Подписаться
Антон Чугунов Биомолекула

Антон Чугунов 267,3

Институт биоорганической химии РАН

VK

В 2003 году я закончил кафедру биофизики биофака МГУ. Работаю старшим научным сотрудником в Лаборатории моделирования биомолекулярных систем Института биоорганической химии РАН. Я — сооснователь и главный редактор этого сайта. С 2007 года.

  • Белковые галлюцинации: как справляется <em>AlphaFold</em>? Обзор
    Биомолекулы Биотехнологии Мнения
    Белковые галлюцинации: как справляется AlphaFold?
    1695 0,5
    Не успев пережить триумф нейросетей (в лице AlphaFold) в предсказании строения белков, структурная биоинформатика взялась за обратную задачу: подбор последовательности для заданной трехмерной укладки. Но решение этой проблемы пока сдерживается фундаментальными ограничениями, присущими и самой программе AlphaFold. В этой колонке я постараюсь объяснить, почему нейросети в структурной биоинформатике не стоит считать панацеей.
    0 Георгий Куракин 18 ноября 2022
  • «Био/мол/текст»-2018
    Свободная тема
    Дарвин в сумасшедшем доме: эволюционный взгляд на психические расстройства
    Обзор
    Биология Депрессия Эволюционная биология
    Дарвин в сумасшедшем доме: эволюционный взгляд на психические расстройства
    3899 1,8
    Статья на конкурс «био/мол/текст»: Медицина — это часть биологии. «Ничто в биологии не имеет смысла, кроме как в свете эволюции», — эти слова Феодосия Григорьевича Добржанского можно отнести и к медицине. Целое направление — эволюционная медицина — пытается отыскать эволюционные корни в нашем здоровье и болезнях, поражающих человеческие тела. В этом тексте эволюционные поиски будут проведены внутри психиатрии.
    0 Виктор Лебедев 28 августа 2018
  • Исторический геном стеллеровой коровы проливает свет на причины ее вымирания Новость
    Биология Своя работа Секвенирование ДНК
    Исторический геном стеллеровой коровы проливает свет на причины ее вымирания
    1010 0,4
    Проанализировав ядерный геном стеллеровой коровы — морского млекопитающего, некогда обитавшего в северной Пацифике, — ученые пришли к выводу, что процесс вымирания этого вида начался задолго до прибытия человека современного типа в Берингию. Показано также, что последняя популяция этого животного, обнаруженная российскими моряками на побережье Командорских островов, была обречена на вымирание вследствие низкого генетического разнообразия.
    0 Артем Недолужко 14 апреля 2021
  • ИИ в биологии
    Как языковые модели покорили мир белков
    Обзор
    «Сухая» биология Биомолекулы Биотехнологии ДНК Синтетическая биология
    Как языковые модели покорили мир белков
    2713 0,6
    На фоне конкуренции между Microsoft, Google, Meta, Amazon и другими техногигантами за звание обладателя лучшего чат-бота, достижения аналогичных моделей в биохимии и структурной биологии остаются слегка за кадром. А успехи есть, и еще какие! В этой статье спецпроекта «Искусственный интеллект в биологии» «Биомолекула» постарается исправить несправедливость и расскажет, как работают «большие языковые модели» на последовательностях биомолекул и к чему их можно применить в биологии. Мы также обсудим аналогии между биополимерами и привычными нам текстами, которые позволяют применять языковые модели к белкам и ДНК. Не забудем поговорить и про нашумевший AlphaFold — причем будем его не только хвалить! Ну и как всегда, поделимся кейсами, которые уже меняют структурную и другие области биологии.
    1 Мария Кадукова 07 марта 2024
  • Курительные смеси Spice — без «химии» не обошлось Новость
    Биомолекулы Медицина
    Курительные смеси Spice — без «химии» не обошлось
    10241 5,1
    В последние годы в европейских странах, США и СНГ началась активная кампания по запрету так называемых «легальных» курительных смесей. Первой в список запрещённых препаратов попала сальвия; в России также были запрещены составы на основе голубого лотоса. На очереди оказались смеси под общим названием «Spice», в которых государственные контролирующие органы заподозрили наличие синтетических аналогов алкалоидов конопли (марихуаны). Немецкие исследователи провели независимое изыскание, подтвердившее эти опасения.
    20 Петр Старокадомский 22 июля 2010
  • «Био/мол/текст»-2014
    Лучшая новость
    Пространственное разделение транскрипции и трансляции в клетках бактерии <em>Gemmata obscuriglobus</em>
