https://siriusbiotech.ru/?erid=2Vfnxx5qDku
Подписаться
Данила Гриш

Данила Гриш 0,0

  • «Био/мол/текст»-2025/2026
    Искусственный интеллект в биологии
    Эволюция как векторное поле: подход <em>evo-velocity</em> в анализе белков
    Обзор
    «Сухая» биология Биомолекулы
    Эволюция как векторное поле: подход evo-velocity в анализе белков
    201 0,0
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Современные белковые языковые модели позволяют по-новому взглянуть на эволюцию белков, рассматривая ее как направленное движение в латентном пространстве последовательностей. В статье разбирается подход evo-velocity, который использует вероятностные оценки языковых моделей для реконструкции направлений и относительной динамики эволюционных изменений без построения филогенетических деревьев. Показано, как метод воспроизводит известные эволюционные траектории вирусов и белковых семейств, какие предпосылки лежат в его основе и какие ограничения следует учитывать при интерпретации результатов. Подход evo-velocity иллюстрирует, что статистика белковых последовательностей содержит информацию не только о структуре и функции, но и о динамике эволюции.
    0 Сергей Двойников 15 января 2026
  • «Био/мол/текст»-2020/2021
    Своя работа
    Неуловимая архитектура хроматина мухи
    Новость
    Биология Биомолекулы Биотехнологии Хроматин Цитология
    Неуловимая архитектура хроматина мухи
    751 0,3
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Судьба клетки во многом определяется тем, как ее гены, закодированные в ДНК, считываются и работают. Мы узнаём всё больше о том, как в этом процессе важна пространственная организация хроматина (иными словами — его архитектура). Структурная биология хроматина — большая и кипучая область, и именно здесь можно придумать и поставить такой эксперимент, который прояснит фундаментальные принципы жизни клетки. Мне удалось стать не только свидетелем, но и участником такого события. С помощью непростого эксперимента фиксации конформации хромосом одиночных клеток мы предположили два возможных механизма формирования структуры хроматина мухи, тесно связанных с активностью генов. Более того, мы выяснили ряд особенностей хроматина этого организма. На пути к открытию пришлось преодолеть всевозможные трудности. И теперь, когда работа опубликована в Nature Communications, я делюсь рассказом о том, почему это было не только трудно, но и интересно.
    0 Александра Галицына 04 января 2021
  • «Био/мол/текст»-2022/2023
    Нейробиология
    Старение «иммунитета» головного мозга
    Обзор
    Биология Иммунология Нейробиология Старение
    Старение «иммунитета» головного мозга
    1666 0,5
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Долгое время считалось, что мозг — иммунопривилегированный орган, в котором развитие воспалительных реакций не представляется возможным. Вот только за последние 50 лет вопрос о наличии иммунной защиты в центральной нервной системе был в корне пересмотрен. Сегодня ни для кого не секрет, что функции иммунитета (и не только) выполняет сообщество резидентных профессиональных фагоцитов — микроглия. К сожалению, с возрастом микроглиальные клетки теряют интерес к своим рутинным обязанностям и отправляются на поиски себя, что сказывается на работе всей центральной нервной системы. Именно об этих малых по размеру, но не менее важных по значению клетках и пойдет речь.
    0 Александр Охальников 09 марта 2023