Подписаться
23karpova.ss@gmail.com

23karpova.ss@gmail.com 0,0

  • Биология в России
    ДНК в трех измерениях: как сибирские ученые изучают архитектуру генома
    Обзор
    Биология Биомолекулы ДНК Места
    ДНК в трех измерениях: как сибирские ученые изучают архитектуру генома
    99 0,0
    Спецпроект «Биология в России: люди открытия» снова отправляется в Сибирь, только на этот раз в Институт цитологии и генетики СО РАН, — чтобы поговорить о 3D-геномике с руководителем Лаборатории генетики развития Нариманом Баттулиным. Как выяснилось, 3D-геномика богата на интересные детали и неожиданные повороты. Что такое «структурное эхо» митоза? Насколько сложно вывести генетическую линию «мышей-моржей», а главное, зачем это нужно? Нашли ли ученые ответ на загадку: зачем геному нужны ТАДы? Узнаем во время беседы. Приятного прочтения!
    0 Элина Стоянова 31 августа 2026
  • ИИ в биологии
    AlphaFold 3: как диффузионные модели пришли в предсказание структуры белков
    Обзор
    «Сухая» биология Биомолекулы Биотехнологии
    AlphaFold 3: как диффузионные модели пришли в предсказание структуры белков
    252 0,1
    Предсказание пространственной структуры белка — задача, сформулированная еще Кристианом Анфинсеном, — на протяжении десятилетий решалась лишь косвенно. Ситуация радикально изменилась с появлением AlphaFold 1/2. Его успех был настолько значительным, что уже ознаменовался Нобелевской премией (в 2024 г.) и породил ощущение, что проблема в целом «закрыта». Однако история этим не закончилась: современная версия — AlphaFold 3 — объединяет эволюционный подход, унаследованный от предыдущих поколений, и диффузионные модели, пришедшие из генерации изображений. Такое сочетание позволяет выйти за пределы белковых структур и предсказывать целые «молекулярные сцены» с участием малых молекул или нуклеиновых кислот. Станет ли AlphaFold3 панацеей — или структуры белок-лигандных комплексов требуют новых подходов? Георгий Куракин, постоянный автор «Биомолекулы», пытается разобраться в этом вопросе с помощью Алексея Орлова, руководителя Лаборатории вычислительной биомедицины и молекулярной диагностики Центрального университета.
    0 Георгий Куракин 28 августа 2026
  • Нейротехнологии
    Яд, который обезболивает: как ботулотоксин оказался забытым героем в борьбе с мигренью
    Обзор
    Биомолекулы Иммунология Нейробиология Фармакология
    Яд, который обезболивает: как ботулотоксин оказался забытым героем в борьбе с мигренью
    380 0,1
    Ботулинический токсин типа А, известный большинству как ботокс, у обычного читателя ассоциируется исключительно с косметологией. Но с 2010 года это — единственный препарат, который FDA одобрило специально для профилактики хронической мигрени — тяжелой формы заболевания, при которой голова болит 15 и более дней в месяц. При этом в обзорах современной анальгетической терапии ботулотоксин почти не встречается: он не похож ни на один класс обезболивающих и долгое время оставался слепым пятном в общей картине борьбы с болью. В этой статье, продолжающей цикл «Нейрофармакология», разбираемся, как токсин, вызывающий смертельное пищевое отравление, стал лекарством; как устроена его молекула на уровне отдельных доменов; и почему расхожее объяснение «ботокс просто расслабляет мышцы» оказалось неверным. Сравним ботулотоксин с его главным конкурентом — антителами к CGRP, разберем данные крупнейшей программы клинических испытаний PREEMPT и заглянем в лаборатории, где разрабатывают следующее поколение избирательных ботулотоксинов, не затрагивающих мышцы.
    0 Егор Дергачев 21 августа 2026
  • Молекулярная динамика
    Молекулярная динамика биомолекул. Часть III. От перфокарт до ИИ
    Обзор
    «Сухая» биология Биомолекулы Биофизика
    Молекулярная динамика биомолекул. Часть III. От перфокарт до ИИ
    486 0,2
    Сегодня молекулярную динамику можно запускать на обычной рабочей станции — и это кажется само собой разумеющимся. Но еще сорок лет назад смоделировать один белок (даже пептид!) было выдающимся техническим достижением, доступным считанным лабораториям с доступом к машинам размером с комнату. В продолжении спецпроекта о Молекулярной динамике рассказываем, как она (МД) прошла этот путь: от специализированных силовых полей и параллельных суперкомпьютеров до графических процессоров, сделавших микросекундные расчеты рутиной. А искусственный интеллект — это конец этой истории или начало новой?
    0 Ирина Веретененко 17 июля 2026
  • Атлас гистоновых модификаций в раннем митозе Новость
    ДНК Своя работа Хроматин
    Атлас гистоновых модификаций в раннем митозе
    591 0,2
    В митозе хромосомы конденсируются в белковые остовы с исходящими из них петлями хроматина: объем хромосом уменьшается в 2–3 раза, а гистоны фосфорилируются и, в определенных системах, деацетилируются. Однако до недавнего времени отсутствовала информация о кинетике навешивания гистоновых модификаций в раннем митозе. Более того, на базе информации при блоке клеток в митозе нокодазолом возникла гипотеза, что деацетилирование гистонов в митозе ведет к компактизации хромосом. Однако полного подтверждения или опровержения этой гипотезы до недавнего времени не было. Эти пробелы устранила международная команда из Мюнхена и Эдинбурга, которая составила атлас гистоновых модификаций в раннем митозе, а также показала, что в плане деацетилирования гистонов система с нокодазолом ведет к артефактам.
