-
На фоне конкуренции между Microsoft, Google, Meta, Amazon и другими техногигантами за звание обладателя лучшего чат-бота, достижения аналогичных моделей в биохимии и структурной биологии остаются слегка за кадром. А успехи есть, и еще какие! В этой статье спецпроекта «Искусственный интеллект в биологии» «Биомолекула» постарается исправить несправедливость и расскажет, как работают «большие языковые модели» на последовательностях биомолекул и к чему их можно применить в биологии. Мы также обсудим аналогии между биополимерами и привычными нам текстами, которые позволяют применять языковые модели к белкам и ДНК. Не забудем поговорить и про нашумевший AlphaFold — причем будем его не только хвалить! Ну и как всегда, поделимся кейсами, которые уже меняют структурную и другие области биологии.
-
Видео на конкурс «Био/Мол/Текст»: Наночастицы — герои эффективной каталитической реакции, лечения рака и не только. Эти объекты размером меньше микрометра получают разрушением макроматериалов механическим, электрическим или лазерным воздействием или образованием кластеров из молекул и ионов в результате химической реакции.
-
Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Ответ на поставленный вопрос будем искать в светочувствительных системах человека и приматов; мышей и птичек; комаров и бабочек; простейшего многоклеточного животного трихоплакса; растения Арабидопсис; в бактериальных генах, которые повлияли на формирование зрения многоклеточных; и даже у грибов Aspergillus nidulans и Neurospora crassa. В этой статье представлены данные последних исследований спектральной чувствительности грибов, пластинчатых животных и человека, а также рассмотрены реакции ДНК на ультрафиолетовый свет разных диапазонов и участие в этом «цинковых пальцев». Наличие бактерий-симбионтов в синцитиальных сетях грибов и трихоплакса и успехи в «программировании» бактериальных ДНК создают предпосылки для использования этих организмов как модельных, а также создания существ, которых ранее не было в природе.
-
Первый мартовский выпуск SciNat в 2024 году принес свежие вести из мира науки. Из нового дайджеста вы узнаете о том, почему болит мочевой пузырь и как клетки эндотелия вызывают фиброз. Новая вакцина от ВИЧ заставляет вирус выйти на свет. В Африке разгорается лихорадка Ласса, а биофизики научились еще точнее измерять термодинамические изменения в живых клетках. Ученые-нейробиологи стали лучше разбираться в механизме действия синаптического белка. Новым трендом в генной терапии заболеваний становятся эпигенетические вмешательства без изменения последовательности генома.
-
«Магия всегда оставляет следы, мистер Поттер, порою очень приметные». С этим утверждением Дамблдора согласятся не только герои саги о мальчике, который выжил, но и современные биологи. На нашей планете творится иное волшебство — магия жизни, однако и она способна оставлять свои отметки. В окружающей среде постоянно циркулируют геномы огромного количества живых существ. Они не так приметны, как отпечатки темных заклятий, но современная наука научилась их находить и понимать. В новой статье Спецпроекта «Мультиомиксные технологии» мы увидим, как современные методы позволяют делать выводы об изменении нашего мира по незримым следам живых существ, его населяющих.
-
1194Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Что может быть увлекательнее, чем когда ученые называют открытые молекулы в честь любимых персонажей игры! В «Биомолекуле» уже обсуждались молекулы-«стрелочники» Wnt, но они не единственные в многоклеточных организмах, которые лучше других разбираются, как жить эту жизнь (в какие клетки делиться и какие ткани создавать). В этой статье пойдет речь еще об одном «умнике» — еже, который также командует и говорит клеткам, что им делать.
-
Обзор на конкурс «Био/Мол/Текст»: Краткий обзор проекта, проводившегося Национальными институтами здравоохранения США с 2007 по 2016 год. Предлагаем ознакомиться читателю с кратким обзором инициативы «Микробиом человека», который мы выполнили в формате научного журнала. В обзоре описываются основные этапы проекта, наиболее часто используемые методы и ключевые результаты. Также дается оценка актуальности данных исследований как для научного сообщества, так и для широкой общественности.
-
647Интерес врачей и ученых к применению бактериофагов в лечении бактериальных инфекций продолжает расти во всем мире. Во многом это продиктовано нарастающей проблемой антибиотикорезистентности. У фагопрепаратов есть преимущества, но с их внедрением в клиническую практику возникает немало сложностей. Например, трудно совместить современные требования к клиническим исследованиям и регистрации лекарственных препаратов с необходимостью создавать для пациентов с инфекциями, вызванными разными видами и штаммами микроорганизмов, персонализированные коктейли из фагов. Эксперты ищут пути решения этой проблемы. Перспективный подход продемонстрировали исследователи из Федерального научно-клинического центра реаниматологии и реабилитологии (ФНКЦ РР) и НПЦ «Микромир». В своей работе, опубликованной 14 декабря 2023 года в журнале Antibiotics, они подбирали комбинации бактериофагов не индивидуально для каждого пациента, а с учетом бактерий, циркулирующих в отделении интенсивной терапии.
-
1038Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Девять из десяти человек в мире заражены вирусом Эпштейна — Барр (EBV). Этот вирус может никак не проявить себя в течение всей жизни, а может вызывать рост злокачественной опухоли. Одной из таких опухолей, связанных с EBV, является лимфома Беркитта — агрессивная опухоль из B-лимфоцитов. Она возникает в результате генетической перестройки, при которой участки двух разных хромосом по ошибке соединяются друг с другом. Подобные перестройки называют хромосомными транслокациями. В нашей недавней работе мы раскрыли, как EBV подталкивает B-лимфоциты к хромосомной транслокации, вызывающей лимфому Беркитта.
