https://www.dia-m.ru/news/160425-multikonferentsiya-life-sciences-biotekhnologii/?utm_source=biomolecula&utm_medium=banner&utm_campaign=kazan1604&erid=2VfnxwSNezC
Подписаться
Биология

«Сухая» биология

«Сухая» биология

Если вас интересует биоинформатика, молекулярное моделирование, омики, большие данные и машинное обучение, то вам сюда! Эта рубрика посвящена той части биологических исследований, которая происходит не в полях и не в пробирках, а в цифровой среде, то есть с применением компьютерных вычислений.

Здесь читатель узнает о биологии in silico, о ее развитии и методах; как моделируют отдельные белки, как моделируют их движения, как моделируют более сложные системы и даже как моделируют мозг; как на компьютере создают лекарства; как связаны молекулярная биология и лингвистика, о молодых дисциплинах «с большими данными» и о том, что будет дальше.

Сортировка

Формат статьи

Конкурсные статьи

Период публикации

  • «Био/мол/текст»-2017
    Своя работа
    «Следствие ведут...»: изучаем новую белковую мишень в иммуноонкологии
    Обзор
    «Сухая» биология Драг-дизайн Иммунология Наука из первых рук Своя работа Фармакология
    «Следствие ведут...»: изучаем новую белковую мишень в иммуноонкологии
    827 0,4
    Статья на конкурс «био/мол/текст»: Иммунитет — вещь непростая. Он обеспечивает нашу защиту от вторжения всевозможных вирусов и бактерий. В то же время иммунитет порой становится нашим врагом, начиная атаковать собственный организм. Тогда говорят о развитии аутоиммунных заболеваний. К счастью, это случается не так уж и часто — всего в 5% случаев [1]. Такая вот противоречивая натура. Но, как известно, запретный плод сладок, а чем сложнее явление, тем больше хочется найти заветную разгадку. Не хотите попробовать «приручить» иммунную систему?
    0 Карина Пац 29 ноября 2017
  • «Био/мол/текст»-2017
    Свободная тема
    Имитация сердечного слоя
    Новость
    «Сухая» биология Биотехнологии Биофизика Медицина Наука из первых рук
    Имитация сердечного слоя
    571 0,3
    Статья на конкурс «био/мол/текст»: В 40% случаев причиной сердечно-сосудистых заболеваний является аритмия. Чтобы понять предпосылки развития аритмии, необходимо учитывать сложную структуру сердечной ткани. Исследовательская группа под руководством Константина Агладзе и Александра Панфилова разработала первую компьютерную модель, которая имитирует форму и взаимодействие реальных клеток.
    0 Мария Комарова 23 ноября 2017
  • Наука витает в облаках Обзор
    «Сухая» биология Биомолекулы ОколоНауки
    Наука витает в облаках
    894 0,4
    Вокруг нас сотни и тысячи вычислительных устройств. Иная лампочка сейчас умнее марсохода. Но если вы возьметесь за разработку лекарства от... даже не рака, а гриппа, то одними умными лампочками, смартфонами и даже рабочими станциями уже не обойтись. Узнайте о том, какие задачи решают современные биоинформатики и в каких неожиданных местах они находят вычислительные ресурсы.
    1 Артур Залевский 09 июня 2017
  • Хаос в мозге Обзор
    «Сухая» биология Нейробиология
    Хаос в мозге
    3129 1,5
    Если бы мы могли увидеть активность всех нейронов коры нашего мозга, мы бы, скорее всего, решили, что она совершенно беспорядочна и случайна. Однако это только на первый взгляд. Недавно биологи выяснили, что внешне беспорядочное поведение нейронов в коре можно объяснить с помощью известного в физике феномена динамического хаоса (который, впрочем, далек от полнейшего беспорядка). Вооружившись новыми знаниями, они даже научились управлять небольшим виртуальным роботом. Так что же такое хаос и какое отношение имеет он к работе нейронов мозга?
    3 Анатолий Бучин 25 мая 2017
  • «Био/мол/текст»-2016
    Свободная тема
    Мечту вызывали?
    Новость
    «Сухая» биология Биомолекулы ОколоНауки Структурная биология
    Мечту вызывали?
    1559 0,8
    Статья на конкурс «био/мол/текст»: В октябре 2016 года группа российских биоинформатиков выиграла этап престижных научных соревнований ENCODE-DREAM, приуроченный к семинару по применению методов анализа данных и машинного обучения в биологии, проходящему в рамках международной конференции ISCB-RECOMB по регуляторной и системной геномике. Предложенный российской командой алгоритм для предсказания мест связывания белков, регулирующих экспрессию генов, был признан лучшим. Однако история победы биоинформатической команды под руководством Ивана Кулаковского — это больше, чем просто «история успеха» (хотя и это дорогого стоит); эта история о том, как на наших глазах формируется и начинает работать принципиально новая модель организации науки.
