rezniknayezdnik317@gmail.com 0,0

Спецпроект «Биология в России: люди открытия» снова отправляется в Сибирь, только на этот раз в Институт цитологии и генетики СО РАН, — чтобы поговорить о 3D-геномике с руководителем Лаборатории генетики развития Нариманом Баттулиным. Как выяснилось, 3D-геномика богата на интересные детали и неожиданные повороты. Что такое «структурное эхо» митоза? Насколько сложно вывести генетическую линию «мышей-моржей», а главное, зачем это нужно? Нашли ли ученые ответ на загадку: зачем геному нужны ТАДы? Узнаем во время беседы. Приятного прочтения!

Предсказание пространственной структуры белка — задача, сформулированная еще Кристианом Анфинсеном, — на протяжении десятилетий решалась лишь косвенно. Ситуация радикально изменилась с появлением AlphaFold 1/2. Его успех был настолько значительным, что уже ознаменовался Нобелевской премией (в 2024 г.) и породил ощущение, что проблема в целом «закрыта». Однако история этим не закончилась: современная версия — AlphaFold 3 — объединяет эволюционный подход, унаследованный от предыдущих поколений, и диффузионные модели, пришедшие из генерации изображений. Такое сочетание позволяет выйти за пределы белковых структур и предсказывать целые «молекулярные сцены» с участием малых молекул или нуклеиновых кислот. Станет ли AlphaFold3 панацеей — или структуры белок-лигандных комплексов требуют новых подходов? Георгий Куракин, постоянный автор «Биомолекулы», пытается разобраться в этом вопросе с помощью Алексея Орлова, руководителя Лаборатории вычислительной биомедицины и молекулярной диагностики Центрального университета.

«Биология в России: люди и открытия» — это спецпроект, который рассказывает об успешных биологах, работающих в нашей стране. На этот раз мы отправляемся в Институт проблем экологии и эволюции имени А. Н. Северцова РАН, расположенный прямо напротив Нескучного сада в Москве. Там нас ждет беседа с доктором биологических наук Алексеем Тиуновым, который заведует лабораторией почвенной зоологии и общей энтомологии. Вместе с ним мы постараемся выяснить, каково это — быть почвенным зоологом, и ответы на какие вопросы ищет экология сегодня.

Следующее интервью спецпроекта «Биология в России: люди и открытия» мы взяли в Сибирском Федеральном Университете — сердце сибирской школы дендрохронологии, которая сегодня остается одним из мировых лидеров в области. Мы поговорили с академиком РАН Евгением Александровичем Вагановым, одним из создателей признанной во всем мире модели роста деревьев, опытным научным руководителем и первым ректором СФУ. Наш разговор получился разным: о детской мечте стать милиционером, о дипломном проекте, о десяти днях под проливным дождем в Якутии с американскими профессорами, не умеющими грести, о раскрытии тайн Тунгусского метеорита и о поддельных картинах. Получилась история о людях — сибирских ученых, которые, вопреки штормам девяностых, вывели нашу науку на мировой уровень и помогли обрести голос сибирскому лесу.

«Биомолекула» продолжает спецпроект «Биология в России: люди и открытия». Герой этого выпуска — Денис Александрович Бабков, доктор фармацевтических наук, проректор по научной деятельности Волгоградского государственного медицинского университета и директор Научного центра инновационных лекарственных средств с опытно-промышленным производством (НЦИЛС). В новом материале мы отправимся в Волгоград, чтобы узнать, как фундаментальные исследования превращаются в реальные препараты. Поговорим о том, почему для современной биофармации системное воспаление стало ключевой мишенью для борьбы со старением, диабетом 2 типа и нейродегенеративными заболеваниями. Обсудим перспективные противовоспалительные молекулы, трудности вывода российских препаратов на рынок и то, как в регионе можно выстроить полноценный фармацевтический кластер — от идеи до серьезных клинических испытаний. А еще — о том, какие качества отличают настоящих ученых и почему случайных людей в науке не бывает. Добро пожаловать в НЦИЛС!

Сегодня молекулярную динамику можно запускать на обычной рабочей станции — и это кажется само собой разумеющимся. Но еще сорок лет назад смоделировать один белок (даже пептид!) было выдающимся техническим достижением, доступным считанным лабораториям с доступом к машинам размером с комнату. В продолжении спецпроекта о Молекулярной динамике рассказываем, как она (МД) прошла этот путь: от специализированных силовых полей и параллельных суперкомпьютеров до графических процессоров, сделавших микросекундные расчеты рутиной. А искусственный интеллект — это конец этой истории или начало новой?

Первое интервью из серии «Биология в России: люди и открытия» мы записали в «НМИЦ Гематологии», где создан первый в России CAR-T-клеточный препарат против В-клеточных опухолей. Мы поговорили с руководителем управления биомедицинских технологий (и редактором «Биомолекулы») Аполлинарией Боголюбовой-Кузнецовой и ее сотрудниками. Наш разговор во многом был про людей: про тех, для кого этот препарат создан, про пациентов, и, конечно, про тех, кто его создает, про ученых.