    Новость
    Биомембраны Генетика Микробиология
    Пространственное разделение транскрипции и трансляции в клетках бактерии Gemmata obscuriglobus
    2256 1,0
    Статья на конкурс «био/мол/текст»: Клетки эукариот обладают ядерной мембраной, физически разделяющей два этапа экспрессии генов (транскрипцию и трансляцию). У прокариот (бактерий и архей) отсутствие ядерной мембраны приводит к совместной локализации транскрипции и трансляции. Однако внутри клеток бактерии Gemmata obscuriglobus обнаружена хорошо развитая сеть мембран, внешне напоминающих эукариотические, в силу чего трансляция в значительной степени не сопряжена с транскрипцией. Эти результаты расширяют наши представления о пространственной организации экспрессии бактериальных генов, базирующиеся главным образом на исследовании некоторых модельных организмов, а также весьма важны для понимания того, как в ходе эволюции могла возникнуть пространственная разобщённость этапов экспрессии генов эукариот.
    0 Сергей Киселев 06 ноября 2014
  • «Био/мол/текст»-2013
    Лучший обзор
    Большие дела небольших молекул: как малые РНК дирижируют генами бактерий
    Обзор
    CRISPR/CAS Микробиология РНК РНК-интерференция Цитология
    Большие дела небольших молекул: как малые РНК дирижируют генами бактерий
    5522 2,6
    Статья на конкурс «био/мол/текст»: В последние годы РНК — а особенно ее «неклассические» разновидности — приковывает внимание биологов всего мира. Выяснилось, что регуляция с помощью некодирующих РНК широко распространена — начиная от вирусов и бактерий и заканчивая человеком. Изучение разнообразия малых бактериальных РНК-регуляторов ясно показало их важную роль как в промежуточном метаболизме, так и в адаптивных реакциях. В этой статье описаны разновидности малых РНК бактерий и механизмы регуляции, осуществляемые с их помощью. Особый акцент сделан на роли этих молекул в жизнедеятельности бактериальных агентов, вызывающих особо опасные инфекции.
    3 Антон Керманов 03 октября 2013
  • SciNat за ноябрь 2017 ##3–4: вызывающая опухоли противоопухолевая терапия, роль количества бактерий в кишечнике, секрет молодости клеток зародышевого пути Дайджест
    Биология
    SciNat за ноябрь 2017 ##3–4: вызывающая опухоли противоопухолевая терапия, роль количества бактерий в кишечнике, секрет молодости клеток зародышевого пути
    431 0,2
    На этот раз дайджест получился сдвоенным. В нём вы найдёте описания статей сразу двух выпусков Nature и двух выпусков Science. Тем интереснее! Особенно много за прошедшие две недели появилось сведений о различных белковых структурах и о генетике. Не обошлось и без CRISPR и нейробиологии.
    0 Светлана Ястребова 28 ноября 2017
  • Счастливая подруга Гарольда: как изменения в геноме пенсионерки привели к утрате болевой чувствительности Новость
    Биология
    Счастливая подруга Гарольда: как изменения в геноме пенсионерки привели к утрате болевой чувствительности
    913 0,4
    Случай 66-летней жительницы Великобритании широко разошелся по новостным лентам и удивил многих. У пациентки, которая в течение жизни почти не жаловалась на боль и редко использовала обезболивающие, обнаружили мутации, нарушающие работу фермента, который разрушает эндоканнабиноиды. В результате у нее в крови циркулирует естественный анальгетик. Возможно, ученые открыли перспективное направление для разработки новых лекарств, избавляющих от боли.
    1 Виктор Лебедев 09 апреля 2019
  • Марти Хейзелтон: «Игры гормонов». Рецензия Рецензии
    Биология Медицина
    Марти Хейзелтон: «Игры гормонов». Рецензия
    491 0,2
    Наша повседневная жизнь уже давно подчиняется логике, которую мы привыкли связывать с работой мозга. А что, если мы с вами до сих пор чувствуем отголоски нашего животного прошлого и выбираем стратегии поведения под действием необычного «гормонального разума»? На страницах своей книги доктор психологии, убежденная феминистка и мать двоих детей Марти Хейзелтон расскажет о важной роли эндокринной системы в жизни женщины, о её влиянии на когнитивные процессы и о том, как, принимая важнейшие решения, научиться соблюдать баланс и не только слышать голос разума, но и использовать свои чувства, продиктованные гормональными изменениями, которые отражают истинные потребности нашего организма. 
    0 Андрей Бахтюков 10 апреля 2021