Подписаться
  • ИИ в биологии
    Как языковые модели покорили мир белков
    Обзор
    «Сухая» биология Биомолекулы Биотехнологии ДНК Синтетическая биология
    Как языковые модели покорили мир белков
    2195 0,6
    На фоне конкуренции между Microsoft, Google, Meta, Amazon и другими техногигантами за звание обладателя лучшего чат-бота, достижения аналогичных моделей в биохимии и структурной биологии остаются слегка за кадром. А успехи есть, и еще какие! В этой статье спецпроекта «Искусственный интеллект в биологии» «Биомолекула» постарается исправить несправедливость и расскажет, как работают «большие языковые модели» на последовательностях биомолекул и к чему их можно применить в биологии. Мы также обсудим аналогии между биополимерами и привычными нам текстами, которые позволяют применять языковые модели к белкам и ДНК. Не забудем поговорить и про нашумевший AlphaFold — причем будем его не только хвалить! Ну и как всегда, поделимся кейсами, которые уже меняют структурную и другие области биологии.
    1 Мария Кадукова 07 марта 2024
  • «Био/мол/текст»-2023/2024
    Свободная тема
    Почему в Рязани грибы с глазами?
    Обзор
    Биология Биомолекулы Микробиология Процессы Цитология
    Почему в Рязани грибы с глазами?
    292 0,1
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Ответ на поставленный вопрос будем искать в светочувствительных системах человека и приматов; мышей и птичек; комаров и бабочек; простейшего многоклеточного животного трихоплакса; растения Арабидопсис; в бактериальных генах, которые повлияли на формирование зрения многоклеточных; и даже у грибов Aspergillus nidulans и Neurospora crassa. В этой статье представлены данные последних исследований спектральной чувствительности грибов, пластинчатых животных и человека, а также рассмотрены реакции ДНК на ультрафиолетовый свет разных диапазонов и участие в этом «цинковых пальцев». Наличие бактерий-симбионтов в синцитиальных сетях грибов и трихоплакса и успехи в «программировании» бактериальных ДНК создают предпосылки для использования этих организмов как модельных, а также создания существ, которых ранее не было в природе.
    0 Даниил Козырицкий 04 марта 2024
  • Павел Боев, Дмитрий Буренко: «Дикие города». Рецензия Рецензии
    Биология Детям Экология
    Павел Боев, Дмитрий Буренко: «Дикие города». Рецензия
    127 0,0
    Красивая книга о животных и растениях, живущих и произрастающих близ городов, может стать глотком свежего воздуха для тех, кто устал от каменных джунглей. Она напомнит — жизнь кипит, стоит выйти за пределы привычных маршрутов, жизнь окружает города, она там, недалеко, рукой подать.
    0 Элина Стоянова 02 марта 2024
  • Мультиомиксные технологии
    Мультиомика и Экологические тайны третьей планеты
    Обзор
    Биодеградация Биомолекулы Биотехнологии Генетика Экология
    Мультиомика и Экологические тайны третьей планеты
    514 0,2
    «Магия всегда оставляет следы, мистер Поттер, порою очень приметные». С этим утверждением Дамблдора согласятся не только герои саги о мальчике, который выжил, но и современные биологи. На нашей планете творится иное волшебство — магия жизни, однако и она способна оставлять свои отметки. В окружающей среде постоянно циркулируют геномы огромного количества живых существ. Они не так приметны, как отпечатки темных заклятий, но современная наука научилась их находить и понимать. В новой статье Спецпроекта «Мультиомиксные технологии» мы увидим, как современные методы позволяют делать выводы об изменении нашего мира по незримым следам живых существ, его населяющих.
    0 Денис Новиков 01 марта 2024
  • «Био/мол/текст»-2023/2024
    Свободная тема
    <em>Sonic Hedgehog</em> и его удивительная молекулярная семья Ёжиков (<em>Hedgehog</em>)
    Обзор
    Биомолекулы Биотехнологии ДНК Процессы Цитология
    Sonic Hedgehog и его удивительная молекулярная семья Ёжиков (Hedgehog)
    723 0,1
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Что может быть увлекательнее, чем когда ученые называют открытые молекулы в честь любимых персонажей игры! В «Биомолекуле» уже обсуждались молекулы-«стрелочники» Wnt, но они не единственные в многоклеточных организмах, которые лучше других разбираются, как жить эту жизнь (в какие клетки делиться и какие ткани создавать). В этой статье пойдет речь еще об одном «умнике» — еже, который также командует и говорит клеткам, что им делать.