    1 Мария Кондратова 07 ноября 2016
  • «Био/мол/текст»-2016
    Свободная тема
    Теоретическая химия: от молекулы водорода до структуры белков
    Обзор
    «Сухая» биология Биология Биомолекулы
    Теоретическая химия: от молекулы водорода до структуры белков
    2810 1,0
    Статья на конкурс «био/мол/текст»: Сто лет назад Гилберт Н. Льюис рисовал химические формулы с точками, обозначающими электроны, а Нильс Бор формулировал постулаты квантовой теории и объяснял строение атома. Эта статья о том, как эволюционировали представления ученых о химической связи, как эти представления помогли увидеть структуру молекул, а знания о молекулярной структуре помогли развитию теории, и как ученые пришли к искусству моделирования живых белков в действии.
    1 Александра Фрейдзон 03 ноября 2016
  • «Био/мол/текст»-2016
    Свободная тема
    Проблема фолдинга белка
    Обзор
    «Сухая» биология Биомолекулы Биотехнологии Биофизика Структурная биология
    Проблема фолдинга белка
    13369 6,1
    Статья на конкурс «био/мол/текст»: Белки — главные биологические молекулы. Они выполняют множество разнообразных функций: каталитическую, структурную, транспортную, рецепторную и многие другие. Даже всем известная ДНК играет лишь роль «флешки», храня информацию о белках, в то время как белки — сами «файлы». Жизнь на Земле по праву можно назвать белковой. Но так ли много мы знаем о структуре и функционировании этих веществ? До сих пор тайной остается фолдинг белка — процесс пространственной упаковки белковой молекулы, принятия белком строго определенной формы, в которой он выполняет свои функции.
    0 Илья Кренёв 16 октября 2016
  • Blue brain project: связи и хаос Новость
    «Сухая» биология Нейробиология
    Blue brain project: связи и хаос
    2754 1,4
    Как миллиарды нейронов мозга связаны между собой, а нервная активность формирует мысли? В конце 2015 года ученые приблизились к ответу на эти вопросы. В проекте Blue Brain была создана детальная реконструкция небольшого участка моторной коры — 31 тысяча нейронов, связанных друг с другом восьмью миллионами связей. Активность нейронной сети смоделировали на суперкомпьютере. Это позволило ученым проверить важнейшие принципы работы мозга многих млекопитающих, в том числе человека.
    6 Анатолий Бучин 21 июня 2016
  • Исследовательская группа Филиппа Хайтовича, или Как биологи работают с большими массивами данных Обзор
    «Сухая» биология Личность Места Нейробиология
    Исследовательская группа Филиппа Хайтовича, или Как биологи работают с большими массивами данных
    1968 0,9
    Ученые из лаборатории профессора Филиппа Хайтовича в Исследовательском центре по биотехнологиям и биомедицине Сколтеха работают с большими массивами данных, полученных на секвенаторах и масс-спектрометрах в партнерских лабораториях из разных уголков земного шара. Все это делается для того, чтобы раскрыть тайны эволюции и работы головного мозга человека и животных, а также решить множество других научных и практических задач.
    0 Алина Чернова 08 мая 2016
  • Сome to the bioinformatics side: Институт биоинформатики в Санкт-Петербурге Обзор
    «Сухая» биология Генетика Места Образование Секвенирование ДНК
    Сome to the bioinformatics side: Институт биоинформатики в Санкт-Петербурге
    4399 2,1
    Институт биоинформатики существует в Петербурге с 2013 года. За несколько лет малоизвестные курсы по биоинформатике, открытые в 2010 на базе Академического университета РАН, превратились в годовую программу, на которой студентов (биологов и информатиков) учат видеть и решать серьезные биоинформатические проблемы. Миссия института — популяризовать биоинформатику и создать сообщество ученых, способных развивать это направление в России. Здесь мы расскажем, как устроен Институт биоинформатики, как в нём «делают» биоинформатиков, какие проблемы в целом стоят перед этой наукой и почему ее важно (и круто) изучать.
    0 Марина Слащева 17 апреля 2016