sxabieva@mail.ru 0,0

Предсказание пространственной структуры белка — задача, сформулированная еще Кристианом Анфинсеном, — на протяжении десятилетий решалась лишь косвенно. Ситуация радикально изменилась с появлением AlphaFold 1/2. Его успех был настолько значительным, что уже ознаменовался Нобелевской премией (в 2024 г.) и породил ощущение, что проблема в целом «закрыта». Однако история этим не закончилась: современная версия — AlphaFold 3 — объединяет эволюционный подход, унаследованный от предыдущих поколений, и диффузионные модели, пришедшие из генерации изображений. Такое сочетание позволяет выйти за пределы белковых структур и предсказывать целые «молекулярные сцены» с участием малых молекул или нуклеиновых кислот. Станет ли AlphaFold3 панацеей — или структуры белок-лигандных комплексов требуют новых подходов? Георгий Куракин, постоянный автор «Биомолекулы», пытается разобраться в этом вопросе с помощью Алексея Орлова, руководителя Лаборатории вычислительной биомедицины и молекулярной диагностики Центрального университета.

«Биология в России: люди и открытия» — это спецпроект, который рассказывает об успешных биологах, работающих в нашей стране. На этот раз мы отправляемся в Институт проблем экологии и эволюции имени А. Н. Северцова РАН, расположенный прямо напротив Нескучного сада в Москве. Там нас ждет беседа с доктором биологических наук Алексеем Тиуновым, который заведует лабораторией почвенной зоологии и общей энтомологии. Вместе с ним мы постараемся выяснить, каково это — быть почвенным зоологом, и ответы на какие вопросы ищет экология сегодня.