-
1259Екатерина Храмеева — биоинформатик, кандидат биологических наук, старший преподаватель Центра молекулярной и клеточной биологии Сколтеха. Работала в Институте проблем передачи информации, Университете Лейпцига, Центре им. Гельмгольца (Мюнхен) и других академических институтах и компаниях в России и за рубежом. Область научных интересов — биоинформатика во всех ее проявлениях: от вариаций генома и архитектуры хроматина до экспрессии генов и эволюции метаболома.
-
1258Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: В статье описываются различные семейства белков теплового шока (Hsp), по какому принципу их выделяют и как они помогают или не помогают другим белкам. Интерес исследователей вызывают противоречивые взаимодействия Hsp и их влияние на протекание болезней, например, нейродегенеративных. Естественно, белки теплового шока участвуют и в процессах старения организма.
-
1256Метод молекулярной динамики (МД) прочно вошел в арсенал физиков, химиков и, конечно, биологов, поскольку дает возможность узнать подробности движения сложных молекулярных систем. В нашей стране он стал использоваться с 1970-х годов. Наверняка вы хоть раз видели красочные анимации с «ожившими» белками или ДНК, которые колеблются и двигаются в пространстве. Трудно представить, каким образом в советских НИИ на громоздких ЭВМ создавалось то, что сейчас делается на суперкомпьютерах. В этой статье, возрождающей Спецпроект по молекулярной динамике, мы расскажем о пионерах метода МД в СССР, которые воссоздали то, что происходит в природе, в оперативной памяти компьютера. Вы узнаете, как советские ученые провели первое в мире моделирование полимера и через какие этапы они прошли, чтобы заложить основы современной структурной биоинформатики.
-
1254Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: В современном мире здоровый образ жизни стал модной тенденцией. Но каждый знает: как бы ты ни следил за своим здоровьем, всё равно природа возьмет свое, и наступит старость. В незапамятные времена искать источник вечной молодости было заботой правителей и высшей знати. С ростом уровня качества жизни всё больше людей хотят пожить подольше. Особо храбрые из них не готовы сидеть сложа руки. Они ступили на тропу войны со старостью. Какие подходы самые перспективные? Какие препараты уже протестированы на людях? Чем геронтологии поможет ИИ? Как заработать стартапу в области долголетия? И самое главное: когда, наконец, можно будет купить лекарство от старения в ближайшей аптеке? Обсудим эти вопросы и разберемся, кто взялся за непростую задачу поиска вечной юности и что из этого вышло.
-
1251Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Вы наверняка слышали о том, что люди, постоянно занимающиеся умственным трудом, живут дольше и менее подвержены таким нейродегенеративным заболеваниям, как болезнь Альцгеймера. Но может ли активность нервных клеток быть обращена во вред организму? Последние исследования в области нейроонкологии показали, что глиобластома, злокачественная опухоль мозга, способна «паразитировать» на нейронах, выживать и расти за счет их работы. Эта статья посвящена обзору адаптаций новообразования к такому «образу жизни».
-
Август 2024-го ознаменовался ускоренным одобрением FDA препарата Tecelra (от Adaptimmune), ставшего на рынке инновацией сразу по трем направлениям. Во-первых, это первая генно-инженерная клеточная терапия, направленная на уничтожение со́лидной опухоли; во-вторых — первое новое лечение по данному показанию (неоперабельная/метастатическая синовиальная саркома) более чем за десятилетие; наконец, в-третьих — это совсем новый тип терапии (ранее исследовавшийся лишь в клинических испытаниях). Очевидно, что американский регулятор подарил этому препарату путевку в жизнь совсем не случайно, но насколько он на самом деле прорывной и эффективный? Разбираемся в нашей статье.
-
Проблема стремительного распространения устойчивости к антибиотикам среди патогенных бактерий — одна из самых острых проблем современной медицины, поэтому разработка новых антибиотиков сейчас является очень важной задачей. Недавно на страницах журнала Cell американские исследователи сообщили, что сумели найти новый потенциальный антибиотик широкого спектра в базе данных соединений Drug Repurposing Hub с помощью машинного обучения. Обнаруженное вещество получило название галицин. Авторы работы экспериментально показали, что галицин обладает бактерицидной активностью против бактерий разных филогенетических групп, включая такие патогены человека, как возбудитель туберкулеза Mycobacterium tuberculosis и возбудитель колита Clostridioides difficile. Наша статья посвящена новой стратегии поиска потенциальных антибиотиков с помощью машинного обучения.
-
Статья на конкурс «био/мол/текст»: Как ни заглянешь в лабораторию биофизики на Школе молекулярной и теоретической биологии в Пущино — удивишься: вот ребята режут свёклу, вот измельчают репку на тёрке, вот сотрудники рисуют на доске куски пиццы... Темноволосый старшеклассник в фартуке достаёт прихваткой контейнер из микроволновки. Нет, он не записался на кулинарные курсы. Он окрашивает белки в геле после электрофореза.
-
1244Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Миллионы лет назад, когда наша планета была еще совсем молодой, каким-то волшебным образом жизнь зародилась в Мировом океане. Еще через какое-то время появились первые автотрофные организмы. Они долго и упорно эволюционировали и в результате длительного процесса самосовершенствования достигли процветания. Их «стараниями» в воздушной оболочке Земли скопилось достаточное количество кислорода, который так нужен живым организмам. Теперь наша прекрасная голубая планета выгодно отличается от других космических объектов в плане наличия воды, атмосферы, да и в целом комфортных условий для существования. Возможно ли организовать нечто подобное где-нибудь на ближайшем от Земли объекте? Или хотя бы попробовать? Давайте разбираться.