    0 Наталья Кочанова 26 мая 2026
  • Томас Чек: «Первая молекула: как РНК раскрывает главные тайны биологии». Рецензия Рецензии
    Биомолекулы РНК
    Томас Чек: «Первая молекула: как РНК раскрывает главные тайны биологии». Рецензия
    214 0,1
    Долгое время считалось, что РНК — всего лишь бэк-вокалистка на сцене ДНК. Однако функционал этой молекулы заставил мир перевернуть свое представление о ней. Складываясь в трехмерные формы, как оригами, она хранит информацию и иногда ведет себя как фермент. РНК служит матрицей и компонентом теломеразы — фермента, который замедляет клеточное старение, достраивая ДНК на концах хромосом. Еще РНК участвует в сборке белков и может направлять систему CRISPR, вмешиваясь в генетическую программу клетки. Неслучайно многие токсины и сильнейшие яды направлены на уничтожение нашей драгоценной РНК. А распространенные вирусы, такие как коронавирус, вирус гриппа и другие, содержат РНК-геном вместо ДНК-генома. Об истории открытий в области РНК из первых уст рассказывает Томас Чек — лауреат Нобелевской премии по химии.
    0 Мария Лукашина 09 мая 2026
  • Расширение центральной догмы молекулярной биологии: бактериальный фермент синтезирует ДНК определенной последовательности без нуклеотидной матрицы Новость
    Генетика ДНК
    Расширение центральной догмы молекулярной биологии: бактериальный фермент синтезирует ДНК определенной последовательности без нуклеотидной матрицы
    1365 0,6
    Природа удивительна, а наука — важнейший инструмент ее познания. И особенно меня впечатляет, когда для чисто фундаментальных открытий люди начинают придумывать, как их можно было бы использовать на практике. На днях в журнале Science вышла статья американских исследователей [1], в которой они впервые показали, что длинные и специфичные последовательности ДНК могут синтезироваться без привычной нуклеотидной матрицы. Вместо этого используется матрица белка.
    0 Александра Филатова 01 мая 2026
  • «Био/мол/текст»-2025/2026
    Школьная
    GENA-LM: российская языковая модель, которая помогает увидеть невидимые закономерности в ДНК
    Обзор
    «Сухая» биология Биология
    GENA-LM: российская языковая модель, которая помогает увидеть невидимые закономерности в ДНК
    257 0,1
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Нейросети уже давно вышли за рамки обычного языка: сегодня они уверенно справляются с биологическими последовательностями. GENA Language Models — семейство языковых моделей, созданное исследователями Института искусственного интеллекта AIRI для анализа геномных данных и обнаружения в них скрытых закономерностей. Модель учитывает до 36 тысяч нуклеотидов, при этом умея выявлять сложные взаимосвязи, что позволяет предсказывать влияние генетических вариантов, обнаруживать регуляторные элементы и перспективе способствовать развитию медицины. Далее, я расскажу, как нейросети, использующие принципы обработки последовательностей, схожих с теми, что используются в моделях человеческого языка, могут как бы «читать» и интерпретировать ДНК, и почему такой подход меняет способы работы биологов с геномными данными.
    1 Денис Ласточкин 13 апреля 2026
  • «Био/мол/текст»-2025/2026
    Свободная тема
    Две крепости одного организма: вагинальная и кишечная микробиота
    Обзор
    Медицина Метаболизм Микробиология
    Две крепости одного организма: вагинальная и кишечная микробиота
    1178 0,5
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Кишечная и вагинальная микробиоты долгое время считались изолированными системами. Однако исследования показывают, что между ними существует тесная связь. Наша статья расскажет о механизмах этого удивительного диалога и о том, как его нарушение приводит к болезням.
    0 Олеся Иванкова 08 апреля 2026
  • Победитель «Био/мол/текст»-2025/2026
    Наглядно о ненаглядном
    Противораковые мРНК-вакцины: инструкция для победы иммунитета
    Обзор
    Биомолекулы Вакцины Медицина Наглядно о ненаглядном
    Противораковые мРНК-вакцины: инструкция для победы иммунитета
    433 0,2
    Инфографика на конкурс «Био/Мол/Текст»: Во времена пандемии COVID-19 вакцины на основе мРНК против SARS-CoV-2 от компаний Moderna и BioNTech/Pfizer стали революционным достижением с точки зрения их быстрой разработки и эффективности, что ускорило темпы исследований в области РНК-терапии. Но также эта инновационная технология обладает потенциалом в борьбе с одной из главных угроз здоровью и жизни людей — онкологическими заболеваниями. На сегодняшний день многочисленные терапевтические противораковые мРНК-вакцины находятся на разных стадиях клинических испытаний, демонстрируя неплохие результаты. Почему же технология мРНК оказалась так актуальна для лечения онкологии?
    0 Евгения Аленина 02 апреля 2026