Подписаться
  • ИИ в биологии
    Как языковые модели покорили мир белков
    Обзор
    «Сухая» биология Биомолекулы Биотехнологии ДНК Синтетическая биология
    Как языковые модели покорили мир белков
    2174 0,6
    На фоне конкуренции между Microsoft, Google, Meta, Amazon и другими техногигантами за звание обладателя лучшего чат-бота, достижения аналогичных моделей в биохимии и структурной биологии остаются слегка за кадром. А успехи есть, и еще какие! В этой статье спецпроекта «Искусственный интеллект в биологии» «Биомолекула» постарается исправить несправедливость и расскажет, как работают «большие языковые модели» на последовательностях биомолекул и к чему их можно применить в биологии. Мы также обсудим аналогии между биополимерами и привычными нам текстами, которые позволяют применять языковые модели к белкам и ДНК. Не забудем поговорить и про нашумевший AlphaFold — причем будем его не только хвалить! Ну и как всегда, поделимся кейсами, которые уже меняют структурную и другие области биологии.
    1 Мария Кадукова 07 марта 2024
  • «Био/мол/текст»-2023/2024
    Свободная тема
    Почему в Рязани грибы с глазами?
    Обзор
    Биология Биомолекулы Микробиология Процессы Цитология
    Почему в Рязани грибы с глазами?
    288 0,1
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Ответ на поставленный вопрос будем искать в светочувствительных системах человека и приматов; мышей и птичек; комаров и бабочек; простейшего многоклеточного животного трихоплакса; растения Арабидопсис; в бактериальных генах, которые повлияли на формирование зрения многоклеточных; и даже у грибов Aspergillus nidulans и Neurospora crassa. В этой статье представлены данные последних исследований спектральной чувствительности грибов, пластинчатых животных и человека, а также рассмотрены реакции ДНК на ультрафиолетовый свет разных диапазонов и участие в этом «цинковых пальцев». Наличие бактерий-симбионтов в синцитиальных сетях грибов и трихоплакса и успехи в «программировании» бактериальных ДНК создают предпосылки для использования этих организмов как модельных, а также создания существ, которых ранее не было в природе.
    0 Даниил Козырицкий 04 марта 2024
  • «Био/мол/текст»-2023/2024
    Наглядно о ненаглядном
    Микробиом человека
    Обзор
    Биомембраны Медицина Микробиология Процессы Цитология
    Микробиом человека
    409 0,1
    Обзор на конкурс «Био/Мол/Текст»: Краткий обзор проекта, проводившегося Национальными институтами здравоохранения США с 2007 по 2016 год. Предлагаем ознакомиться читателю с кратким обзором инициативы «Микробиом человека», который мы выполнили в формате научного журнала. В обзоре описываются основные этапы проекта, наиболее часто используемые методы и ключевые результаты. Также дается оценка актуальности данных исследований как для научного сообщества, так и для широкой общественности.
    1 Екатерина Магера 27 февраля 2024
  • Бактериофаги
    Бактериофаги для отделения интенсивной терапии: российские исследователи проверили новый подход
    Новость
    Вирусология Медицина Фармакология
    Бактериофаги для отделения интенсивной терапии: российские исследователи проверили новый подход
    497 0,2
    Интерес врачей и ученых к применению бактериофагов в лечении бактериальных инфекций продолжает расти во всем мире. Во многом это продиктовано нарастающей проблемой антибиотикорезистентности. У фагопрепаратов есть преимущества, но с их внедрением в клиническую практику возникает немало сложностей. Например, трудно совместить современные требования к клиническим исследованиям и регистрации лекарственных препаратов с необходимостью создавать для пациентов с инфекциями, вызванными разными видами и штаммами микроорганизмов, персонализированные коктейли из фагов. Эксперты ищут пути решения этой проблемы. Перспективный подход продемонстрировали исследователи из Федерального научно-клинического центра реаниматологии и реабилитологии (ФНКЦ РР) и НПЦ «Микромир». В своей работе, опубликованной 14 декабря 2023 года в журнале Antibiotics, они подбирали комбинации бактериофагов не индивидуально для каждого пациента, а с учетом бактерий, циркулирующих в отделении интенсивной терапии.
    0 Артем Кабанов 26 февраля 2024
  • «Био/мол/текст»-2023/2024
    Своя работа
    Лимфома Беркитта: как вирус Эпштейна — Барр гены сближал
    Обзор
    Вирусология Иммунология Медицина Своя работа
    Лимфома Беркитта: как вирус Эпштейна — Барр гены сближал
    703 0,2
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Девять из десяти человек в мире заражены вирусом Эпштейна — Барр (EBV). Этот вирус может никак не проявить себя в течение всей жизни, а может вызывать рост злокачественной опухоли. Одной из таких опухолей, связанных с EBV, является лимфома Беркитта — агрессивная опухоль из B-лимфоцитов. Она возникает в результате генетической перестройки, при которой участки двух разных хромосом по ошибке соединяются друг с другом. Подобные перестройки называют хромосомными транслокациями. В нашей недавней работе мы раскрыли, как EBV подталкивает B-лимфоциты к хромосомной транслокации, вызывающей лимфому Беркитта.
