Святослав Балтин 0,0

Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Нейросети уже давно вышли за рамки обычного языка: сегодня они уверенно справляются с биологическими последовательностями. GENA Language Models — семейство языковых моделей, созданное исследователями Института искусственного интеллекта AIRI для анализа геномных данных и обнаружения в них скрытых закономерностей. Модель учитывает до 36 тысяч нуклеотидов, при этом умея выявлять сложные взаимосвязи, что позволяет предсказывать влияние генетических вариантов, обнаруживать регуляторные элементы и перспективе способствовать развитию медицины. Далее, я расскажу, как нейросети, использующие принципы обработки последовательностей, схожих с теми, что используются в моделях человеческого языка, могут как бы «читать» и интерпретировать ДНК, и почему такой подход меняет способы работы биологов с геномными данными.

Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Митохондрии известны всем под названием «энергетических станций клетки», но может ли случиться так, что собственная станция создаст серьезные риски — и дело тут не в экологии. Ученые придумали, как спастись от нависшей угрозы.

Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Издавна люди стремились к сохранению здоровья, красоты и молодости, задумывались о поиске чудодейственных средств — волшебных пилюль и эликсиров молодости. До недавнего времени все это казалось лишь сказкой. Но наука не стоит на месте. Развивая представления о природе, окружающей и нашей собственной, маленьких помощниках, скрытых в нас самих, мы сделали выдающийся шаг — по-новому открыли внеклеточные везикулы, повысив их «из грязи», ненужных клеточных отходов, — «в князи», наиважнейшие регуляторы в нашем организме. Все многообразие предназначений и важность везикул ученым еще предстоит понять, а мы в данной статье расскажем об их влиянии на биологические процессы в нашем организме и применении в омоложении и регенеративной медицине.

Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Представление об органеллах как о независимых друг от друга клеточных «органах» доминировало в биологической науке на протяжении нескольких десятков лет. Однако последние исследования показывают, что органеллы не выполняют свои функции изолированно, а активно координируют свою деятельность, общаясь друг с другом посредством так называемых «мембранных контактов» (MCSs, от англ. membrane contact sites). В этой статье мы разбираемся, как устроена сложная сеть взаимодействий между органеллами, какую роль она играет во внутриклеточных процессах и почему нарушение ее работы может иметь серьезные последствия не только на уровне клетки, но и целого организма.

Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Опухоль мозга — это не просто некое чужеродное для организма анатомическое образование. Такие опухоли тесно связаны с процессами с процессами, протекающими в нервной ткани. В этом тексте я предлагаю посмотреть на мозговые опухоли в трех приближениях. Сначала — на уровне одной спирали ДНК, где может происходить мутация в гистоне H3 или серотонилирование гистона. Потом — на уровне взаимодействия нейронов и опухоли: как сами нейроны могут ускорять или замедлять рост опухолевых клеток, а белок тромбоспондин-1 интегрирует глиобластомы в нейронную сеть. И наконец — на уровне ткани: как миелин, обеспечивающий быструю работу мозга, используется опухолью в качестве источника энергии и средства защиты.

Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: В мире животных мимикрия — искусный трюк, чтобы выжить. Оказывается, подобный принцип обмана существует и в наших хромосомах. Мимикрирующие транслокации — это редкие перестройки, при которых морфология хромосом под микроскопом выглядит как клинически значимая транслокация, но на генном уровне ожидаемая перестройка отсутствует, соответствующий химерный ген не образуется. Рассмотрим этот феномен на примере онкогематологических заболеваний.

Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Как человек запоминает важные встречи, лица и детали, так и бактерии хранят «память» о своих самых опасных врагах. Такой памятью служит система CRISPR-Cas, фиксирующая следы прошлых атак бактериофагов. Анализируя эти генетические «воспоминания», можно восстановить историю взаимодействий бактерии с фагами и понять, какие из них представляли для нее наибольшую угрозу. В этой статье мы расскажем о том, как по структуре CRISPR-Cas систем бактерии Clostridium botulinum можно реконструировать ее фаговое прошлое и почему это знание важно для развития более точных и безопасных подходов к фаготерапии в эпоху снижающейся эффективности антибиотиков.

Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Генетический код — это своего рода «язык», на котором записана информация о том, как устроены живые организмы. Почти у всех организмов этот язык устроен одинаково. В работе Escherichia coli with a 57-codon genetic code, опубликованной в журнале Science в 2025 году, о которой пойдет речь в этой статье, ученые показали, что этот язык можно существенно переписать. Генетический «язык» содержит много синонимов: одну и ту же аминокислоту могут кодировать разные кодоны. Авторы статьи задались вопросом: можно ли переписать геном так, чтобы часть этих синонимов исчезла? Для этого они создали бактерию Escherichia coli с полностью синтетическим геномом, в котором несколько кодонов были заменены синонимичными вариантами. В результате количество используемых кодонов сократилось с 64 до 57. Полученный организм назвали Syn57. С практической точки зрения такая перекодировка позволяет «освободить» часть кодонов и использовать их для задач биотехнологии и фармацевтики, например, для включения в белки новых, необычных аминокислот. Но не менее важно и фундаментальное значение этой работы: эксперимент показывает, что генетический код гораздо гибче, чем считалось раньше, и помогает лучше понять, как он мог возникнуть в ходе эволюции.