Подписаться
Вячеслав Савельев

Вячеслав Савельев 0,0

  • ИИ в биологии
    Как языковые модели покорили мир белков
    Обзор
    «Сухая» биология Биомолекулы Биотехнологии ДНК Синтетическая биология
    Как языковые модели покорили мир белков
    2195 0,6
    На фоне конкуренции между Microsoft, Google, Meta, Amazon и другими техногигантами за звание обладателя лучшего чат-бота, достижения аналогичных моделей в биохимии и структурной биологии остаются слегка за кадром. А успехи есть, и еще какие! В этой статье спецпроекта «Искусственный интеллект в биологии» «Биомолекула» постарается исправить несправедливость и расскажет, как работают «большие языковые модели» на последовательностях биомолекул и к чему их можно применить в биологии. Мы также обсудим аналогии между биополимерами и привычными нам текстами, которые позволяют применять языковые модели к белкам и ДНК. Не забудем поговорить и про нашумевший AlphaFold — причем будем его не только хвалить! Ну и как всегда, поделимся кейсами, которые уже меняют структурную и другие области биологии.
    1 Мария Кадукова 07 марта 2024
  • Победитель «Био/мол/текст»-2023/2024
    Наглядно о ненаглядном
    Зачем нам наночастицы?
    Обзор
    Биофизика Видео Наглядно о ненаглядном Нано(био)технологии Онкология Персонализированная медицина
    Зачем нам наночастицы?
    317 0,1
    Видео на конкурс «Био/Мол/Текст»: Наночастицы — герои эффективной каталитической реакции, лечения рака и не только. Эти объекты размером меньше микрометра получают разрушением макроматериалов механическим, электрическим или лазерным воздействием или образованием кластеров из молекул и ионов в результате химической реакции.
    0 Арина Вахнина 05 марта 2024
  • Мультиомиксные технологии
    Мультиомика и Экологические тайны третьей планеты
    Обзор
    Биодеградация Биомолекулы Биотехнологии Генетика Экология
    Мультиомика и Экологические тайны третьей планеты
    514 0,2
    «Магия всегда оставляет следы, мистер Поттер, порою очень приметные». С этим утверждением Дамблдора согласятся не только герои саги о мальчике, который выжил, но и современные биологи. На нашей планете творится иное волшебство — магия жизни, однако и она способна оставлять свои отметки. В окружающей среде постоянно циркулируют геномы огромного количества живых существ. Они не так приметны, как отпечатки темных заклятий, но современная наука научилась их находить и понимать. В новой статье Спецпроекта «Мультиомиксные технологии» мы увидим, как современные методы позволяют делать выводы об изменении нашего мира по незримым следам живых существ, его населяющих.
    0 Денис Новиков 01 марта 2024
  • «Био/мол/текст»-2023/2024
    Свободная тема
    <em>Sonic Hedgehog</em> и его удивительная молекулярная семья Ёжиков (<em>Hedgehog</em>)
    Обзор
    Биомолекулы Биотехнологии ДНК Процессы Цитология
    Sonic Hedgehog и его удивительная молекулярная семья Ёжиков (Hedgehog)
    723 0,1
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Что может быть увлекательнее, чем когда ученые называют открытые молекулы в честь любимых персонажей игры! В «Биомолекуле» уже обсуждались молекулы-«стрелочники» Wnt, но они не единственные в многоклеточных организмах, которые лучше других разбираются, как жить эту жизнь (в какие клетки делиться и какие ткани создавать). В этой статье пойдет речь еще об одном «умнике» — еже, который также командует и говорит клеткам, что им делать.
    1 Диана Трач 29 февраля 2024
  • Бактериофаги
    Бактериофаги для отделения интенсивной терапии: российские исследователи проверили новый подход
    Новость
    Вирусология Медицина Фармакология
    Бактериофаги для отделения интенсивной терапии: российские исследователи проверили новый подход
    499 0,2
    Интерес врачей и ученых к применению бактериофагов в лечении бактериальных инфекций продолжает расти во всем мире. Во многом это продиктовано нарастающей проблемой антибиотикорезистентности. У фагопрепаратов есть преимущества, но с их внедрением в клиническую практику возникает немало сложностей. Например, трудно совместить современные требования к клиническим исследованиям и регистрации лекарственных препаратов с необходимостью создавать для пациентов с инфекциями, вызванными разными видами и штаммами микроорганизмов, персонализированные коктейли из фагов. Эксперты ищут пути решения этой проблемы. Перспективный подход продемонстрировали исследователи из Федерального научно-клинического центра реаниматологии и реабилитологии (ФНКЦ РР) и НПЦ «Микромир». В своей работе, опубликованной 14 декабря 2023 года в журнале Antibiotics, они подбирали комбинации бактериофагов не индивидуально для каждого пациента, а с учетом бактерий, циркулирующих в отделении интенсивной терапии.
