-
827Статья на конкурс «био/мол/текст»: Иммунитет — вещь непростая. Он обеспечивает нашу защиту от вторжения всевозможных вирусов и бактерий. В то же время иммунитет порой становится нашим врагом, начиная атаковать собственный организм. Тогда говорят о развитии аутоиммунных заболеваний. К счастью, это случается не так уж и часто — всего в 5% случаев [1]. Такая вот противоречивая натура. Но, как известно, запретный плод сладок, а чем сложнее явление, тем больше хочется найти заветную разгадку. Не хотите попробовать «приручить» иммунную систему?
-
Статья на конкурс «био/мол/текст»: В 40% случаев причиной сердечно-сосудистых заболеваний является аритмия. Чтобы понять предпосылки развития аритмии, необходимо учитывать сложную структуру сердечной ткани. Исследовательская группа под руководством Константина Агладзе и Александра Панфилова разработала первую компьютерную модель, которая имитирует форму и взаимодействие реальных клеток.
-
Вокруг нас сотни и тысячи вычислительных устройств. Иная лампочка сейчас умнее марсохода. Но если вы возьметесь за разработку лекарства от... даже не рака, а гриппа, то одними умными лампочками, смартфонами и даже рабочими станциями уже не обойтись. Узнайте о том, какие задачи решают современные биоинформатики и в каких неожиданных местах они находят вычислительные ресурсы.
-
Если бы мы могли увидеть активность всех нейронов коры нашего мозга, мы бы, скорее всего, решили, что она совершенно беспорядочна и случайна. Однако это только на первый взгляд. Недавно биологи выяснили, что внешне беспорядочное поведение нейронов в коре можно объяснить с помощью известного в физике феномена динамического хаоса (который, впрочем, далек от полнейшего беспорядка). Вооружившись новыми знаниями, они даже научились управлять небольшим виртуальным роботом. Так что же такое хаос и какое отношение имеет он к работе нейронов мозга?
-
Статья на конкурс «био/мол/текст»: В октябре 2016 года группа российских биоинформатиков выиграла этап престижных научных соревнований ENCODE-DREAM, приуроченный к семинару по применению методов анализа данных и машинного обучения в биологии, проходящему в рамках международной конференции ISCB-RECOMB по регуляторной и системной геномике. Предложенный российской командой алгоритм для предсказания мест связывания белков, регулирующих экспрессию генов, был признан лучшим. Однако история победы биоинформатической команды под руководством Ивана Кулаковского — это больше, чем просто «история успеха» (хотя и это дорогого стоит); эта история о том, как на наших глазах формируется и начинает работать принципиально новая модель организации науки.
-
2810Статья на конкурс «био/мол/текст»: Сто лет назад Гилберт Н. Льюис рисовал химические формулы с точками, обозначающими электроны, а Нильс Бор формулировал постулаты квантовой теории и объяснял строение атома. Эта статья о том, как эволюционировали представления ученых о химической связи, как эти представления помогли увидеть структуру молекул, а знания о молекулярной структуре помогли развитию теории, и как ученые пришли к искусству моделирования живых белков в действии.
-
Статья на конкурс «био/мол/текст»: Белки — главные биологические молекулы. Они выполняют множество разнообразных функций: каталитическую, структурную, транспортную, рецепторную и многие другие. Даже всем известная ДНК играет лишь роль «флешки», храня информацию о белках, в то время как белки — сами «файлы». Жизнь на Земле по праву можно назвать белковой. Но так ли много мы знаем о структуре и функционировании этих веществ? До сих пор тайной остается фолдинг белка — процесс пространственной упаковки белковой молекулы, принятия белком строго определенной формы, в которой он выполняет свои функции.
-
Как миллиарды нейронов мозга связаны между собой, а нервная активность формирует мысли? В конце 2015 года ученые приблизились к ответу на эти вопросы. В проекте Blue Brain была создана детальная реконструкция небольшого участка моторной коры — 31 тысяча нейронов, связанных друг с другом восьмью миллионами связей. Активность нейронной сети смоделировали на суперкомпьютере. Это позволило ученым проверить важнейшие принципы работы мозга многих млекопитающих, в том числе человека.
-
1968Ученые из лаборатории профессора Филиппа Хайтовича в Исследовательском центре по биотехнологиям и биомедицине Сколтеха работают с большими массивами данных, полученных на секвенаторах и масс-спектрометрах в партнерских лабораториях из разных уголков земного шара. Все это делается для того, чтобы раскрыть тайны эволюции и работы головного мозга человека и животных, а также решить множество других научных и практических задач.
-
Институт биоинформатики существует в Петербурге с 2013 года. За несколько лет малоизвестные курсы по биоинформатике, открытые в 2010 на базе Академического университета РАН, превратились в годовую программу, на которой студентов (биологов и информатиков) учат видеть и решать серьезные биоинформатические проблемы. Миссия института — популяризовать биоинформатику и создать сообщество ученых, способных развивать это направление в России. Здесь мы расскажем, как устроен Институт биоинформатики, как в нём «делают» биоинформатиков, какие проблемы в целом стоят перед этой наукой и почему ее важно (и круто) изучать.