https://biolabmix.ru/catalog/rna-transcription-mrna/?erid=LdtCKWnpq
Подписаться
Анна Дукат

Анна Дукат 1,5

Магистр кафедры микробиологии биологического факультета МГУ.

  • «Био/мол/текст»-2023/2024
    Игра в «поймай промотор»
    Обзор
    Биомолекулы ДНК РНК
    Игра в «поймай промотор»
    180 0,0
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: ДНК — не такая уж скучная и «правильная» молекула, как принято считать. На ней уживаются вместе очень непохожие последовательности — и кодирующие, и регуляторные, и повторяющиеся, и мобильные элементы генома, и невесть еще какие. Те, что не служат матрицей для синтеза белка и/или РНК, могут, тем не менее, в нем активно участвовать в другом качестве — как в случае промоторов, на которых начинается транскрипция ДНК. Предсказание положения промоторов в пока неизученных геномах имеет огромное значение для аннотации геномов и биотехнологии. И это — один из самых старых, можно сказать, «проклятых вопросов» биоинформатики, который все еще далек от окончательного решения. Как так вышло и возможно ли в принципе точно «вылавливать» промоторные последовательности ДНК — в том числе из неведомых геномов, которые нам поставляет секвенирование нового поколения?
    0 Михаил Орлов 08 апреля 2024
  • «Био/мол/текст»-2023/2024
    Молекулярная коммутация — новый механизм регуляции генов и не только
    Обзор
    Биомолекулы ДНК Процессы
    Молекулярная коммутация — новый механизм регуляции генов и не только
    482 0,0
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Все мы давно привыкли к структуре ДНК. В этой изящной молекуле при помощи одной цепи можно однозначно восстановить вторую. Это свойство не только обеспечивает стабильность и прочность ДНК, но и делает возможными такие процессы, как репликация и транскрипция. По сути, открытие структуры ДНК положило начало современной молекулярной биологии. Однако, несмотря на всю красоту двойной спирали, нуклеотиды могут взаимодействовать и без ее образования. И нет, речь идет не про образование вторичной структуры РНК или ДНК. В новом исследовании изучалось именно взаимодействие между двумя цепями нуклеотидов как в ДНК, лишь с более короткими молекулами длинной в несколько десятков пар нуклеотидов. Только, в отличие от ДНК, связь между цепочками была не стопроцентной, то есть не все нуклеотиды подходили друг к другу.
    0 Дмитрий Козлов 02 апреля 2024
  • «Био/мол/текст»-2023/2024
    Сиквенс лишним не бывает или Зачем мы повторно секвенируем вирусы?
    Обзор
    SARS-CoV-2 Вирусология Грипп Секвенирование ДНК
    Сиквенс лишним не бывает или Зачем мы повторно секвенируем вирусы?
    191 0,0
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: ОРВИ срывает планы, мешает жить и иногда может протекать долго и тяжело. Возбудителями сезонных простудных заболеваний является целый ряд вирусов, но особый интерес у исследователей вызывают наиболее опасные вирусы, которые могут приводить к смерти: вирусы гриппа, SARS-СoV-2 и РСВ. Но почему всего для нескольких вирусов, вызывающих ОРВИ, в базах данных можно найти 17 миллионов последовательностей геномов? Зачем исследователям повторно определять последовательности геномов вирусов? О том, что повторное секвенирование не такое уж повторное и зачем нам столько данных о генетике вирусов, читайте в этой статье.
    0 Никита Ёлшин 27 марта 2024
  • ИИ в биологии
    Как языковые модели покорили мир белков
    Обзор
    «Сухая» биология Биомолекулы Биотехнологии ДНК Синтетическая биология
    Как языковые модели покорили мир белков
    911 0,0
    На фоне конкуренции между Microsoft, Google, Meta, Amazon и другими техногигантами за звание обладателя лучшего чат-бота, достижения аналогичных моделей в биохимии и структурной биологии остаются слегка за кадром. А успехи есть, и еще какие! В этой статье спецпроекта «Искусственный интеллект в биологии» «Биомолекула» постарается исправить несправедливость и расскажет, как работают «большие языковые модели» на последовательностях биомолекул и к чему их можно применить в биологии. Мы также обсудим аналогии между биополимерами и привычными нам текстами, которые позволяют применять языковые модели к белкам и ДНК. Не забудем поговорить и про нашумевший AlphaFold — причем будем его не только хвалить! Ну и как всегда, поделимся кейсами, которые уже меняют структурную и другие области биологии.
    0 Мария Кадукова 07 марта 2024
  • «Био/мол/текст»-2023/2024
    Почему в Рязани грибы с глазами?
    Обзор
    Биология Биомолекулы Микробиология Процессы Цитология
    Почему в Рязани грибы с глазами?
    210 0,0
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Ответ на поставленный вопрос будем искать в светочувствительных системах человека и приматов; мышей и птичек; комаров и бабочек; простейшего многоклеточного животного трихоплакса; растения Арабидопсис; в бактериальных генах, которые повлияли на формирование зрения многоклеточных; и даже у грибов Aspergillus nidulans и Neurospora crassa. В этой статье представлены данные последних исследований спектральной чувствительности грибов, пластинчатых животных и человека, а также рассмотрены реакции ДНК на ультрафиолетовый свет разных диапазонов и участие в этом «цинковых пальцев». Наличие бактерий-симбионтов в синцитиальных сетях грибов и трихоплакса и успехи в «программировании» бактериальных ДНК создают предпосылки для использования этих организмов как модельных, а также создания существ, которых ранее не было в природе.