    0 Артем Кабанов 26 февраля 2024
  • «Био/мол/текст»-2023/2024
    Своя работа
    Лимфома Беркитта: как вирус Эпштейна — Барр гены сближал
    Обзор
    Вирусология Иммунология Медицина Своя работа
    Лимфома Беркитта: как вирус Эпштейна — Барр гены сближал
    708 0,2
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Девять из десяти человек в мире заражены вирусом Эпштейна — Барр (EBV). Этот вирус может никак не проявить себя в течение всей жизни, а может вызывать рост злокачественной опухоли. Одной из таких опухолей, связанных с EBV, является лимфома Беркитта — агрессивная опухоль из B-лимфоцитов. Она возникает в результате генетической перестройки, при которой участки двух разных хромосом по ошибке соединяются друг с другом. Подобные перестройки называют хромосомными транслокациями. В нашей недавней работе мы раскрыли, как EBV подталкивает B-лимфоциты к хромосомной транслокации, вызывающей лимфому Беркитта.
    0 Анна Шмакова 26 февраля 2024
  • «Био/мол/текст»-2023/2024
    Наглядно о ненаглядном
    Аутофагия и канцерогенез
    Обзор
    Аутофагия Цитология
    Аутофагия и канцерогенез
    217 0,1
    Видео на конкурс «Био/Мол/Текст»: Как вы думаете, что такое аутофагия? Да, кратко это самопоедание. В современном употреблении термин «аутофагия» был введен бельгийским биохимиком Кристианом де Дюве. Но открытие самого процесса и расшифровка его механизмов принадлежит японскому ученому Ёсинори Осуми. Этот ролик ответит на такие вопросы, как: зачем нужна аутофагия? Какие типы аутофагии существуют? Какую роль аутофагия выполняет в канцерогенезе?
    0 Джейхун Рагимли 23 февраля 2024
  • Онкология
    От медицинской онкологии к молекулярной биологии рака
    Обзор
    Биомолекулы Генетика Медицина Метаболизм Онкология Процессы Цитология
    От медицинской онкологии к молекулярной биологии рака
    1960 0,6
    Хотя злокачественные опухоли известны человечеству, вероятно, с самого момента появления нашего вида, природа этой группы заболеваний стала понятна только во второй половине 20-го века, когда на стыке онкологии и молекулярной биологии возникла новая область знания — молекулярная онкология. В вводной статье нашего спецпроекта «Онкология» мы рассмотрим основные этапы развития этой науки и дадим краткое описание ключевых признаков рака (hallmarks of cancer), которые отличают злокачественные опухоли от здоровых тканей на молекулярном и клеточном уровне и объясняют основные симптомы рака: способность к безудержному росту, устойчивость к лечению и высокую вероятность рецидива удаленной опухоли, а также распространение по организму (метастазирование).
    0 Мария Кондратова 22 февраля 2024
  • Нейрофармакология
    Ликбез по ЦНС
    Обзор
    Медицина Нейробиология Нейродегенерация Нейромедиаторы Процессы
    Ликбез по ЦНС
    6839 1,5
    Мозг — это орган, который сильнее всего отличает человека от остальных животных. Можно сказать, что человек как вид занимает «когнитивную нишу»: мы достигли впечатляющих (для млекопитающих таких размеров) численности и ареала обитания благодаря своему интеллекту — продукту работы развитого и сложно устроенного мозга. Важная роль мозга для человека означает высокую «цену поломки», и болезни мозга — нарушения развития, психические расстройства, нейродегенеративные и инфекционные заболевания, инсульты и опухоли — становятся огромной проблемой для медицины. Центральная нервная система — важнейший интерфейс для взаимодействия организма с окружающим миром, и даже небольшие изменения в ее работе могут существенно повлиять на приспособленность организма. В рамках нового спецпроекта «Нейрофармакология», прежде чем углубляться в сложности разработки методов терапии для заболеваний мозга, мы предлагаем читателям кратко познакомиться с анатомией и физиологией центральной нервной системы.
    4 Елена Белова 16 февраля 2024
  • «Био/мол/текст»-2023/2024
    Свободная тема
    Как получается вино?
    Обзор
    Биомолекулы Биотехнологии Питание
    Как получается вино?
    1214 0,4
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Амброзия, дар Диониса или греховный напиток — все это о вине, сопровождающем человечество на протяжении семи тысячелетий. Продукт, появившийся, вероятно, по случайному стечению обстоятельств по формуле «избыток винограда + Saccharomyces vini», стал украшением любого праздника и застолья. Сейчас мы знаем гораздо больше о вине, его свойствах и молекулах, нежели в древности. Виноделов, микробиологов и биотехнологов не ставят в тупик вопросы «Как с точки зрения биохимии сок превращается в вино?», «Чем отличаются красные и белые вина?», «Почему вино шипит?» и «Откуда такое разнообразие вкусов и оттенков?». Ответы на них вы найдете и в этой статье.
    1 Анна Валина 15 февраля 2024