Нелли Аракелян 0,0

Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: ДНК — не такая уж скучная и «правильная» молекула, как принято считать. На ней уживаются вместе очень непохожие последовательности — и кодирующие, и регуляторные, и повторяющиеся, и мобильные элементы генома, и невесть еще какие. Те, что не служат матрицей для синтеза белка и/или РНК, могут, тем не менее, в нем активно участвовать в другом качестве — как в случае промоторов, на которых начинается транскрипция ДНК. Предсказание положения промоторов в пока неизученных геномах имеет огромное значение для аннотации геномов и биотехнологии. И это — один из самых старых, можно сказать, «проклятых вопросов» биоинформатики, который все еще далек от окончательного решения. Как так вышло и возможно ли в принципе точно «вылавливать» промоторные последовательности ДНК — в том числе из неведомых геномов, которые нам поставляет секвенирование нового поколения?

Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: ОРВИ срывает планы, мешает жить и иногда может протекать долго и тяжело. Возбудителями сезонных простудных заболеваний является целый ряд вирусов, но особый интерес у исследователей вызывают наиболее опасные вирусы, которые могут приводить к смерти: вирусы гриппа, SARS-СoV-2 и РСВ. Но почему всего для нескольких вирусов, вызывающих ОРВИ, в базах данных можно найти 17 миллионов последовательностей геномов? Зачем исследователям повторно определять последовательности геномов вирусов? О том, что повторное секвенирование не такое уж повторное и зачем нам столько данных о генетике вирусов, читайте в этой статье.

Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: «Клеточный мультикультурализм» — новый подход к использованию ИПСК в доклинических исследованиях, персонализированной медицине и функциональной геномике. Возможность синергетически соединять различные методы современной биологии стимулирует ученых проектировать новые сложные подходы для решения как исследовательских, так и прикладных задач. В этой статье расскажем о попытках ученых разработать новый экономически оптимальный подход к работе с человеческими индуцированными плюрипотентными стволовыми клетками (ИПСК) для масштабных популяционных исследований. Использование отобранных у широких выборок людей ИПСК позволит глубже (на функционально-клеточном уровне) изучить генетически обусловленное человеческое разнообразие и ляжет в основу доклинических исследований с привлечением реальных пациентов. Успех подхода облегчит изучение связи картины патогенеза заболеваний и особенностей действия лекарственных препаратов с индивидуальными генетическими факторами, одновременно позволяя получать данные для персонализированного или специализированного для целевых групп лечения. Ниже мы попробуем раскрыть вопрос, что в действительности могут значить ИПСК для доклиники, а затем взглянем на сложную методическую работу, которую ведут ученые для обоснования нового подхода, эффективно сочетающего крупные достижения в области методов клеточной и молекулярно-вычислительной биологии последних десятилетий.

Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Как говорил Аристотель, жизнь есть движение. Как говорят ученые сегодня, воспроизведение жизни без движения невозможно. Подвижность сперматозоидов считается ключевым фактором, определяющим фертильность. Их сниженная мобильность или неподвижность называется астенозооспермия. Это одна из форм мужского бесплодия, которая возникает из-за нарушения организации жгутика или неправильного созревания сперматозоидов. Как происходит это созревание? За что ответственны структурные элементы жгутика в зрелых половых клетках? Ответы на эти вопросы способны решить проблему мужского бесплодия.