-
295Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Нейросети уже давно вышли за рамки обычного языка: сегодня они уверенно справляются с биологическими последовательностями. GENA Language Models — семейство языковых моделей, созданное исследователями Института искусственного интеллекта AIRI для анализа геномных данных и обнаружения в них скрытых закономерностей. Модель учитывает до 36 тысяч нуклеотидов, при этом умея выявлять сложные взаимосвязи, что позволяет предсказывать влияние генетических вариантов, обнаруживать регуляторные элементы и перспективе способствовать развитию медицины. Далее, я расскажу, как нейросети, использующие принципы обработки последовательностей, схожих с теми, что используются в моделях человеческого языка, могут как бы «читать» и интерпретировать ДНК, и почему такой подход меняет способы работы биологов с геномными данными.
-
297Второй месяц лета незаметно подошел к концу, а это значит, что пора подвести итоги очередной недели в мире науки. Свежий выпуск научного медиагиганта Nature расскажет о белке с весьма воинственным названием SPARTA, ответит на вопрос, почему конечности человека не регенерируют, как у амфибий, и порадует новыми технологиями, которые позволят еще быстрее и качественнее диагностировать заболевания желудочно-кишечного тракта. А статьи нового выпуска Science в прямом (и переносном) смысле прольют свет на синтез аминокислот и подскажут новый вектор в лечении болезни Альцгеймера. А впереди еще целый месяц лета и множество интересных научных открытий!
-
296Выпуски крупнейших научных журналов Science и Nature, кажется, удивили не только своих читателей, но и исследователей, чьи работы там представлены: например, животные, которых раньше относили к Мшанкам, оказались вовсе не Мшанками — и даже не животными, а всего лишь водорослями, что породило ряд дополнительных вопросов к эволюции Мшанок. «Структурные» исследования на страницах Nature позволят узнать намного больше о рецепторах, сопряженных с G-белком, как и статья, которая точно ответит на вопрос, откуда берутся «простудные» симптомы. А исследования со страниц Science расскажут об удивительном танце пчел и новых технологиях, позволяющих в режиме реального времени рассмотреть передвижения кинезина.
-
Элина Стоянова и Надежда Потапова: «Расплетая ДНК: увлекательный путеводитель по генетике». Рецензия298Юным любителям биологии обязательно придется по вкусу новая книга от издательства «Альпина.Дети», ведь она рассказывает о том, как работает основа земной жизни — генетический код. А еще из нее можно узнать, чем занимаются современные ученые-генетики. И поверьте, дел у них немало.
-
296На этой неделе в Science и Nature вновь много достойных статей о кристаллических структурах, а также о различных видах рака и способах их лечения. Кроме того, мы узнаем нечто новое о формировании головы у эмбрионов рыб и надпочечников у зародышей млекопитающих, а также о том, что сейчас умеют исследовать в рамках отдельно взятой клетки.
-
294Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Генная терапия Casgevy стала событием, которое еще недавно казалось научной фантастикой. Впервые технология CRISPR/Cas9 вышла за пределы лабораторий и доказала свою способность менять судьбы людей с тяжелыми наследственными заболеваниями. В центре статьи — история Виктории Грей, чья жизнь десятилетиями была подчинена боли, и научный прорыв, позволивший «перезагрузить» работу крови на генетическом уровне. Материал объясняет, как активация фетального гемоглобина позволяет остановить разрушительное действие серповидноклеточной болезни, приводит ключевые результаты клинических исследований и поднимает неизбежные вопросы о цене прогресса, доступности высоких технологий и будущем медицины. Casgevy здесь — не просто препарат, а символ новой эры, в которой генетические ошибки перестают быть приговором.
-
«Хроники испанки» Кэтрин Арнольд — научно-популярное изложение одной из самых разрушительных пандемий в истории человечества. Автор рассматривает воздействие испанского гриппа, начиная с первых его вспышек в военных лагерях во время Первой мировой войны и заканчивая его последствиями для населения всей планеты. Книга освещает не только медицинские аспекты пандемии, но и социальные, показывая, как болезнь повлияла на повседневную жизнь людей, на политику и экономику. Кроме того, Арнольд делает параллели между «испанкой» и пандемией COVID-19, освещая сходства в общественных реакциях, что делает книгу особенно актуальной.
-
295Оба журнала на этой неделе рассказывают о цвете и форме, а если говорить точнее, то об окрашенных в разные цвета клетках, их структурах, а также о конформациях различных белков. Где разноцветные (в нашем случае флуоресцентные) огоньки, там должны быть и выключатели. Из свежих Nature и Science мы узнаем, как белок KaiC сверяет внутренние часы цианобактерии с земными сутками, как цитохром P450 вдруг помогает в синтезе опиатов, что происходит в начале работы системы CRISPR/Cas9 и как расположить хромосомы дефектной клетки по экватору, чтобы она не смогла поделиться. Во всех названных случаях большую роль играет конформация одной, а чаще нескольких молекул.
-
296Из этого дайджеста вы узнаете много нового о патогенах человека и способах борьбы с ними. Из успехов на противоположной стороне баррикад: представлены две разные стратегии восстановления бактерий после стрессов; обнаружено, что герпесвирусы воруют моторные белки из клеток, а также идентифицированы новые случаи коронавирусных зоонозов. Из наших успехов: разработана вакцина против клещей и новая вакцина против коронавируса, а также в этом месяце представлен принципиально новый способ борьбы с респираторными вирусами! С некоторыми приживалами наш геном и сам неплохо справляется: например, оказалось, что система подавления мобильных элементов в человеческом геноме эффективна против широкого спектра трансгенов. В этом дайджесте мы публикуем новости из Nature, Science и других журналов, сгруппированные по темам: вы сами выбираете, о каких научных прорывах вам интереснее почитать.