    0 Анна Шмакова 26 февраля 2024
  • «Био/мол/текст»-2023/2024
    Свободная тема
    Microvenus — арт-объект, созданный с помощью генной инженерии, или как заставить символ «жить»?
    Обзор
    Биотехнологии Микробиология Мнения
    Microvenus — арт-объект, созданный с помощью генной инженерии, или как заставить символ «жить»?
    362 0,1
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Если вам тесно в рутине будней лаборатории или не хватает холста и масла для выражения себя, то добро пожаловать в Art&Science;, сферу пересечения науки и искусства! Это молодая область, на которую, кстати говоря, уже можно выучиться за рубежом и в России, представляет постиндустриальный тип художественного высказывания с использованием научных методик. Меняющаяся реальность ХХI века требует осмысления, постмодернизм цветет и пахнет, междисциплинарность захватывает позиции. Био-арт — раздолье для молекулярного биолога и художника, которым стало скучно и захотелось сотворить нечто большее. Например, живое произведение искусства с помощью инструментов и методов молекулярной биологии, как это впервые сделал американский художник Джо Дэвис. В этой статье познакомимся с арт-объектом Microvenus и разберемся с тем, как он был создан и «что хотел сказать автор».
    1 Анна Валина 06 февраля 2024
  • «Био/мол/текст»-2023/2024
    Свободная тема
    Бактерии и ртуть
    Обзор
    Биомолекулы Метаболизм Микробиология
    Бактерии и ртуть
    550 0,2
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Бактерии — удивительные и по-настоящему уникальные организмы. Их можно найти практически везде: в воде, воздухе, в почве и других местах. А некоторые представители могут выживать в таких условиях, которые бы привели к неминуемой гибели других живых организмов. Так, существуют виды, обитающие при экстремальных температурах, например, в вечной мерзлоте и горячих источниках. Некоторые бактерии способны выдерживать пониженное или повышенное давление. А другие — противостоять действию высокотоксичных веществ, например, тяжелых металлов. В этой статье мы разберемся, как бактерии могут противостоять действию токсичных веществ, смертельных для других организмов. Но для начала нужно понять, что такое тяжелые металлы и какую опасность они представляют.
    1 Мария Ликанэ 29 января 2024
  • Данна Стоф: «Осьминоги, каракатицы, адские вампиры. 500 миллионов лет истории головоногих моллюсков». Рецензия Рецензии
    Биология Эволюционная биология
    Данна Стоф: «Осьминоги, каракатицы, адские вампиры. 500 миллионов лет истории головоногих моллюсков». Рецензия
    117 0,0
    Многочисленные, удивительные, невероятные обитатели океанских глубин предстанут перед читателем в выгодном свете. Даже если тема головоногих вам не очень интересна, Данна Стоф найдет, чем привлечь внимание — и если не влюбит в моллюсков, то несомненно заставит их уважать.
    0 Элина Стоянова 27 января 2024
  • Победитель «Био/мол/текст»-2023/2024
    Академия & бизнес
    Стартап-завтрак, который мы заслужили: фрикадельки из мамонта, кофе без кофеина, яйца не от куриц и многое другое
    Обзор
    CRISPR/CAS Биология Биотехнологии ГМО Генная инженерия Питание
    Стартап-завтрак, который мы заслужили: фрикадельки из мамонта, кофе без кофеина, яйца не от куриц и многое другое
    568 0,2
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: В последние годы биотехнологическая отрасль переживает своеобразный «бум», в особенности в сфере питания. Наблюдается значительный прогресс в производстве и разработке инновационных продуктов. Позвольте мне пригласить вас в будущее — в мир стартапов, которые революционизировали пищевые технологии. В рамках этого путешествия длиной в восемь глав мы будем собирать идеальный завтрак будущего. Начнем с кофе без кофеина, погрузившись в мир инноваций. Затем познакомимся с веганской кулинарией, где яичный белок производится с помощью грибной культуры. Откроем для себя острые томаты и вкуснейшие неострые листья горчицы. Также мы изучим процесс получения пищи из воздуха, сможем распечатать лосося на 3D-принтере и, наконец, обнаружим мамонта в кулинарном мире. Приготовьтесь к путешествию!
    0 Елизавета Пономарчук 25 января 2024
  • «Био/мол/текст»-2023/2024
    Свободная тема
    «Остановить туберкулез!» — приказала ВОЗ
    Обзор
    Вакцины Здравоохранение Иммунология Медицина
    «Остановить туберкулез!» — приказала ВОЗ
    524 0,2
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Данная статья посвящена рассмотрению факторов патогенности Mycobacterium tuberculosis и их использованию в современных методах борьбы с туберкулезом (диагностические тесты, вакцины и терапия). Вы узнаете, что помогает палочке Коха быть такой стойкой, какие вакцины и лекарства вот-вот «выйдут в свет» и успеем ли мы выполнить указание ВОЗ: «End TB!».
    0 Варвара Щиплецова 23 января 2024