    1 Диана Трач 29 февраля 2024
  • «Био/мол/текст»-2023/2024
    Наглядно о ненаглядном
    Микробиом человека
    Обзор
    Биомембраны Медицина Микробиология Процессы Цитология
    Микробиом человека
    409 0,1
    Обзор на конкурс «Био/Мол/Текст»: Краткий обзор проекта, проводившегося Национальными институтами здравоохранения США с 2007 по 2016 год. Предлагаем ознакомиться читателю с кратким обзором инициативы «Микробиом человека», который мы выполнили в формате научного журнала. В обзоре описываются основные этапы проекта, наиболее часто используемые методы и ключевые результаты. Также дается оценка актуальности данных исследований как для научного сообщества, так и для широкой общественности.
    1 Екатерина Магера 27 февраля 2024
  • Бактериофаги
    Бактериофаги для отделения интенсивной терапии: российские исследователи проверили новый подход
    Новость
    Вирусология Медицина Фармакология
    Бактериофаги для отделения интенсивной терапии: российские исследователи проверили новый подход
    499 0,2
    Интерес врачей и ученых к применению бактериофагов в лечении бактериальных инфекций продолжает расти во всем мире. Во многом это продиктовано нарастающей проблемой антибиотикорезистентности. У фагопрепаратов есть преимущества, но с их внедрением в клиническую практику возникает немало сложностей. Например, трудно совместить современные требования к клиническим исследованиям и регистрации лекарственных препаратов с необходимостью создавать для пациентов с инфекциями, вызванными разными видами и штаммами микроорганизмов, персонализированные коктейли из фагов. Эксперты ищут пути решения этой проблемы. Перспективный подход продемонстрировали исследователи из Федерального научно-клинического центра реаниматологии и реабилитологии (ФНКЦ РР) и НПЦ «Микромир». В своей работе, опубликованной 14 декабря 2023 года в журнале Antibiotics, они подбирали комбинации бактериофагов не индивидуально для каждого пациента, а с учетом бактерий, циркулирующих в отделении интенсивной терапии.
    0 Артем Кабанов 26 февраля 2024
  • «Био/мол/текст»-2023/2024
    Своя работа
    Лимфома Беркитта: как вирус Эпштейна — Барр гены сближал
    Обзор
    Вирусология Иммунология Медицина Своя работа
    Лимфома Беркитта: как вирус Эпштейна — Барр гены сближал
    709 0,2
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Девять из десяти человек в мире заражены вирусом Эпштейна — Барр (EBV). Этот вирус может никак не проявить себя в течение всей жизни, а может вызывать рост злокачественной опухоли. Одной из таких опухолей, связанных с EBV, является лимфома Беркитта — агрессивная опухоль из B-лимфоцитов. Она возникает в результате генетической перестройки, при которой участки двух разных хромосом по ошибке соединяются друг с другом. Подобные перестройки называют хромосомными транслокациями. В нашей недавней работе мы раскрыли, как EBV подталкивает B-лимфоциты к хромосомной транслокации, вызывающей лимфому Беркитта.
    0 Анна Шмакова 26 февраля 2024
  • Таня Медведева, Мария Вышинская: «Вокруг Антарктики: исследуем ледяной юг». Рецензия Рецензии
    Биология Экология
    Таня Медведева, Мария Вышинская: «Вокруг Антарктики: исследуем ледяной юг». Рецензия
    90 0,0
    Манящая холодная Антарктика... Пингвины, айсберги, ледяная пустошь, станция «Восток». Такой перечень приходит первым делом на ум. Но, конечно, это — лишь своя «вершина айсберга» бескрайней Антарктики. В новой книге издательства «Самокат», которая, без сомнений, будет интересна и взрослым, и детям, даются ответы на разнообразные вопросы об этом далеком, грандиозном и притягательном континенте. (А еще в конце рецензии вы найдете наше интереснейшее интервью с авторами книги!).
    0 Надежда Потапова 24 февраля 2024
  • Онкология
    От медицинской онкологии к молекулярной биологии рака
    Обзор
    Биомолекулы Генетика Медицина Метаболизм Онкология Процессы Цитология
    От медицинской онкологии к молекулярной биологии рака
    1961 0,6
    Хотя злокачественные опухоли известны человечеству, вероятно, с самого момента появления нашего вида, природа этой группы заболеваний стала понятна только во второй половине 20-го века, когда на стыке онкологии и молекулярной биологии возникла новая область знания — молекулярная онкология. В вводной статье нашего спецпроекта «Онкология» мы рассмотрим основные этапы развития этой науки и дадим краткое описание ключевых признаков рака (hallmarks of cancer), которые отличают злокачественные опухоли от здоровых тканей на молекулярном и клеточном уровне и объясняют основные симптомы рака: способность к безудержному росту, устойчивость к лечению и высокую вероятность рецидива удаленной опухоли, а также распространение по организму (метастазирование).
    0 Мария Кондратова 22 февраля 2024