализа геномных данных и обнаружения в них скрытых закономерностей. Модель учитывает до 36 тысяч нуклеотидов, при этом умея выявлять сложные взаимосвязи, что позволяет предсказывать влияние генетических вариантов, обнаруживать регуляторные элементы и перспективе способствовать развитию медицины. Далее, я расскажу, как нейросети, использующие принципы обработки последовательностей, схожих с теми, что используются в моделях человеческого языка, могут как бы «читать» и интерпретировать ДНК, и почему такой подход меняет способы работы биологов с геномными данными.

Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Проблемы сна в подростковом возрасте все чаще становятся предметом внимания исследователей, педагогов и врачей. Для самих подростков они проявляются в виде трудностей с засыпанием, хронического недосыпа и выраженной сонливости в утренние часы, что напрямую влияет на самочувствие и способность к обучению. Такие особенности связываются преимущественно с поведением подростка и его недостаточной организованностью. Однако подростковый возраст совпадает с периодом глубокой перестройки внутренних регуляторных систем организма. Изменяется работа механизмов, отвечающих за суточную организацию процессов сна и бодрствования. Несоответствие между внутренним биоритмом подростка и внешними временными рамками (школьное расписание) формирует устойчивый конфликт, причины которого лежат не на уровне поведения, а в биологическом аспекте. Рассмотрение этих процессов позволяет по-новому взглянуть на природу подросткового сна и понять, какие механизмы лежат в основе наблюдаемых изменений.

Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Зебры с пятнами, а не полосками, жирафы с неповторимыми узорами, леопарды, словно нарисованные самой природой — как все это создается? Оказывается, за красотой звериных шкур стоит не волшебство, а математика! Реакции внутри кожи, законы распространения веществ и форма тела определяют, где появится пятно или полоса. Даже необычные зебры в «горошек» подчиняются этим удивительным правилам.

Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Более восьмидесяти лет назад было впервые показано, что инертный газ аргон — биологически далеко не самая инертная молекула. Мишенями его действия могут быть клетки нервной ткани человека и животных. Сейчас известно, что аргон подавляет развитие воспаления, спасает нейроны от гибели, а также борется с активными формами кислорода. Таким образом, это простое вещество может проявлять разные виды биологической активности и, в частности, ускорять восстановление мозга млекопитающих после инсультов. Но может ли аргон стать лекарством?

Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Митохондрии известны всем под названием «энергетических станций клетки», но может ли случиться так, что собственная станция создаст серьезные риски — и дело тут не в экологии. Ученые придумали, как спастись от нависшей угрозы.

Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: В современном мире все больше и больше интереса вызывает генная инженерия для лечения рака, то есть болезней, которые основаны на бесконтрольном делении клеток, приводящих к образованию опухолей [1]. Одно из последних решений — CAR-T терапия — генетическая модификация Т-лимфоцитов, превращающая их в метких «снайперов» для раковых клеток [2]. Но каждая опухоль индивидуальна и такая терапия не всегда может быть эффективной, а также имеет большие риски. Поэтому исследователи постоянно ищут новые пути, и один из них — создание нового варианта генной терапии — CAR-NK. В отличие от Т-лимфоцитов NK клеткам не нужно узнавать антиген через антигенпрезентирующие клетки, они реагируют на подозрительные молекулы в мембране клетки. Помимо этого, NK-клетки являются аллогенным продуктом — их можно забирать от здорового донора и вводить пациенту, в отличие от Т-лимфоцитов, которые аутологичны — забираются от пациента, модифицируются и возвращаются ему же. В данной статье рассматривается сравнение обеих терапий, идея CAR-NK и ее перспективы.

Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: В этой статье мы рассмотрим, что такое электронно-транспортная цепь митохондрий, как она работает и какие ее комплексы можно заблокировать на примере самых популярных ядов. Многие наверняка читали произведения Агаты Кристи, где жертв убивали с помощью цианистого калия, ингибитора электронно-транспортной цепи митохондрий, или слышали историю про отравление Распутина «вином и пирожными с цианистым калием», но только почему-то Распутин выжил после такого «кушанья», а вот персонажи «королевы детектива» нет… Какой циклон был назван буквой «Б» и причем тут абрикос? И как «молекулярный почерк» убийцы в точности совпадает с «почерком» препарата, который должен спасать жизни?

Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Бактерии всегда окружены большим количеством различных молекул. Одни нужны для «коммуникации» с другими бактериями и формирования биопленок, вторые — для подавления роста конкурентов, третьи — для поражения эукариотических клеток и процесса инфекции. Они невероятно разнообразны как по структуре, так и по своим функциям. Но возникает вопрос, как же они проходят бактериальные мембраны и попадают во внешнюю среду?

Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Современные подходы к лечению спортивных мышечных травм часто направлены на подавление симптомов, но не обеспечивают полноценного восстановления ткани. В обзоре рассматриваются перспективные методы, направленные на прямую стимуляцию регенеративных процессов. Среди них — целевая доставка факторов роста с помощью биосовместимых наночастиц, избирательное удаление стареющих клеток сенолитиками для улучшения среды регенерации и оптимизация режима приема глюкокортикоидов, позволяющая использовать их репаративный потенциал со сниженными побочными эффектами. Анализ показывает, что будущее терапии мышечных повреждений лежит в создании комбинированных и персонализированных стратегий, которые не подавляют, а регулируют естественные механизмы восстановления.