irina6804@mail.ru 0,0

Следующее интервью спецпроекта «Биология в России: люди и открытия» мы взяли у Артема Исаева, доцента, заведующего Лабораторией анализа метагеномов в Сколтехе и лауреата премии Президента Российской Федерации в области науки и инноваций для молодых ученых за 2025 год. Мы поговорили, как можно стать биологом «с детского сада», как устроена работа студентов в российских и западных лабораториях, как поставить на поток изучение противовирусных систем бактерий и что таят в себе коммерческие фаговые коктейли.

Предсказание пространственной структуры белка — задача, сформулированная еще Кристианом Анфинсеном, — на протяжении десятилетий решалась лишь косвенно. Ситуация радикально изменилась с появлением AlphaFold 1/2. Его успех был настолько значительным, что уже ознаменовался Нобелевской премией (в 2024 г.) и породил ощущение, что проблема в целом «закрыта». Однако история этим не закончилась: современная версия — AlphaFold 3 — объединяет эволюционный подход, унаследованный от предыдущих поколений, и диффузионные модели, пришедшие из генерации изображений. Такое сочетание позволяет выйти за пределы белковых структур и предсказывать целые «молекулярные сцены» с участием малых молекул или нуклеиновых кислот. Станет ли AlphaFold3 панацеей — или структуры белок-лигандных комплексов требуют новых подходов? Георгий Куракин, постоянный автор «Биомолекулы», пытается разобраться в этом вопросе с помощью Алексея Орлова, руководителя Лаборатории вычислительной биомедицины и молекулярной диагностики Центрального университета.