    0 Даниил Козырицкий 04 марта 2024
  • «Био/мол/текст»-2023/2024
    <em>Sonic Hedgehog</em> и его удивительная молекулярная семья Ёжиков (<em>Hedgehog</em>)
    Обзор
    Биомолекулы Биотехнологии ДНК Процессы Цитология
    Sonic Hedgehog и его удивительная молекулярная семья Ёжиков (Hedgehog)
    237 0,0
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Что может быть увлекательнее, чем когда ученые называют открытые молекулы в честь любимых персонажей игры! В «Биомолекуле» уже обсуждались молекулы-«стрелочники» Wnt, но они не единственные в многоклеточных организмах, которые лучше других разбираются, как жить эту жизнь (в какие клетки делиться и какие ткани создавать). В этой статье пойдет речь еще об одном «умнике» — еже, который также командует и говорит клеткам, что им делать.
    1 Диана Трач 29 февраля 2024
  • «Био/мол/текст»-2023/2024
    Микробиом человека
    Обзор
    Биомембраны Медицина Микробиология Процессы Цитология
    Микробиом человека
    270 0,0
    Обзор на конкурс «Био/Мол/Текст»: Краткий обзор проекта, проводившегося Национальными институтами здравоохранения США с 2007 по 2016 год. Предлагаем ознакомиться читателю с кратким обзором инициативы «Микробиом человека», который мы выполнили в формате научного журнала. В обзоре описываются основные этапы проекта, наиболее часто используемые методы и ключевые результаты. Также дается оценка актуальности данных исследований как для научного сообщества, так и для широкой общественности.
    1 Екатерина Магера 27 февраля 2024
  • Бактериофаги для отделения интенсивной терапии: российские исследователи проверили новый подход Новость
    Вирусология Медицина Фармакология
    Бактериофаги для отделения интенсивной терапии: российские исследователи проверили новый подход
    295 0,0
    Интерес врачей и ученых к применению бактериофагов в лечении бактериальных инфекций продолжает расти во всем мире. Во многом это продиктовано нарастающей проблемой антибиотикорезистентности. У фагопрепаратов есть преимущества, но с их внедрением в клиническую практику возникает немало сложностей. Например, трудно совместить современные требования к клиническим исследованиям и регистрации лекарственных препаратов с необходимостью создавать для пациентов с инфекциями, вызванными разными видами и штаммами микроорганизмов, персонализированные коктейли из фагов. Эксперты ищут пути решения этой проблемы. Перспективный подход продемонстрировали исследователи из Федерального научно-клинического центра реаниматологии и реабилитологии (ФНКЦ РР) и НПЦ «Микромир». В своей работе, опубликованной 14 декабря 2023 года в журнале Antibiotics, они подбирали комбинации бактериофагов не индивидуально для каждого пациента, а с учетом бактерий, циркулирующих в отделении интенсивной терапии.
    0 Артем Кабанов 26 февраля 2024
  • «Био/мол/текст»-2023/2024
    Лимфома Беркитта: как вирус Эпштейна — Барр гены сближал
    Обзор
    Вирусология Иммунология Медицина Своя работа
    Лимфома Беркитта: как вирус Эпштейна — Барр гены сближал
    325 0,0
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Девять из десяти человек в мире заражены вирусом Эпштейна — Барр (EBV). Этот вирус может никак не проявить себя в течение всей жизни, а может вызывать рост злокачественной опухоли. Одной из таких опухолей, связанных с EBV, является лимфома Беркитта — агрессивная опухоль из B-лимфоцитов. Она возникает в результате генетической перестройки, при которой участки двух разных хромосом по ошибке соединяются друг с другом. Подобные перестройки называют хромосомными транслокациями. В нашей недавней работе мы раскрыли, как EBV подталкивает B-лимфоциты к хромосомной транслокации, вызывающей лимфому Беркитта.
    0 Анна Шмакова 26 февраля 2024
  • «Био/мол/текст»-2023/2024
    Microvenus — арт-объект, созданный с помощью генной инженерии, или как заставить символ «жить»?
    Обзор
    Биотехнологии Микробиология Мнения
    Microvenus — арт-объект, созданный с помощью генной инженерии, или как заставить символ «жить»?
    238 0,0
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Если вам тесно в рутине будней лаборатории или не хватает холста и масла для выражения себя, то добро пожаловать в Art&Science;, сферу пересечения науки и искусства! Это молодая область, на которую, кстати говоря, уже можно выучиться за рубежом и в России, представляет постиндустриальный тип художественного высказывания с использованием научных методик. Меняющаяся реальность ХХI века требует осмысления, постмодернизм цветет и пахнет, междисциплинарность захватывает позиции. Био-арт — раздолье для молекулярного биолога и художника, которым стало скучно и захотелось сотворить нечто большее. Например, живое произведение искусства с помощью инструментов и методов молекулярной биологии, как это впервые сделал американский художник Джо Дэвис. В этой статье познакомимся с арт-объектом Microvenus и разберемся с тем, как он был создан и «что хотел сказать автор».
    1 Анна Валина 06 февраля 2024